RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 COG3Q96JB2 828 aa35■■■■□ 3.19
CAPNS1-201ENST00000246533 NFAT5O94916 1531 aa34.99■■■■□ 3.19
CAPNS1-201ENST00000246533 KIF20BQ96Q89 1820 aa34.99■■■■□ 3.19
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP34.98■■■■□ 3.19
CAPNS1-201ENST00000246533 CPDO75976 1380 aa34.97■■■■□ 3.19
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGEF25Q86VW2 580 aa34.96■■■■□ 3.19
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNH5Q8NCM2 988 aa34.96■■■■□ 3.19
CAPNS1-201ENST00000246533 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
CAPNS1-201ENST00000246533 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
CAPNS1-201ENST00000246533 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP34.95■■■■□ 3.19
CAPNS1-201ENST00000246533 CGNL1Q0VF96 1302 aa34.95■■■■□ 3.19
CAPNS1-201ENST00000246533 ILDR2Q71H61 639 aa34.95■■■■□ 3.19
CAPNS1-201ENST00000246533 BCL11AQ9H165 835 aa34.95■■■■□ 3.19
CAPNS1-201ENST00000246533 AXIN2Q9Y2T1 843 aa34.95■■■■□ 3.19
CAPNS1-201ENST00000246533 UNC5CLQ8IV45 518 aa34.94■■■■□ 3.18
CAPNS1-201ENST00000246533 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa34.93■■■■□ 3.18
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF123Q5XPI4 1314 aa34.91■■■■□ 3.18
CAPNS1-201ENST00000246533 KNSTRNQ9Y448 316 aa34.91■■■■□ 3.18
CAPNS1-201ENST00000246533 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP34.9■■■■□ 3.18
CAPNS1-201ENST00000246533 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP34.89■■■■□ 3.18
CAPNS1-201ENST00000246533 STRN4Q9NRL3 753 aa34.89■■■■□ 3.18
CAPNS1-201ENST00000246533 LMO7Q8WWI1 1683 aa34.89■■■■□ 3.18
CAPNS1-201ENST00000246533 COL18A1P39060 1754 aa34.89■■■■□ 3.18
CAPNS1-201ENST00000246533 NWD2Q9ULI1 1742 aa34.89■■■■□ 3.18
CAPNS1-201ENST00000246533 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP34.89■■■■□ 3.18
CAPNS1-201ENST00000246533 NRAPQ86VF7 1730 aa34.88■■■■□ 3.17
CAPNS1-201ENST00000246533 RGPD5Q99666 1765 aa34.87■■■■□ 3.17
CAPNS1-201ENST00000246533 LTN1O94822 1766 aa34.87■■■■□ 3.17
CAPNS1-201ENST00000246533 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP34.87■■■■□ 3.17
CAPNS1-201ENST00000246533 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP34.87■■■■□ 3.17
CAPNS1-201ENST00000246533 NUDCQ9Y266 331 aa34.87■■■■□ 3.17
CAPNS1-201ENST00000246533 ATRNO75882 1429 aa34.86■■■■□ 3.17
CAPNS1-201ENST00000246533 AATKQ6ZMQ8 1374 aa34.85■■■■□ 3.17
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP3K19Q56UN5 1328 aa34.84■■■■□ 3.17
CAPNS1-201ENST00000246533 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
CAPNS1-201ENST00000246533 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa34.82■■■■□ 3.16
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP34.82■■■■□ 3.16
CAPNS1-201ENST00000246533 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
CAPNS1-201ENST00000246533 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
CAPNS1-201ENST00000246533 RXRBP28702 533 aa34.81■■■■□ 3.16
CAPNS1-201ENST00000246533 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP34.81■■■■□ 3.16
CAPNS1-201ENST00000246533 VPS72Q15906 364 aa34.8■■■■□ 3.16
CAPNS1-201ENST00000246533 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP34.79■■■■□ 3.16
CAPNS1-201ENST00000246533 EVA1CP58658 441 aa34.79■■■■□ 3.16
CAPNS1-201ENST00000246533 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa34.78■■■■□ 3.16
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa34.78■■■■□ 3.16
CAPNS1-201ENST00000246533 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
CAPNS1-201ENST00000246533 GLI3P10071 1580 aa34.77■■■■□ 3.16
CAPNS1-201ENST00000246533 USP35Q9P2H5 1018 aa34.77■■■■□ 3.16
CAPNS1-201ENST00000246533 MORC1Q86VD1 984 aa34.75■■■■□ 3.15
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
CAPNS1-201ENST00000246533 PEAK1Q9H792 1746 aa34.73■■■■□ 3.15
CAPNS1-201ENST00000246533 HOXC9P31274 260 aa34.73■■■■□ 3.15
CAPNS1-201ENST00000246533 AMPHP49418 695 aa34.73■■■■□ 3.15
CAPNS1-201ENST00000246533 IP6K1Q92551 441 aa34.73■■■■□ 3.15
CAPNS1-201ENST00000246533 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa34.72■■■■□ 3.15
CAPNS1-201ENST00000246533 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa34.72■■■■□ 3.15
CAPNS1-201ENST00000246533 NSD2O96028 1365 aa34.72■■■■□ 3.15
CAPNS1-201ENST00000246533 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
CAPNS1-201ENST00000246533 POLKQ9UBT6 870 aa34.71■■■■□ 3.15
CAPNS1-201ENST00000246533 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
CAPNS1-201ENST00000246533 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa34.69■■■■□ 3.14
CAPNS1-201ENST00000246533 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa34.68■■■■□ 3.14
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP34.68■■■■□ 3.14
CAPNS1-201ENST00000246533 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP34.68■■■■□ 3.14
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD24Q8TF21 1146 aa34.67■■■■□ 3.14
CAPNS1-201ENST00000246533 EP400Q96L91 3159 aa34.67■■■■□ 3.14
CAPNS1-201ENST00000246533 RGS12O14924 1447 aa34.67■■■■□ 3.14
CAPNS1-201ENST00000246533 ERBB3P21860 1342 aa34.67■■■■□ 3.14
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR17Q8IZU2 1322 aa34.67■■■■□ 3.14
CAPNS1-201ENST00000246533 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa34.66■■■■□ 3.14
CAPNS1-201ENST00000246533 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa34.66■■■■□ 3.14
CAPNS1-201ENST00000246533 RALBP1Q15311 655 aa34.63■■■■□ 3.13
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCC6O95255 1503 aa34.63■■■■□ 3.13
CAPNS1-201ENST00000246533 CRB1P82279 1406 aa34.62■■■■□ 3.13
CAPNS1-201ENST00000246533 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa34.61■■■■□ 3.13
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC136Q96JN2 1154 aa34.61■■■■□ 3.13
CAPNS1-201ENST00000246533 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP34.6■■■■□ 3.13
CAPNS1-201ENST00000246533 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP34.59■■■■□ 3.13
CAPNS1-201ENST00000246533 FLT4P35916 1363 aa34.59■■■■□ 3.13
CAPNS1-201ENST00000246533 NLRP2Q9NX02 1062 aa34.59■■■■□ 3.13
CAPNS1-201ENST00000246533 RTL1A6NKG5 1358 aa34.58■■■■□ 3.13
CAPNS1-201ENST00000246533 RGPD2P0DJD1 1756 aa34.58■■■■□ 3.13
CAPNS1-201ENST00000246533 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
CAPNS1-201ENST00000246533 SEPT12Q8IYM1 358 aa34.58■■■■□ 3.13
CAPNS1-201ENST00000246533 TCP11L2Q8N4U5 519 aa34.57■■■■□ 3.13
CAPNS1-201ENST00000246533 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP34.57■■■■□ 3.12
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0G2JS52 829 aa34.56■■■■□ 3.12
CAPNS1-201ENST00000246533 INSRP06213 1382 aa34.55■■■■□ 3.12
CAPNS1-201ENST00000246533 CARD10Q9BWT7 1032 aa34.55■■■■□ 3.12
CAPNS1-201ENST00000246533 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
CAPNS1-201ENST00000246533 BRWD3Q6RI45 1802 aa34.52■■■■□ 3.12
CAPNS1-201ENST00000246533 MTHFSP49914 203 aa34.52■■■■□ 3.12
CAPNS1-201ENST00000246533 NBPF6Q5VWK0 638 aa34.52■■■■□ 3.12
CAPNS1-201ENST00000246533 NBPF4Q96M43 638 aa34.52■■■■□ 3.12
CAPNS1-201ENST00000246533 KIF24Q5T7B8 1368 aa34.52■■■■□ 3.12
CAPNS1-201ENST00000246533 USHBP1Q8N6Y0 703 aa34.51■■■■□ 3.12
CAPNS1-201ENST00000246533 BARGINQ6ZT62 677 aa34.49■■■■□ 3.11
CAPNS1-201ENST00000246533 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP34.49■■■■□ 3.11
CAPNS1-201ENST00000246533 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa34.48■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.3 ms