RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362899.2

SNORD3E-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 3E, humanhuman

BASIC

Gene SNORD3E, Length 217 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD3E-201ENST00000362899 VEGFBP49765 207 aa6.47□□□□□ -1.37
SNORD3E-201ENST00000362899 C6orf118Q5T5N4 469 aa6.47□□□□□ -1.37
SNORD3E-201ENST00000362899 ZBTB33Q86T24 672 aa6.47□□□□□ -1.37
SNORD3E-201ENST00000362899 CCDC116Q8IYX3 515 aa6.47□□□□□ -1.37
SNORD3E-201ENST00000362899 MEIOBQ8N635 442 aa6.47□□□□□ -1.37
SNORD3E-201ENST00000362899 ADAM32Q8TC27 787 aa6.47□□□□□ -1.37
SNORD3E-201ENST00000362899 PTK2Q05397 1052 aa6.46□□□□□ -1.38
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SNORD3E-201ENST00000362899 SLC10A4Q96EP9 437 aa6.46□□□□□ -1.38
SNORD3E-201ENST00000362899 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
SNORD3E-201ENST00000362899 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
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SNORD3E-201ENST00000362899 SCARF1Q14162 830 aa6.45□□□□□ -1.38
SNORD3E-201ENST00000362899 TMEM259Q4ZIN3 620 aa6.45□□□□□ -1.38
SNORD3E-201ENST00000362899 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.45□□□□□ -1.38
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SNORD3E-201ENST00000362899 GPSM3Q9Y4H4 160 aa6.44□□□□□ -1.38
SNORD3E-201ENST00000362899 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa6.44□□□□□ -1.38
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SNORD3E-201ENST00000362899 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
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SNORD3E-201ENST00000362899 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa6.42□□□□□ -1.38
SNORD3E-201ENST00000362899 H3BM21 787 aa6.41□□□□□ -1.38
SNORD3E-201ENST00000362899 WIPF1O43516 503 aa6.41□□□□□ -1.38
SNORD3E-201ENST00000362899 Q6ZVU0 165 aa6.41□□□□□ -1.38
SNORD3E-201ENST00000362899 AGBL1Q96MI9 1066 aa6.41□□□□□ -1.38
SNORD3E-201ENST00000362899 SNRKQ9NRH2 765 aa6.41□□□□□ -1.38
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SNORD3E-201ENST00000362899 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
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SNORD3E-201ENST00000362899 MTMR14Q8NCE2 650 aa6.4□□□□□ -1.38
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SNORD3E-201ENST00000362899 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
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SNORD3E-201ENST00000362899 ESPNB1AK53 854 aa6.39□□□□□ -1.39
SNORD3E-201ENST00000362899 MAN1A2O60476 641 aa6.39□□□□□ -1.39
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SNORD3E-201ENST00000362899 ERVH48-1M5A8F1 160 aa6.38□□□□□ -1.39
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SNORD3E-201ENST00000362899 RELBQ01201 579 aa6.38□□□□□ -1.39
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SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
SNORD3E-201ENST00000362899 SLC16A10Q8TF71 515 aa6.38□□□□□ -1.39
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SNORD3E-201ENST00000362899 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa6.37□□□□□ -1.39
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SNORD3E-201ENST00000362899 IRF7Q92985 503 aa6.36□□□□□ -1.39
SNORD3E-201ENST00000362899 PPFIA3O75145 1194 aa6.35□□□□□ -1.39
SNORD3E-201ENST00000362899 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SNORD3E-201ENST00000362899 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
SNORD3E-201ENST00000362899 ADH1AP07327 375 aa6.34□□□□□ -1.39
SNORD3E-201ENST00000362899 NR1H3Q13133 447 aa6.34□□□□□ -1.39
SNORD3E-201ENST00000362899 CYLDQ9NQC7 956 aa6.34□□□□□ -1.39
SNORD3E-201ENST00000362899 SOCS7O14512 581 aa6.33□□□□□ -1.4
SNORD3E-201ENST00000362899 PTSQ03393 145 aa6.33□□□□□ -1.4
SNORD3E-201ENST00000362899 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa6.33□□□□□ -1.4
SNORD3E-201ENST00000362899 VSIG8P0DPA2 414 aa6.32□□□□□ -1.4
SNORD3E-201ENST00000362899 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SNORD3E-201ENST00000362899 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
SNORD3E-201ENST00000362899 SEPT12Q8IYM1 358 aa6.32□□□□□ -1.4
SNORD3E-201ENST00000362899 RNF217Q8TC41 542 aa6.32□□□□□ -1.4
SNORD3E-201ENST00000362899 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa6.32□□□□□ -1.4
SNORD3E-201ENST00000362899 PTGIRP43119 386 aa6.31□□□□□ -1.4
SNORD3E-201ENST00000362899 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SNORD3E-201ENST00000362899 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SNORD3E-201ENST00000362899 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SNORD3E-201ENST00000362899 SCTRP47872 440 aa6.3□□□□□ -1.4
SNORD3E-201ENST00000362899 IRF5Q13568 498 aa6.3□□□□□ -1.4
SNORD3E-201ENST00000362899 SLC35F4A4IF30 521 aa6.29□□□□□ -1.4
SNORD3E-201ENST00000362899 CCDC155Q8N6L0 562 aa6.29□□□□□ -1.4
SNORD3E-201ENST00000362899 STK17AQ9UEE5 414 aa6.29□□□□□ -1.4
SNORD3E-201ENST00000362899 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa6.28□□□□□ -1.4
SNORD3E-201ENST00000362899 ERVK-9P63128 1117 aa6.28□□□□□ -1.4
SNORD3E-201ENST00000362899 KRT76Q01546 638 aa6.28□□□□□ -1.4
SNORD3E-201ENST00000362899 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa6.27□□□□□ -1.41
SNORD3E-201ENST00000362899 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SNORD3E-201ENST00000362899 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa6.27□□□□□ -1.41
SNORD3E-201ENST00000362899 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa6.26□□□□□ -1.41
SNORD3E-201ENST00000362899 APBB1O00213 710 aa6.26□□□□□ -1.41
SNORD3E-201ENST00000362899 TSGA10IPQ3SY00 556 aa6.26□□□□□ -1.41
SNORD3E-201ENST00000362899 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa6.26□□□□□ -1.41
SNORD3E-201ENST00000362899 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
SNORD3E-201ENST00000362899 OSBPL3Q9H4L5 887 aa6.26□□□□□ -1.41
SNORD3E-201ENST00000362899 GDPD2Q9HCC8 539 aa6.26□□□□□ -1.41
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