RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 NINLQ9Y2I6 1382 aa10.79□□□□□ -0.68
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SGMS1-201ENST00000361543 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa10.79□□□□□ -0.68
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC37A3O60309 1634 aa10.79□□□□□ -0.68
SGMS1-201ENST00000361543 EVA1CP58658 441 aa10.78□□□□□ -0.68
SGMS1-201ENST00000361543 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC125Q86Z20 511 aa10.78□□□□□ -0.68
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SGMS1-201ENST00000361543 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa10.77□□□□□ -0.69
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SGMS1-201ENST00000361543 CAMKK2Q96RR4 588 aa10.61□□□□□ -0.71
SGMS1-201ENST00000361543 KAT6BQ8WYB5 2073 aa10.61□□□□□ -0.71
SGMS1-201ENST00000361543 CGNL1Q0VF96 1302 aa10.6□□□□□ -0.71
SGMS1-201ENST00000361543 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
SGMS1-201ENST00000361543 FLT4P35916 1363 aa10.6□□□□□ -0.71
SGMS1-201ENST00000361543 KIF24Q5T7B8 1368 aa10.6□□□□□ -0.71
SGMS1-201ENST00000361543 MEGF6O75095 1541 aa10.59□□□□□ -0.71
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