RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480559.5

GGTLC2-203, Transcript of gamma-glutamyltransferase light chain 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GGTLC2, Length 657 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC2-203ENST00000480559 SCNM1Q9BWG6 230 aa18.35■□□□□ 0.53
GGTLC2-203ENST00000480559 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa18.35■□□□□ 0.53
GGTLC2-203ENST00000480559 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa18.35■□□□□ 0.53
GGTLC2-203ENST00000480559 SCUBE2Q9NQ36 999 aa18.35■□□□□ 0.53
GGTLC2-203ENST00000480559 FTSJ1Q9UET6 329 aa18.35■□□□□ 0.53
GGTLC2-203ENST00000480559 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
GGTLC2-203ENST00000480559 PCNX2A6NKB5 2137 aa18.35■□□□□ 0.53
GGTLC2-203ENST00000480559 LRRD1A4D1F6 860 aa18.34■□□□□ 0.53
GGTLC2-203ENST00000480559 PEX11BO96011 259 aa18.34■□□□□ 0.53
GGTLC2-203ENST00000480559 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
GGTLC2-203ENST00000480559 MAGEA1P43355 309 aa18.34■□□□□ 0.53
GGTLC2-203ENST00000480559 CSNK1DP48730 415 aa18.34■□□□□ 0.53
GGTLC2-203ENST00000480559 ITKQ08881 620 aa18.34■□□□□ 0.53
GGTLC2-203ENST00000480559 ELP6Q0PNE2 266 aa18.34■□□□□ 0.53
GGTLC2-203ENST00000480559 MARC1Q5VT66 337 aa18.34■□□□□ 0.53
GGTLC2-203ENST00000480559 BRAT1Q6PJG6 821 aa18.34■□□□□ 0.53
GGTLC2-203ENST00000480559 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa18.34■□□□□ 0.53
GGTLC2-203ENST00000480559 SLCO6A1Q86UG4 719 aa18.34■□□□□ 0.53
GGTLC2-203ENST00000480559 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa18.34■□□□□ 0.53
GGTLC2-203ENST00000480559 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
GGTLC2-203ENST00000480559 NSMCE3Q96MG7 304 aa18.34■□□□□ 0.53
GGTLC2-203ENST00000480559 PSKH2Q96QS6 385 aa18.34■□□□□ 0.53
GGTLC2-203ENST00000480559 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
GGTLC2-203ENST00000480559 ANP32EQ9BTT0 268 aa18.34■□□□□ 0.53
GGTLC2-203ENST00000480559 NT5MQ9NPB1 228 aa18.34■□□□□ 0.53
GGTLC2-203ENST00000480559 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa18.34■□□□□ 0.53
GGTLC2-203ENST00000480559 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa18.33■□□□□ 0.53
GGTLC2-203ENST00000480559 TSPAN11A1L157 253 aa18.33■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 A8MX80 341 aa18.33■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 KDELR1P24390 212 aa18.33■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 ARHGAP25P42331 645 aa18.33■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 MMP13P45452 471 aa18.33■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 RXRGP48443 463 aa18.33■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 SHC2P98077 582 aa18.33■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP18.33■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 ODF2Q5BJF6 829 aa18.33■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 ZSCAN30Q86W11 494 aa18.33■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 PGBD5Q8N414 524 aa18.33■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 HCAR2Q8TDS4 363 aa18.33■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa18.33■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 DNAJC28Q9NX36 388 aa18.33■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 KLK13Q9UKR3 277 aa18.33■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 TFR2Q9UP52 801 aa18.33■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa18.33■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 TTLL3Q9Y4R7 772 aa18.33■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa18.33■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 SPOPO43791 374 aa18.32■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 NEBLO76041 1014 aa18.32■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 MTA2O94776 668 aa18.32■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 KRT1P04264 644 aa18.32■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 C6P13671 934 aa18.32■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 GARSP41250 739 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 RABIFP47224 123 aa18.32■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 SUOXP51687 545 aa18.32■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 AP1S1P61966 158 aa18.32■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 GBE1Q04446 702 aa18.32■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 TMEM52BQ4KMG9 183 aa18.32■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 GLRX5Q86SX6 157 aa18.32■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 PQLC3Q8N755 202 aa18.32■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa18.32■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 INTUQ9ULD6 942 aa18.32■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 FFAR2O15552 330 aa18.31■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 TNFSF14O43557 240 aa18.31■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 TRIM16O95361 564 aa18.31■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 IGFALSP35858 605 aa18.31■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 LIG3P49916 1009 aa18.31■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 GALNT2Q10471 571 aa18.31■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 DNAJC3Q13217 504 aa18.31■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 SPA17Q15506 151 aa18.31■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 CCNYQ8ND76 341 aa18.31■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 DENND6BQ8NEG7 585 aa18.31■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 FAM174AQ8TBP5 190 aa18.31■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 ASB12Q8WXK4 309 aa18.31■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP18.31■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 RNF157Q96PX1 679 aa18.31■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 NUDCD1Q96RS6 583 aa18.31■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 MGME1Q9BQP7 344 aa18.31■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 GOLPH3Q9H4A6 298 aa18.31■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 NOD2Q9HC29 1040 aa18.31■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 UCKL1Q9NWZ5 548 aa18.31■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 TOR4AQ9NXH8 423 aa18.31■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 WASF3Q9UPY6 502 aa18.31■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa18.31■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 SHROOM3Q8TF72 1996 aa18.3■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 SOWAHDA6NJG2 315 aa18.3■□□□□ 0.52
GGTLC2-203ENST00000480559 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms