RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
UBP1-201ENST00000283628 SLIT1O75093 1534 aa35.31■■■■□ 3.24
UBP1-201ENST00000283628 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.31■■■■□ 3.24
UBP1-201ENST00000283628 NUCB1Q02818 461 aa35.3■■■■□ 3.24
UBP1-201ENST00000283628 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.3■■■■□ 3.24
UBP1-201ENST00000283628 LTKP29376 864 aa35.29■■■■□ 3.24
UBP1-201ENST00000283628 ARHGAP45Q92619 1136 aa35.29■■■■□ 3.24
UBP1-201ENST00000283628 AATKQ6ZMQ8 1374 aa35.29■■■■□ 3.24
UBP1-201ENST00000283628 PIK3R4Q99570 1358 aa35.28■■■■□ 3.24
UBP1-201ENST00000283628 WASLO00401 505 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
UBP1-201ENST00000283628 PTCH1Q13635 1447 aa35.27■■■■□ 3.24
UBP1-201ENST00000283628 IFT57Q9NWB7 429 aa35.26■■■■□ 3.24
UBP1-201ENST00000283628 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.23
UBP1-201ENST00000283628 GNAI1P63096 354 aa35.26■■■■□ 3.23
UBP1-201ENST00000283628 BRPF3Q9ULD4 1205 aa35.26■■■■□ 3.23
UBP1-201ENST00000283628 IL13P35225 146 aa35.24■■■■□ 3.23
UBP1-201ENST00000283628 PHACTR3Q96KR7 559 aa35.24■■■■□ 3.23
UBP1-201ENST00000283628 MON2Q7Z3U7 1717 aa35.24■■■■□ 3.23
UBP1-201ENST00000283628 VAMP4O75379 141 aa35.23■■■■□ 3.23
UBP1-201ENST00000283628 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
UBP1-201ENST00000283628 HMOX1P09601 288 aa35.21■■■■□ 3.23
UBP1-201ENST00000283628 LMOD3Q0VAK6 560 aa35.21■■■■□ 3.23
UBP1-201ENST00000283628 CHD1LQ86WJ1 897 aa35.21■■■■□ 3.23
UBP1-201ENST00000283628 ZNF853P0CG23 659 aa35.2■■■■□ 3.23
UBP1-201ENST00000283628 EID1Q9Y6B2 187 aa35.2■■■■□ 3.23
UBP1-201ENST00000283628 ROBO2Q9HCK4 1378 aa35.2■■■■□ 3.23
UBP1-201ENST00000283628 FBLN1P23142 703 aa35.2■■■■□ 3.22
UBP1-201ENST00000283628 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa35.2■■■■□ 3.22
UBP1-201ENST00000283628 GCC1Q96CN9 775 aa35.19■■■■□ 3.22
UBP1-201ENST00000283628 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP35.18■■■■□ 3.22
UBP1-201ENST00000283628 AKAP12Q02952 1782 aa35.17■■■■□ 3.22
UBP1-201ENST00000283628 DLG5Q8TDM6 1919 aa35.17■■■■□ 3.22
UBP1-201ENST00000283628 NME9Q86XW9 330 aa35.16■■■■□ 3.22
UBP1-201ENST00000283628 RBM25P49756 843 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
UBP1-201ENST00000283628 ITSN1Q15811 1721 aa35.14■■■■□ 3.22
UBP1-201ENST00000283628 BMP2KLQ5H9B9 411 aa35.14■■■■□ 3.22
UBP1-201ENST00000283628 LNPKQ9C0E8 428 aa35.14■■■■□ 3.22
UBP1-201ENST00000283628 ABCC4O15439 1325 aa35.14■■■■□ 3.22
UBP1-201ENST00000283628 COG3Q96JB2 828 aa35.13■■■■□ 3.22
UBP1-201ENST00000283628 MBIPQ9NS73 344 aa35.13■■■■□ 3.22
UBP1-201ENST00000283628 CHMP5Q9NZZ3 219 aa35.13■■■■□ 3.22
UBP1-201ENST00000283628 PTPRUQ92729 1446 aa35.13■■■■□ 3.21
UBP1-201ENST00000283628 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP35.13■■■■□ 3.21
UBP1-201ENST00000283628 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.13■■■■□ 3.21
UBP1-201ENST00000283628 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
UBP1-201ENST00000283628 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
UBP1-201ENST00000283628 CFAP44Q96MT7 982 aa35.12■■■■□ 3.21
UBP1-201ENST00000283628 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
UBP1-201ENST00000283628 PLPPR3Q6T4P5 718 aa35.12■■■■□ 3.21
UBP1-201ENST00000283628 HSCBQ8IWL3 235 aa35.11■■■■□ 3.21
UBP1-201ENST00000283628 TSPYL6Q8N831 410 aa35.11■■■■□ 3.21
UBP1-201ENST00000283628 CCDC61Q9Y6R9 512 aa35.11■■■■□ 3.21
UBP1-201ENST00000283628 DIP2AQ14689 1571 aa35.11■■■■□ 3.21
UBP1-201ENST00000283628 NRKQ7Z2Y5 1582 aa35.09■■■■□ 3.21
UBP1-201ENST00000283628 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
UBP1-201ENST00000283628 TBX22Q9Y458 520 aa35.09■■■■□ 3.21
UBP1-201ENST00000283628 KIF24Q5T7B8 1368 aa35.08■■■■□ 3.21
UBP1-201ENST00000283628 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.2
UBP1-201ENST00000283628 SNX21Q969T3 373 aa35.07■■■■□ 3.2
UBP1-201ENST00000283628 SLC26A8Q96RN1 970 aa35.07■■■■□ 3.2
UBP1-201ENST00000283628 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.2
UBP1-201ENST00000283628 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.2
UBP1-201ENST00000283628 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa35.06■■■■□ 3.2
UBP1-201ENST00000283628 MCM4P33991 863 aa35.05■■■■□ 3.2
UBP1-201ENST00000283628 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
UBP1-201ENST00000283628 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP35.05■■■■□ 3.2
UBP1-201ENST00000283628 PRR36Q9H6K5 1346 aa35.04■■■■□ 3.2
UBP1-201ENST00000283628 ANKRD45Q5TZF3 282 aa35.04■■■■□ 3.2
UBP1-201ENST00000283628 ZRANB1Q9UGI0 708 aa35.04■■■■□ 3.2
UBP1-201ENST00000283628 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa35.03■■■■□ 3.2
UBP1-201ENST00000283628 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa35.02■■■■□ 3.2
UBP1-201ENST00000283628 C8orf58Q8NAV2 365 aa35■■■■□ 3.19
UBP1-201ENST00000283628 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35■■■■□ 3.19
UBP1-201ENST00000283628 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP34.99■■■■□ 3.19
UBP1-201ENST00000283628 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP34.98■■■■□ 3.19
UBP1-201ENST00000283628 SIRT2Q8IXJ6 389 aa34.98■■■■□ 3.19
UBP1-201ENST00000283628 C1orf115Q9H7X2 142 aa34.98■■■■□ 3.19
UBP1-201ENST00000283628 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP34.97■■■■□ 3.19
UBP1-201ENST00000283628 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa34.97■■■■□ 3.19
UBP1-201ENST00000283628 ADAMTSL3P82987 1691 aa34.97■■■■□ 3.19
UBP1-201ENST00000283628 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
UBP1-201ENST00000283628 DDIT3P35638 169 aa34.95■■■■□ 3.19
UBP1-201ENST00000283628 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP34.94■■■■□ 3.18
UBP1-201ENST00000283628 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP34.92■■■■□ 3.18
UBP1-201ENST00000283628 FAM83GA6ND36 823 aa34.91■■■■□ 3.18
UBP1-201ENST00000283628 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP34.91■■■■□ 3.18
UBP1-201ENST00000283628 PLEKHG3A1L390 1219 aa34.9■■■■□ 3.18
UBP1-201ENST00000283628 DDX11L8A8MPP1 907 aa34.9■■■■□ 3.18
UBP1-201ENST00000283628 FAM43AQ8N2R8 423 aa34.9■■■■□ 3.18
UBP1-201ENST00000283628 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa34.9■■■■□ 3.18
UBP1-201ENST00000283628 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP34.89■■■■□ 3.18
UBP1-201ENST00000283628 NALCNQ8IZF0 1738 aa34.88■■■■□ 3.17
UBP1-201ENST00000283628 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa34.87■■■■□ 3.17
UBP1-201ENST00000283628 OVOS2Q6IE36 1432 aa34.87■■■■□ 3.17
UBP1-201ENST00000283628 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP34.87■■■■□ 3.17
UBP1-201ENST00000283628 KIF2CQ99661 725 aa34.87■■■■□ 3.17
UBP1-201ENST00000283628 KIAA0232Q92628 1395 aa34.86■■■■□ 3.17
UBP1-201ENST00000283628 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa34.86■■■■□ 3.17
UBP1-201ENST00000283628 CDC45O75419 566 aa34.85■■■■□ 3.17
UBP1-201ENST00000283628 DCTN1Q14203 1278 aa34.85■■■■□ 3.17
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