RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317201.6

HOXA3-201, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HOXA3, Length 2,761 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-201ENST00000317201 PCDH12Q9NPG4 1184 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 BACE2Q9Y5Z0 518 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 HACD1B0YJ81 288 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 OR4Q2P0C623 313 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 CPA3P15088 417 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 ACTR3P61158 418 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 GPS1Q13098 491 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 NME3Q13232 169 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 RASA2Q15283 850 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 CCDC58Q4VC31 144 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 TJAP1Q5JTD0 557 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 MON1AQ86VX9 555 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 ULK2Q8IYT8 1036 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 GLIS1Q8NBF1 620 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 RNF139Q8WU17 664 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 EME1Q96AY2 570 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 DDIT4Q9NX09 232 aa14.89□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 ARHGAP33O14559 1287 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 AMHP03971 560 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 HTR7P34969 479 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 LRRC26Q2I0M4 334 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 BRMS1LQ5PSV4 323 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 NIPAL1Q6NVV3 410 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 TMPRSS6Q8IU80 811 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 SMOC2Q9H3U7 446 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 A0A088AWK7 358 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 ARHGAP42A6NI28 874 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 AP3B1O00203 1094 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 ICMTO60725 284 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 DPYSQ14117 519 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 USP41Q3LFD5 358 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 IL23RQ5VWK5 629 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 BTBD8Q5XKL5 378 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 NPNTQ6UXI9 565 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 NECAB2Q7Z6G3 386 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 UNC45BQ8IWX7 931 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 SCAMP5Q8TAC9 235 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 OSBPL2Q9H1P3 480 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 ARHGEF4Q9NR80 690 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 KLHL3Q9UH77 587 aa14.88□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 KRBA1A5PL33 1030 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 MEI4A8MW99 385 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 BAIAP3O94812 1187 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 GOT1P17174 413 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 GDF10P55107 478 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 SLC1A5Q15758 541 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 RTP2Q5QGT7 225 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 MSANTD2Q6P1R3 559 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 LRRC49Q8IUZ0 686 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 PPIL6Q8IXY8 311 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 EFCAB3Q8N7B9 438 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 CALML6Q8TD86 181 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 WDCPQ9H6R7 721 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 S100A14Q9HCY8 104 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 PAK5Q9P286 719 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 MTRRQ9UBK8 725 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 MTMR11A4FU01 709 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 H7C0C1 242 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 RPL22P35268 128 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 ATP5OP48047 213 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 C1QTNF8P60827 252 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 ITGADQ13349 1161 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 SLC8B1Q6J4K2 584 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 TAC4Q86UU9 113 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 SCN4BQ8IWT1 228 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 TAMM41Q96BW9 452 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 IGSF21Q96ID5 467 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 CTRCQ99895 268 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 EBF1Q9UH73 591 aa14.87□□□□□ -0.03
HOXA3-201ENST00000317201 BRCA2P51587 3418 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms