RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP29.12■■■□□ 2.25
HOXA4-201ENST00000360046 RTL1A6NKG5 1358 aa29.12■■■□□ 2.25
HOXA4-201ENST00000360046 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
HOXA4-201ENST00000360046 HOXC9P31274 260 aa29.11■■■□□ 2.25
HOXA4-201ENST00000360046 IL13P35225 146 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXA4-201ENST00000360046 ABCA3Q99758 1704 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXA4-201ENST00000360046 ARHGEF25Q86VW2 580 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXA4-201ENST00000360046 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
HOXA4-201ENST00000360046 CCDC146Q8IYE0 955 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXA4-201ENST00000360046 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXA4-201ENST00000360046 HSPA1LP34931 641 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXA4-201ENST00000360046 IP6K1Q92551 441 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXA4-201ENST00000360046 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
HOXA4-201ENST00000360046 KIAA0232Q92628 1395 aa29.02■■■□□ 2.24
HOXA4-201ENST00000360046 CHRNA2Q15822 529 aa29.01■■■□□ 2.23
HOXA4-201ENST00000360046 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
HOXA4-201ENST00000360046 PRDM11Q9NQV5 511 aa29■■■□□ 2.23
HOXA4-201ENST00000360046 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
HOXA4-201ENST00000360046 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
HOXA4-201ENST00000360046 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
HOXA4-201ENST00000360046 RGPD1P0DJD0 1748 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXA4-201ENST00000360046 CPDO75976 1380 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXA4-201ENST00000360046 JCADQ9P266 1359 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXA4-201ENST00000360046 HMOX1P09601 288 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXA4-201ENST00000360046 RGPD5Q99666 1765 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXA4-201ENST00000360046 RUNDC1Q96C34 613 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXA4-201ENST00000360046 ZBED9Q6R2W3 1325 aa28.97■■■□□ 2.23
HOXA4-201ENST00000360046 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
HOXA4-201ENST00000360046 AXIN2Q9Y2T1 843 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXA4-201ENST00000360046 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
HOXA4-201ENST00000360046 COL18A1P39060 1754 aa28.96■■■□□ 2.23
HOXA4-201ENST00000360046 FCHSD2O94868 740 aa28.95■■■□□ 2.23
HOXA4-201ENST00000360046 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
HOXA4-201ENST00000360046 ABCC6O95255 1503 aa28.95■■■□□ 2.23
HOXA4-201ENST00000360046 APAF1O14727 1248 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXA4-201ENST00000360046 ADAMTS2O95450 1211 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXA4-201ENST00000360046 RSPH6AQ9H0K4 717 aa28.94■■■□□ 2.22
HOXA4-201ENST00000360046 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa28.93■■■□□ 2.22
HOXA4-201ENST00000360046 SULT6B1Q6IMI4 303 aa28.93■■■□□ 2.22
HOXA4-201ENST00000360046 EYA1Q99502 592 aa28.93■■■□□ 2.22
HOXA4-201ENST00000360046 PRKAR2BP31323 418 aa28.92■■■□□ 2.22
HOXA4-201ENST00000360046 ANKRD24Q8TF21 1146 aa28.92■■■□□ 2.22
HOXA4-201ENST00000360046 PLEKHF1Q96S99 279 aa28.91■■■□□ 2.22
HOXA4-201ENST00000360046 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.91■■■□□ 2.22
HOXA4-201ENST00000360046 FAM83GA6ND36 823 aa28.91■■■□□ 2.22
HOXA4-201ENST00000360046 AEBP1Q8IUX7 1158 aa28.91■■■□□ 2.22
HOXA4-201ENST00000360046 NEFMP07197 916 aa28.9■■■□□ 2.22
HOXA4-201ENST00000360046 RGPD2P0DJD1 1756 aa28.9■■■□□ 2.22
HOXA4-201ENST00000360046 TCP11L2Q8N4U5 519 aa28.89■■■□□ 2.21
HOXA4-201ENST00000360046 ERBB3P21860 1342 aa28.88■■■□□ 2.21
HOXA4-201ENST00000360046 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa28.87■■■□□ 2.21
HOXA4-201ENST00000360046 LMO7Q8WWI1 1683 aa28.87■■■□□ 2.21
HOXA4-201ENST00000360046 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa28.86■■■□□ 2.21
HOXA4-201ENST00000360046 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
HOXA4-201ENST00000360046 NEUROD2Q15784 382 aa28.85■■■□□ 2.21
HOXA4-201ENST00000360046 NBPF6Q5VWK0 638 aa28.85■■■□□ 2.21
HOXA4-201ENST00000360046 USHBP1Q8N6Y0 703 aa28.85■■■□□ 2.21
HOXA4-201ENST00000360046 NBPF4Q96M43 638 aa28.85■■■□□ 2.21
HOXA4-201ENST00000360046 KDRP35968 1356 aa28.85■■■□□ 2.21
HOXA4-201ENST00000360046 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
HOXA4-201ENST00000360046 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa28.83■■■□□ 2.21
HOXA4-201ENST00000360046 EVA1CP58658 441 aa28.83■■■□□ 2.21
HOXA4-201ENST00000360046 BTG4Q9NY30 223 aa28.83■■■□□ 2.21
HOXA4-201ENST00000360046 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
HOXA4-201ENST00000360046 PHACTR3Q96KR7 559 aa28.82■■■□□ 2.2
HOXA4-201ENST00000360046 STRN4Q9NRL3 753 aa28.82■■■□□ 2.2
HOXA4-201ENST00000360046 NGEFQ8N5V2 710 aa28.8■■■□□ 2.2
HOXA4-201ENST00000360046 NLRP2Q9NX02 1062 aa28.8■■■□□ 2.2
HOXA4-201ENST00000360046 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
HOXA4-201ENST00000360046 TMPOP42166 694 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
HOXA4-201ENST00000360046 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
HOXA4-201ENST00000360046 C8orf37Q96NL8 207 aa28.77■■■□□ 2.2
HOXA4-201ENST00000360046 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa28.76■■■□□ 2.19
HOXA4-201ENST00000360046 NCAPD2Q15021 1401 aa28.75■■■□□ 2.19
HOXA4-201ENST00000360046 NFE2L2Q16236 605 aa28.75■■■□□ 2.19
HOXA4-201ENST00000360046 NGLY1Q96IV0 654 aa28.75■■■□□ 2.19
HOXA4-201ENST00000360046 WDR17Q8IZU2 1322 aa28.75■■■□□ 2.19
HOXA4-201ENST00000360046 RIPK4P57078 832 aa28.74■■■□□ 2.19
HOXA4-201ENST00000360046 PLCH1Q4KWH8 1693 aa28.74■■■□□ 2.19
HOXA4-201ENST00000360046 LRP6O75581 1613 aa28.74■■■□□ 2.19
HOXA4-201ENST00000360046 DLG5Q8TDM6 1919 aa28.73■■■□□ 2.19
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF521Q96K83 1311 aa28.73■■■□□ 2.19
HOXA4-201ENST00000360046 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
HOXA4-201ENST00000360046 WWC1Q8IX03 1113 aa28.72■■■□□ 2.19
HOXA4-201ENST00000360046 CCDC27Q2M243 656 aa28.72■■■□□ 2.19
HOXA4-201ENST00000360046 PDE3BQ13370 1112 aa28.71■■■□□ 2.19
HOXA4-201ENST00000360046 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
HOXA4-201ENST00000360046 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
HOXA4-201ENST00000360046 GOLGA2Q08379 1002 aa28.68■■■□□ 2.18
HOXA4-201ENST00000360046 CDCA7LQ96GN5 454 aa28.68■■■□□ 2.18
HOXA4-201ENST00000360046 TRIM35Q9UPQ4 493 aa28.68■■■□□ 2.18
HOXA4-201ENST00000360046 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
HOXA4-201ENST00000360046 USP35Q9P2H5 1018 aa28.67■■■□□ 2.18
HOXA4-201ENST00000360046 GAS2L2Q8NHY3 880 aa28.66■■■□□ 2.18
HOXA4-201ENST00000360046 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa28.66■■■□□ 2.18
HOXA4-201ENST00000360046 CARD10Q9BWT7 1032 aa28.66■■■□□ 2.18
HOXA4-201ENST00000360046 SLIT2O94813 1529 aa28.65■■■□□ 2.18
HOXA4-201ENST00000360046 CRB1P82279 1406 aa28.64■■■□□ 2.18
HOXA4-201ENST00000360046 LMOD3Q0VAK6 560 aa28.64■■■□□ 2.18
HOXA4-201ENST00000360046 NWD2Q9ULI1 1742 aa28.64■■■□□ 2.17
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