RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 CAPSQ13938 189 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 TOMM20Q15388 145 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 EPHA10Q5JZY3 1008 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF626Q68DY1 528 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 SYCE2Q6PIF2 218 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 TSSK4Q6SA08 328 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 C16orf54Q6UWD8 224 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 TDRPQ86YL5 185 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 CAMK1DQ8IU85 385 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 DNAJC10Q8IXB1 793 aa3.26□□□□□ -1.89
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PTPRC-205ENST00000391970 TTC39CQ8N584 583 aa3.26□□□□□ -1.89
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PTPRC-205ENST00000391970 C16orf52Q8NHV5 167 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 MPLKIPQ8TAP9 179 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 SCFD2Q8WU76 684 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM174Q8WUU8 243 aa3.26□□□□□ -1.89
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PTPRC-205ENST00000391970 TMEM18Q96B42 140 aa3.26□□□□□ -1.89
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PTPRC-205ENST00000391970 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
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PTPRC-205ENST00000391970 TRMOQ9BU70 441 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 CDT1Q9H211 546 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 SYNCQ9H7C4 482 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 ASAH2Q9NR71 780 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 ANKRD10Q9NXR5 420 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 PLK2Q9NYY3 685 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 HEY2Q9UBP5 337 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 NDRG3Q9UGV2 375 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 COG5Q9UP83 839 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa3.26□□□□□ -1.89
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PTPRC-205ENST00000391970 ZNF804BA4D1E1 1349 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 PTGES3LE9PB15 166 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 SEC14L5O43304 696 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 AHCYL1O43865 530 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 ATP2C2O75185 946 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 EPN2O95208 641 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 RARGP13631 454 aa3.25□□□□□ -1.89
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PTPRC-205ENST00000391970 ITGAXP20702 1163 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
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PTPRC-205ENST00000391970 NIPAL4Q0D2K0 466 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 OLIG2Q13516 323 aa3.25□□□□□ -1.89
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PTPRC-205ENST00000391970 LPIN1Q14693 890 aa3.25□□□□□ -1.89
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PTPRC-205ENST00000391970 MTX3Q5HYI7 312 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 Q5PR19 223 aa3.25□□□□□ -1.89
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PTPRC-205ENST00000391970 SHC4Q6S5L8 630 aa3.25□□□□□ -1.89
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PTPRC-205ENST00000391970 GSTA5Q7RTV2 222 aa3.25□□□□□ -1.89
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PTPRC-205ENST00000391970 BTBD3Q9Y2F9 522 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
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PTPRC-205ENST00000391970 RAI2Q9Y5P3 530 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRC-205ENST00000391970 UTYO14607 1347 aa3.24□□□□□ -1.89
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