RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249440.4

HOXD3-201, Transcript of homeobox D3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD3, Length 2,303 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3-201ENST00000249440 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
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HOXD3-201ENST00000249440 IFT57Q9NWB7 429 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD3-201ENST00000249440 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD3-201ENST00000249440 C22orf23Q9BZE7 217 aa20.71■□□□□ 0.91
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HOXD3-201ENST00000249440 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa20.53■□□□□ 0.88
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HOXD3-201ENST00000249440 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
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HOXD3-201ENST00000249440 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
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HOXD3-201ENST00000249440 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
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HOXD3-201ENST00000249440 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa20.49■□□□□ 0.87
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HOXD3-201ENST00000249440 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD3-201ENST00000249440 NALCNQ8IZF0 1738 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD3-201ENST00000249440 KIAA0232Q92628 1395 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD3-201ENST00000249440 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa20.46■□□□□ 0.87
HOXD3-201ENST00000249440 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.87
HOXD3-201ENST00000249440 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.87
HOXD3-201ENST00000249440 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa20.45■□□□□ 0.87
HOXD3-201ENST00000249440 DCTPP1Q9H773 170 aa20.45■□□□□ 0.86
HOXD3-201ENST00000249440 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa20.44■□□□□ 0.86
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