RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000051221.12

Ankrd40-202, Transcript of Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ankrd40, Length 1,477 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Dmrt2Q8BG36 561 aa41.34■■■■■ 4.21
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 CrklP47941 303 aa41.32■■■■■ 4.2
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Rsph6aQ8CDR2 708 aa41.32■■■■■ 4.2
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 OptnQ8K3K8 584 aa41.32■■■■■ 4.2
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Shank2Q80Z38 1476 aa41.31■■■■■ 4.2
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Kiaa1107Q80TK0 1369 aa41.16■■■■■ 4.18
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Ltbp1Q8CG19 1712 aa41■■■■■ 4.15
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Akap11E9Q777 1895 aa40.99■■■■■ 4.15
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Aplp2Q06335 707 aa40.97■■■■■ 4.15
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 NrdcQ8BHG1 1161 aa40.95■■■■■ 4.15
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Ginm1Q91WR6 327 aa40.84■■■■■ 4.13
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Vps33bP59016 617 aa40.83■■■■■ 4.13
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Ankrd23Q812A3 306 aa40.83■■■■■ 4.13
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Golga2Q921M4 999 aa40.83■■■■■ 4.13
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Mst1rQ62190 1378 aa40.83■■■■■ 4.13
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa40.82■■■■■ 4.12
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Rab11fip3Q8CHD8 1047 aa40.81■■■■■ 4.12
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Nwd2Q6P5U7 1742 aa40.79■■■■■ 4.12
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Apaf1O88879 1249 aa40.78■■■■■ 4.12
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa40.78■■■■■ 4.12
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Amotl1Q9D4H4 968 aa40.75■■■■■ 4.11
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Tnks1bp1P58871 1720 aa40.74■■■■■ 4.11
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Exoc5Q3TPX4 708 aa40.72■■■■■ 4.11
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Ddb1Q3U1J4 1140 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Arfgef2A2A5R2 1792 aa40.72■■■■■ 4.11
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Znf541Q0GGX2 1363 aa40.7■■■■■ 4.11
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Elp1Q7TT37 1333 aaKnown RBP40.69■■■■■ 4.1
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Taok3Q8BYC6 898 aa40.69■■■■■ 4.1
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Usp19Q3UJD6 1360 aa40.67■■■■■ 4.1
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Tns2Q8CGB6 1400 aa40.66■■■■■ 4.1
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Trpm3Q5F4S9 1721 aa40.65■■■■■ 4.1
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Pcgf6Q99NA9 353 aa40.64■■■■■ 4.1
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 4930523C07RikE9Q2T4 99 aa40.63■■■■■ 4.09
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Ankrd40-202ENSMUST00000051221 MpndQ3TV65 487 aa40.61■■■■■ 4.09
Ankrd40-202ENSMUST00000051221 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
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