RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000086471.11

Suds3-201, Transcript of Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Suds3, Length 2,425 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3-201ENSMUST00000086471 Col18a1P39061 1774 aa29.96■■■□□ 2.39
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ccar1Q8CH18 1146 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
Suds3-201ENSMUST00000086471 Stk31Q99MW1 1018 aa29.95■■■□□ 2.39
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa29.95■■■□□ 2.39
Suds3-201ENSMUST00000086471 Farp2Q91VS8 1065 aa29.94■■■□□ 2.38
Suds3-201ENSMUST00000086471 Klhdc4Q921I2 584 aa29.94■■■□□ 2.38
Suds3-201ENSMUST00000086471 CenpbP27790 599 aa29.94■■■□□ 2.38
Suds3-201ENSMUST00000086471 CastP51125 788 aa29.93■■■□□ 2.38
Suds3-201ENSMUST00000086471 Atp7bQ64446 1462 aa29.93■■■□□ 2.38
Suds3-201ENSMUST00000086471 Prkrip1Q9CWV6 186 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
Suds3-201ENSMUST00000086471 Snap23O09044 210 aa29.92■■■□□ 2.38
Suds3-201ENSMUST00000086471 Anp32aO35381 247 aa29.92■■■□□ 2.38
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ppp1r3fQ9JIG4 799 aa29.92■■■□□ 2.38
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cdc37l1Q9CZP7 335 aa29.92■■■□□ 2.38
Suds3-201ENSMUST00000086471 TimelessQ9R1X4 1197 aa29.92■■■□□ 2.38
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mdc1Q5PSV9 1707 aa29.92■■■□□ 2.38
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa29.92■■■□□ 2.38
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ciz1Q8VEH2 845 aa29.91■■■□□ 2.38
Suds3-201ENSMUST00000086471 Atf3Q60765 181 aa29.91■■■□□ 2.38
Suds3-201ENSMUST00000086471 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dnajc10Q9DC23 793 aa29.88■■■□□ 2.37
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ccdc60Q8C4J0 545 aa29.88■■■□□ 2.37
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm6268A2A3U9 297 aa29.87■■■□□ 2.37
Suds3-201ENSMUST00000086471 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
Suds3-201ENSMUST00000086471 Supt16hQ920B9 1047 aa29.87■■■□□ 2.37
Suds3-201ENSMUST00000086471 Kcna6Q61923 529 aa29.86■■■□□ 2.37
Suds3-201ENSMUST00000086471 TatQ8QZR1 454 aa29.86■■■□□ 2.37
Suds3-201ENSMUST00000086471 TmpoQ61033 693 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nfat5Q9WV30 1534 aa29.84■■■□□ 2.37
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dzip1Q8BMD2 852 aa29.84■■■□□ 2.37
Suds3-201ENSMUST00000086471 Znf330Q922H9 316 aa29.83■■■□□ 2.37
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fam135bQ9DAI6 1403 aa29.83■■■□□ 2.37
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nectin2P32507 530 aa29.82■■■□□ 2.36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ncoa4Q5U4H9 625 aa29.82■■■□□ 2.36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ano8Q6PB70 1060 aa29.82■■■□□ 2.36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pibf1E9Q6K3 756 aa29.81■■■□□ 2.36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gimap6Q8K349 305 aa29.81■■■□□ 2.36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Amotl2Q8K371 772 aa29.8■■■□□ 2.36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Trim58Q5NCC9 485 aa29.8■■■□□ 2.36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dixdc1Q80Y83 711 aa29.8■■■□□ 2.36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Usp16Q99LG0 825 aa29.8■■■□□ 2.36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Iqcf3Q9D498 203 aa29.8■■■□□ 2.36
Suds3-201ENSMUST00000086471 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa29.79■■■□□ 2.36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ggnbp2Q5SV77 696 aa29.79■■■□□ 2.36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gnai1B2RSH2 354 aa29.76■■■□□ 2.36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Robo1O89026 1612 aa29.76■■■□□ 2.36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Prim1P20664 417 aa29.76■■■□□ 2.36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gnai3Q9DC51 354 aa29.76■■■□□ 2.36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.36
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tmco5bQ80X59 307 aa29.75■■■□□ 2.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nutm1Q8BHP2 1126 aa29.75■■■□□ 2.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Wnk3Q80XP9 1757 aa29.74■■■□□ 2.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 NudcO35685 332 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Vamp4O70480 141 aa29.73■■■□□ 2.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa29.72■■■□□ 2.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Kcnh5Q920E3 988 aa29.72■■■□□ 2.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ptpn23Q6PB44 1692 aa29.71■■■□□ 2.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fmnl2A2APV2 1086 aa29.71■■■□□ 2.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Brinp3Q499E0 766 aa29.71■■■□□ 2.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa29.7■■■□□ 2.35
Suds3-201ENSMUST00000086471 Slit2Q9R1B9 1521 aa29.7■■■□□ 2.34
Suds3-201ENSMUST00000086471 B4galnt3Q6L8S8 986 aa29.7■■■□□ 2.34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dbr1Q923B1 550 aa29.7■■■□□ 2.34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Liat1Q810M6 228 aa29.69■■■□□ 2.34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Znf521Q6KAS7 1311 aa29.69■■■□□ 2.34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nsd3Q6P2L6 1439 aa29.68■■■□□ 2.34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa29.67■■■□□ 2.34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Armcx1Q9CX83 456 aa29.67■■■□□ 2.34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ahnak2E9PYB0 1738 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
Suds3-201ENSMUST00000086471 TnrQ8BYI9 1358 aa29.67■■■□□ 2.34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fam71e1A1L3C1 212 aa29.66■■■□□ 2.34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cyb5rlB1AS42 316 aa29.66■■■□□ 2.34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm21698A0A087WQP8 267 aa29.65■■■□□ 2.34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm21671G3UY31 267 aa29.65■■■□□ 2.34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Siglec1Q62230 1695 aa29.65■■■□□ 2.34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gli3Q61602 1583 aa29.65■■■□□ 2.34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa29.65■■■□□ 2.34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Maco1Q7TQE6 664 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
Suds3-201ENSMUST00000086471 HypkQ9CR41 129 aa29.64■■■□□ 2.34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rlbp1Q9Z275 317 aa29.64■■■□□ 2.34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Aplp1Q03157 653 aa29.64■■■□□ 2.34
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tet3Q8BG87 1668 aa29.63■■■□□ 2.33
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rad17Q6NXW6 688 aa29.62■■■□□ 2.33
Suds3-201ENSMUST00000086471 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
Suds3-201ENSMUST00000086471 Q3UPC7 1272 aa29.59■■■□□ 2.33
Suds3-201ENSMUST00000086471 Irx6Q9ER75 438 aa29.59■■■□□ 2.33
Suds3-201ENSMUST00000086471 Acsbg1Q99PU5 721 aa29.57■■■□□ 2.32
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm10471E9Q1C7 252 aa29.56■■■□□ 2.32
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pak3Q61036 559 aa29.56■■■□□ 2.32
Suds3-201ENSMUST00000086471 Arfgef2A2A5R2 1792 aa29.56■■■□□ 2.32
Suds3-201ENSMUST00000086471 Trpm3Q5F4S9 1721 aa29.56■■■□□ 2.32
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ppp1r37Q8BKR5 712 aa29.56■■■□□ 2.32
Suds3-201ENSMUST00000086471 Kdm6aO70546 1401 aa29.56■■■□□ 2.32
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nkx2-3P97334 362 aa29.55■■■□□ 2.32
Suds3-201ENSMUST00000086471 Aifm3Q3TY86 605 aa29.55■■■□□ 2.32
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ttll13A4Q9F6 804 aa29.54■■■□□ 2.32
Suds3-201ENSMUST00000086471 Kif24Q6NWW5 1356 aa29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.1 ms