RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 WIZO95785 1651 aa9.01□□□□□ -0.97
CCL20-201ENST00000358813 WNT7AO00755 349 aa9.01□□□□□ -0.97
CCL20-201ENST00000358813 ABL2P42684 1182 aa9.01□□□□□ -0.97
CCL20-201ENST00000358813 AGERQ15109 404 aa9.01□□□□□ -0.97
CCL20-201ENST00000358813 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
CCL20-201ENST00000358813 PKD2L1Q9P0L9 805 aa9.01□□□□□ -0.97
CCL20-201ENST00000358813 ARHGEF11O15085 1522 aa9□□□□□ -0.97
CCL20-201ENST00000358813 GDF9O60383 454 aa9□□□□□ -0.97
CCL20-201ENST00000358813 GFRA3O60609 400 aa9□□□□□ -0.97
CCL20-201ENST00000358813 TRIM67Q6ZTA4 783 aa9□□□□□ -0.97
CCL20-201ENST00000358813 EHBP1Q8NDI1 1231 aa9□□□□□ -0.97
CCL20-201ENST00000358813 GLMNQ92990 594 aa9□□□□□ -0.97
CCL20-201ENST00000358813 TRIM34Q9BYJ4 488 aa9□□□□□ -0.97
CCL20-201ENST00000358813 MTMR7Q9Y216 660 aa9□□□□□ -0.97
CCL20-201ENST00000358813 CFTRP13569 1480 aa9□□□□□ -0.97
CCL20-201ENST00000358813 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP8.99□□□□□ -0.97
CCL20-201ENST00000358813 FOXJ1Q92949 421 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL20-201ENST00000358813 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CCL20-201ENST00000358813 MRGPRX2Q96LB1 330 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL20-201ENST00000358813 IFT140Q96RY7 1462 aa8.99□□□□□ -0.97
CCL20-201ENST00000358813 PRR20EP86478 221 aa8.98□□□□□ -0.97
CCL20-201ENST00000358813 PRR20CP86479 221 aa8.98□□□□□ -0.97
CCL20-201ENST00000358813 PRR20DP86480 221 aa8.98□□□□□ -0.97
CCL20-201ENST00000358813 PRR20BP86481 221 aa8.98□□□□□ -0.97
CCL20-201ENST00000358813 PRR20AP86496 221 aa8.98□□□□□ -0.97
CCL20-201ENST00000358813 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CCL20-201ENST00000358813 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CCL20-201ENST00000358813 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CCL20-201ENST00000358813 CYP4X1Q8N118 509 aa8.97□□□□□ -0.97
CCL20-201ENST00000358813 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 KCNA1Q09470 495 aa8.96□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 LAPTM4AQ15012 233 aa8.96□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 PDXDC2PQ6P474 469 aa8.96□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 PBXIP1Q96AQ6 731 aa8.96□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa8.96□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa8.95□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 POM121CA8CG34 1229 aa8.95□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa8.95□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa8.95□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa8.95□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 USTQ9Y2C2 406 aa8.95□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 BRD1O95696 1058 aa8.94□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 PTK2Q05397 1052 aa8.94□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 CARD14Q9BXL6 1004 aa8.94□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa8.93□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.93□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa8.93□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 FAM174AQ8TBP5 190 aa8.93□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 TOR4AQ9NXH8 423 aa8.93□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 ABCC8Q09428 1581 aa8.92□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 SIAH2O43255 324 aa8.92□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 WASHC4Q2M389 1173 aa8.92□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 ZBTB33Q86T24 672 aa8.92□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 GPSM3Q9Y4H4 160 aa8.92□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 FAM187AA6NFU0 413 aa8.91□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 ALDH1A1P00352 501 aa8.91□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa8.91□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 RBM25P49756 843 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 ARID5BQ14865 1188 aa8.9□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 PKDCCQ504Y2 493 aa8.9□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 TLL2Q9Y6L7 1015 aa8.9□□□□□ -0.98
CCL20-201ENST00000358813 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
CCL20-201ENST00000358813 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CCL20-201ENST00000358813 ZBBXA8MT70 800 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL20-201ENST00000358813 J3QL48 77 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL20-201ENST00000358813 PRDM2Q13029 1718 aa8.88□□□□□ -0.99
CCL20-201ENST00000358813 ERFEQ4G0M1 354 aa8.88□□□□□ -0.99
CCL20-201ENST00000358813 Q6ZNB5 142 aa8.88□□□□□ -0.99
CCL20-201ENST00000358813 ADAM32Q8TC27 787 aa8.88□□□□□ -0.99
CCL20-201ENST00000358813 OCSTAMPQ9BR26 566 aa8.88□□□□□ -0.99
CCL20-201ENST00000358813 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa8.88□□□□□ -0.99
CCL20-201ENST00000358813 WASF2Q9Y6W5 498 aa8.88□□□□□ -0.99
CCL20-201ENST00000358813 TOPBP1Q92547 1522 aa8.88□□□□□ -0.99
CCL20-201ENST00000358813 GPR37L1O60883 481 aa8.87□□□□□ -0.99
CCL20-201ENST00000358813 DGAT1O75907 488 aa8.87□□□□□ -0.99
CCL20-201ENST00000358813 FBXO45P0C2W1 286 aa8.87□□□□□ -0.99
CCL20-201ENST00000358813 SMPD1P17405 629 aa8.87□□□□□ -0.99
CCL20-201ENST00000358813 RFX1P22670 979 aa8.87□□□□□ -0.99
CCL20-201ENST00000358813 MPNDQ8N594 471 aa8.87□□□□□ -0.99
CCL20-201ENST00000358813 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
CCL20-201ENST00000358813 SLC10A4Q96EP9 437 aa8.87□□□□□ -0.99
CCL20-201ENST00000358813 ARAP1Q96P48 1450 aa8.86□□□□□ -0.99
CCL20-201ENST00000358813 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
CCL20-201ENST00000358813 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
CCL20-201ENST00000358813 CDK15Q96Q40 435 aa8.86□□□□□ -0.99
CCL20-201ENST00000358813 CHD1O14646 1710 aa8.85□□□□□ -0.99
CCL20-201ENST00000358813 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CCL20-201ENST00000358813 E9PSI1 815 aa8.85□□□□□ -0.99
CCL20-201ENST00000358813 NR1H3Q13133 447 aa8.85□□□□□ -0.99
CCL20-201ENST00000358813 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
CCL20-201ENST00000358813 DNMBPQ6XZF7 1577 aa8.85□□□□□ -0.99
CCL20-201ENST00000358813 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP8.84□□□□□ -0.992e-6■■■□□ 18.1
CCL20-201ENST00000358813 ADH1CP00326 375 aa8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms