RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027351.12

Ccl20-201, Transcript of C-C motif chemokine 20, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccl20, Length 1,417 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20-201ENSMUST00000027351 MarsQ68FL6 902 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Nob1Q8BW10 403 aa11.36□□□□□ -0.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Lrp6O88572 1613 aa11.36□□□□□ -0.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa11.36□□□□□ -0.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tsr1Q5SWD9 803 aa11.35□□□□□ -0.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tns3Q5SSZ5 1440 aa11.35□□□□□ -0.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Atp7aQ64430 1491 aa11.35□□□□□ -0.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ano8Q6PB70 1060 aa11.35□□□□□ -0.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Kcnv2Q8CFS6 562 aa11.35□□□□□ -0.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Scaf8Q6DID3 1268 aa11.34□□□□□ -0.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 EdaraddQ8VHX2 208 aa11.34□□□□□ -0.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Lhx6Q9R1R0 363 aa11.34□□□□□ -0.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rbm46P86049 533 aa11.33□□□□□ -0.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Scarf1Q5ND28 820 aa11.33□□□□□ -0.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Klra4Q60651 263 aa11.33□□□□□ -0.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Recql4Q75NR7 1216 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Znf526Q8BI66 675 aa11.33□□□□□ -0.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Kif13aQ9EQW7 1749 aa11.32□□□□□ -0.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mphosph9A6H5Y1 991 aa11.32□□□□□ -0.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Atf4Q06507 349 aa11.32□□□□□ -0.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Atf3Q60765 181 aa11.32□□□□□ -0.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Neurod2Q62414 383 aa11.32□□□□□ -0.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Adnp2Q8CHC8 1165 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Bcl2l12Q9D3J3 255 aa11.32□□□□□ -0.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Myo3aQ8K3H5 1613 aa11.32□□□□□ -0.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mia2Q91ZV0 1396 aa11.32□□□□□ -0.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Abcc10Q8R4P9 1501 aa11.31□□□□□ -0.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tarbp1E9Q368 1579 aa11.31□□□□□ -0.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Dapk1Q80YE7 1442 aa11.3□□□□□ -0.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa11.3□□□□□ -0.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Hmx1O70218 332 aa11.3□□□□□ -0.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Q9D9H8 365 aa11.3□□□□□ -0.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ino80Q6ZPV2 1559 aa11.3□□□□□ -0.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 ErbinQ80TH2 1402 aa11.3□□□□□ -0.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Atp1b4Q99ME6 356 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Col22a1E9Q7P1 1613 aa11.29□□□□□ -0.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Prr18Q6PAN7 307 aa11.28□□□□□ -0.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Wdr44Q6NVE8 915 aa11.27□□□□□ -0.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Emilin2Q8K482 1074 aa11.27□□□□□ -0.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pcdhgb4Q91XX6 912 aa11.27□□□□□ -0.6
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Shq1Q7TMX5 569 aa11.26□□□□□ -0.61
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mroh1E0CZ22 1640 aa11.25□□□□□ -0.61
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Zfp142G5E869 1843 aa11.25□□□□□ -0.61
Ccl20-201ENSMUST00000027351 KdrP35918 1367 aa11.25□□□□□ -0.61
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tmem94Q7TSH8 1360 aa11.25□□□□□ -0.61
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm20503G3UZK1 150 aa11.25□□□□□ -0.61
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Phox2bO35690 314 aa11.25□□□□□ -0.61
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Uggt1Q6P5E4 1551 aa11.24□□□□□ -0.61
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pbx2O35984 430 aa11.24□□□□□ -0.61
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Iqgap3F8VQ29 1632 aa11.23□□□□□ -0.61
Ccl20-201ENSMUST00000027351 AW822073A0A0N4SUK1 652 aa11.23□□□□□ -0.61
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rgs9O54828 675 aa11.23□□□□□ -0.61
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pik3c2gO70167 1506 aa11.23□□□□□ -0.61
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Slit3Q9WVB4 1523 aa11.23□□□□□ -0.61
Ccl20-201ENSMUST00000027351 PplQ9R269 1755 aa11.23□□□□□ -0.61
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pkd2O35245 966 aa11.22□□□□□ -0.61
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gpc1Q9QZF2 557 aa11.22□□□□□ -0.61
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa11.21□□□□□ -0.61
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ccdc102aQ3TMW1 549 aa11.21□□□□□ -0.61
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Kif24Q6NWW5 1356 aa11.21□□□□□ -0.62
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Large2Q5XPT3 690 aa11.2□□□□□ -0.62
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Fmr1nbQ80ZA7 238 aa11.2□□□□□ -0.62
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ccdc6D3YZP9 469 aa11.19□□□□□ -0.62
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Abcf1Q6P542 837 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
Ccl20-201ENSMUST00000027351 OplahQ8K010 1288 aa11.19□□□□□ -0.62
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rem2Q8VEL9 341 aa11.19□□□□□ -0.62
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Speer3W4VSP1 261 aa11.19□□□□□ -0.62
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pik3r4Q8VD65 1358 aa11.19□□□□□ -0.62
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Unc13bQ9Z1N9 1602 aa11.19□□□□□ -0.62
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Abca8aQ8K442 1620 aa11.18□□□□□ -0.62
Ccl20-201ENSMUST00000027351 C3P01027 1663 aa11.18□□□□□ -0.62
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cyp8b1O88962 500 aa11.18□□□□□ -0.62
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ddx17Q501J6 650 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Sulf1Q8K007 870 aa11.17□□□□□ -0.62
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Dnajc14Q921R4 703 aa11.17□□□□□ -0.62
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Arhgef28P97433 1693 aa11.16□□□□□ -0.62
Ccl20-201ENSMUST00000027351 DccP70211 1447 aa11.16□□□□□ -0.62
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Washc2Q6PGL7 1334 aa11.16□□□□□ -0.62
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm10563F6WIE4 79 aa11.16□□□□□ -0.62
Ccl20-201ENSMUST00000027351 InhbeO08717 350 aa11.16□□□□□ -0.62
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Stk26Q99JT2 416 aa11.16□□□□□ -0.62
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tex14Q7M6U3 1450 aa11.15□□□□□ -0.62
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Col9a1Q05722 921 aa11.15□□□□□ -0.62
Ccl20-201ENSMUST00000027351 MetrnQ8C1Q4 291 aa11.14□□□□□ -0.63
Ccl20-201ENSMUST00000027351 TsksO54887 585 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Utp14aQ640M1 767 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Znf354bQ9QXT9 601 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Col14a1Q80X19 1797 aa11.13□□□□□ -0.63
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Lce6aD3YV94 81 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rccd1Q8BTU7 377 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Slc52a2Q9D8F3 450 aa11.12□□□□□ -0.63
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ccer2J3QPU5 274 aa11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.5 ms