RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 MYL6BP14649 208 aa24.95■■□□□ 1.58
NISCH-201ENST00000345716 SIL1Q9H173 461 aa24.95■■□□□ 1.58
NISCH-201ENST00000345716 TPM3P06753 285 aa24.94■■□□□ 1.58
NISCH-201ENST00000345716 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa24.94■■□□□ 1.58
NISCH-201ENST00000345716 SASS6Q6UVJ0 657 aa24.94■■□□□ 1.58
NISCH-201ENST00000345716 FAM177BA6PVY3 158 aa24.93■■□□□ 1.58
NISCH-201ENST00000345716 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
NISCH-201ENST00000345716 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.93■■□□□ 1.58
NISCH-201ENST00000345716 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.93■■□□□ 1.58
NISCH-201ENST00000345716 NSD2O96028 1365 aa24.93■■□□□ 1.58
NISCH-201ENST00000345716 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.93■■□□□ 1.58
NISCH-201ENST00000345716 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
NISCH-201ENST00000345716 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
NISCH-201ENST00000345716 CCDC27Q2M243 656 aa24.92■■□□□ 1.58
NISCH-201ENST00000345716 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
NISCH-201ENST00000345716 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
NISCH-201ENST00000345716 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.92■■□□□ 1.58
NISCH-201ENST00000345716 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
NISCH-201ENST00000345716 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.91■■□□□ 1.58
NISCH-201ENST00000345716 KIAA0556O60303 1618 aa24.91■■□□□ 1.58
NISCH-201ENST00000345716 ADAMTS12P58397 1594 aa24.91■■□□□ 1.58
NISCH-201ENST00000345716 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP24.91■■□□□ 1.58
NISCH-201ENST00000345716 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
NISCH-201ENST00000345716 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.9■■□□□ 1.58
NISCH-201ENST00000345716 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa24.9■■□□□ 1.58
NISCH-201ENST00000345716 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.9■■□□□ 1.58
NISCH-201ENST00000345716 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.9■■□□□ 1.58
NISCH-201ENST00000345716 WDR62O43379 1518 aa24.9■■□□□ 1.58
NISCH-201ENST00000345716 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
NISCH-201ENST00000345716 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
NISCH-201ENST00000345716 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.89■■□□□ 1.58
NISCH-201ENST00000345716 RAD21O60216 631 aa24.89■■□□□ 1.58
NISCH-201ENST00000345716 NASPP49321 788 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
NISCH-201ENST00000345716 MBD3O95983 291 aa24.89■■□□□ 1.57
NISCH-201ENST00000345716 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.88■■□□□ 1.57
NISCH-201ENST00000345716 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
NISCH-201ENST00000345716 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
NISCH-201ENST00000345716 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
NISCH-201ENST00000345716 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
NISCH-201ENST00000345716 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa24.88■■□□□ 1.57
NISCH-201ENST00000345716 RNF214Q8ND24 703 aa24.87■■□□□ 1.57
NISCH-201ENST00000345716 FBXW7Q969H0 707 aa24.87■■□□□ 1.57
NISCH-201ENST00000345716 FYB1O15117 783 aa24.87■■□□□ 1.57
NISCH-201ENST00000345716 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
NISCH-201ENST00000345716 TPM1P09493 284 aa24.87■■□□□ 1.57
NISCH-201ENST00000345716 PDCP20941 246 aa24.87■■□□□ 1.57
NISCH-201ENST00000345716 AACSQ86V21 672 aa24.86■■□□□ 1.57
NISCH-201ENST00000345716 CCDC158Q5M9N0 1113 aa24.86■■□□□ 1.57
NISCH-201ENST00000345716 TRIM34Q9BYJ4 488 aa24.86■■□□□ 1.57
NISCH-201ENST00000345716 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa24.86■■□□□ 1.57
NISCH-201ENST00000345716 CNNM1Q9NRU3 951 aa24.85■■□□□ 1.57
NISCH-201ENST00000345716 NUP160Q12769 1436 aa24.85■■□□□ 1.57
NISCH-201ENST00000345716 TRIM27P14373 513 aa24.85■■□□□ 1.57
NISCH-201ENST00000345716 TTC39AQ5SRH9 613 aa24.84■■□□□ 1.57
NISCH-201ENST00000345716 ASXL2Q76L83 1435 aa24.84■■□□□ 1.57
NISCH-201ENST00000345716 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.83■■□□□ 1.57
NISCH-201ENST00000345716 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
NISCH-201ENST00000345716 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.83■■□□□ 1.57
NISCH-201ENST00000345716 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
NISCH-201ENST00000345716 PHF8Q9UPP1 1060 aa24.83■■□□□ 1.57
NISCH-201ENST00000345716 ZNF592Q92610 1267 aa24.82■■□□□ 1.56
NISCH-201ENST00000345716 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.82■■□□□ 1.56
NISCH-201ENST00000345716 FIBPO43427 364 aa24.82■■□□□ 1.56
NISCH-201ENST00000345716 TPM2P07951 284 aa24.82■■□□□ 1.56
NISCH-201ENST00000345716 SDF4Q9BRK5 362 aa24.8■■□□□ 1.56
NISCH-201ENST00000345716 A2MP01023 1474 aa24.8■■□□□ 1.56
NISCH-201ENST00000345716 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.8■■□□□ 1.56
NISCH-201ENST00000345716 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
NISCH-201ENST00000345716 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
NISCH-201ENST00000345716 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
NISCH-201ENST00000345716 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
NISCH-201ENST00000345716 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.79■■□□□ 1.56
NISCH-201ENST00000345716 SART3Q15020 963 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
NISCH-201ENST00000345716 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa24.79■■□□□ 1.56
NISCH-201ENST00000345716 F6X3S4 739 aa24.79■■□□□ 1.56
NISCH-201ENST00000345716 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.78■■□□□ 1.56
NISCH-201ENST00000345716 KDM4AO75164 1064 aa24.78■■□□□ 1.56
NISCH-201ENST00000345716 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.78■■□□□ 1.56
NISCH-201ENST00000345716 CCDC57Q2TAC2 916 aa24.78■■□□□ 1.56
NISCH-201ENST00000345716 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
NISCH-201ENST00000345716 TESK2Q96S53 571 aa24.77■■□□□ 1.56
NISCH-201ENST00000345716 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
NISCH-201ENST00000345716 FOXO3O43524 673 aa24.77■■□□□ 1.56
NISCH-201ENST00000345716 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
NISCH-201ENST00000345716 ANKRD1Q15327 319 aa24.77■■□□□ 1.56
NISCH-201ENST00000345716 FBLN1P23142 703 aa24.76■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 MX1P20591 662 aa24.76■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP24.76■■□□□ 1.556e-7■■■□□ 17.6
NISCH-201ENST00000345716 STK3Q13188 491 aa24.76■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 KIF1BPQ96EK5 621 aa24.76■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 XBP1P17861 261 aa24.75■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.75■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.75■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.75■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 ACEP12821 1306 aa24.74■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 MCM4P33991 863 aa24.74■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 TSPY26PQ9H489 355 aa24.74■■□□□ 1.55
NISCH-201ENST00000345716 IL16Q14005 1332 aa24.74■■□□□ 1.55
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