RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-170P-201ENST00000362832 OIP5O43482 229 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-170P-201ENST00000362832 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-170P-201ENST00000362832 GRIN2CQ14957 1233 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-170P-201ENST00000362832 AGERQ15109 404 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-170P-201ENST00000362832 Q6ZVU0 165 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-170P-201ENST00000362832 CD163Q86VB7 1156 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCDC116Q8IYX3 515 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-170P-201ENST00000362832 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-170P-201ENST00000362832 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPR25O00155 361 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-170P-201ENST00000362832 CTHP32929 405 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-170P-201ENST00000362832 CBLBQ13191 982 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-170P-201ENST00000362832 C4orf48Q5BLP8 95 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-170P-201ENST00000362832 FOXR1Q6PIV2 292 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.47□□□□□ -1.85
RNU6-170P-201ENST00000362832 CHRNA4P43681 627 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 RNF217Q8TC41 542 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 GMCL1Q96IK5 515 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 RRAGCQ9HB90 399 aa3.46□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 GPR37O15354 613 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 FDX1P10109 184 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 KCNV2Q8TDN2 545 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 SUV39H2Q9H5I1 410 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 PCDHGC3Q9UN70 934 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa3.45□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 SHISA8B8ZZ34 492 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 MX2P20592 715 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 DESI1Q6ICB0 168 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 NUTM1Q86Y26 1132 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRIM22Q8IYM9 498 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRR7Q8TB68 274 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 PIK3R2O00459 728 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 SEMA3EO15041 775 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 RELBQ01201 579 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 LINC00114Q6XXX2 140 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 AGBL1Q96MI9 1066 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRERF1Q96PN7 1200 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 GATA4P43694 442 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAP2K3P46734 347 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 DBN1Q16643 649 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 GNB5O14775 395 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 TXKP42681 527 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 NKAPLQ5M9Q1 402 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 MCTP1Q6DN14 999 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 LYPD8Q6UX82 237 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAP10Q9P2G4 905 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPDYE5A6NIY4 337 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 H7C1W4 665 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 PAX4O43316 350 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 F12P00748 615 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 MTMR2Q13614 643 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 LRP8Q14114 963 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 EDARADDQ8WWZ3 215 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 DYRK3O43781 588 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 AMPD1P23109 780 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 FZD5Q13467 585 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 LAMC2Q13753 1193 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 RHOQP17081 205 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRSS36Q5K4E3 855 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 NDUFV2P19404 249 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 SMYD5Q6GMV2 418 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 ARMC2Q8NEN0 867 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 KLRG1Q96E93 195 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 CFAP44Q96MT7 982 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 TPSG1Q9NRR2 321 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 NBPF14Q5TI25 921 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-170P-201ENST00000362832 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1121.9 ms