RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392449.4

PTPRK-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 1,456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-208ENST00000392449 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa23.53■■□□□ 1.36
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PTPRK-208ENST00000392449 PROM2Q8N271 834 aa23.24■■□□□ 1.31
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PTPRK-208ENST00000392449 CASZ1Q86V15 1759 aa23.17■■□□□ 1.3
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PTPRK-208ENST00000392449 NBPF4Q96M43 638 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRK-208ENST00000392449 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.1■■□□□ 1.29
PTPRK-208ENST00000392449 ZBTB7AO95365 584 aa23.09■■□□□ 1.29
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PTPRK-208ENST00000392449 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa23.08■■□□□ 1.29
PTPRK-208ENST00000392449 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.08■■□□□ 1.29
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