RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259216.4

CFC1-201, Transcript of cripto, FRL-1, cryptic family 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CFC1, Length 1,046 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFC1-201ENST00000259216 GIMD1P0DJR0 217 aa20.49■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 SMTNL2Q2TAL5 461 aa20.49■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 BOLA3Q53S33 107 aa20.49■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 TPRG1LQ5T0D9 272 aa20.49■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa20.49■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 VPS36Q86VN1 386 aa20.49■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 ZSWIM9Q86XI8 627 aa20.49■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 CPNE8Q86YQ8 564 aa20.49■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 FAM71BQ8TC56 605 aa20.49■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 TEKT4Q8WW24 435 aa20.49■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 CSPG4P5Q96PW8 444 aa20.49■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 DNAJC7Q99615 494 aa20.49■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 FTSJ1Q9UET6 329 aa20.49■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 A6NNZ2 444 aa20.48■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 PIGNO95427 931 aa20.48■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 IL4RP24394 825 aa20.48■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 CSNK1DP48730 415 aa20.48■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 PFN3P60673 137 aa20.48■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 FZD2Q14332 565 aa20.48■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 Q6ZSR6 202 aa20.48■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 EID2Q8N6I1 236 aa20.48■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 CENPTQ96BT3 561 aa20.48■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 PCDH18Q9HCL0 1135 aa20.48■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 IP6K2Q9UHH9 426 aa20.48■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 ANAPC7Q9UJX3 599 aa20.48■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 H3BRJ5 948 aa20.47■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 TRIM38O00635 465 aa20.47■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 ENC1O14682 589 aa20.47■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 SDC3O75056 442 aa20.47■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 KRT37O76014 449 aa20.47■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 AMPD1P23109 780 aa20.47■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 ACADVLP49748 655 aa20.47■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 ARSEP51690 589 aa20.47■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 RAD51Q06609 339 aa20.47■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 IL10RBQ08334 325 aa20.47■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 CCDC122Q5T0U0 273 aa20.47■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 TTC7BQ86TV6 843 aa20.47■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 DENND6BQ8NEG7 585 aa20.47■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 FAM174AQ8TBP5 190 aa20.47■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 HCAR2Q8TDS4 363 aa20.47■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 IFT43Q96FT9 208 aa20.47■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 PACSIN1Q9BY11 444 aa20.47■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 ZWILCHQ9H900 591 aa20.47■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 UCKL1Q9NWZ5 548 aa20.47■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 ASPMQ8IZT6 3477 aa20.47■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 TMEM8BA6NDV4 472 aa20.46■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 DAPK3O43293 454 aa20.46■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 DGKAP23743 735 aa20.46■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 DNAJC3Q13217 504 aa20.46■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 PROX2Q3B8N5 592 aa20.46■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 TMEM52BQ4KMG9 183 aa20.46■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa20.46■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 MARCH9Q86YJ5 346 aa20.46■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 CAMK1DQ8IU85 385 aa20.46■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 VSTM4Q8IW00 320 aa20.46■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 LZTR1Q8N653 840 aa20.46■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 HSPH1Q92598 858 aa20.46■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 ECHDC3Q96DC8 303 aa20.46■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa20.46■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 CALN1Q9BXU9 219 aa20.46■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 SUV39H2Q9H5I1 410 aa20.46■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa20.46■□□□□ 0.87
CFC1-201ENST00000259216 FREM2Q5SZK8 3169 aa20.45■□□□□ 0.86
CFC1-201ENST00000259216 LRRK1Q38SD2 2015 aa20.45■□□□□ 0.86
CFC1-201ENST00000259216 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa20.45■□□□□ 0.86
CFC1-201ENST00000259216 GOLGA8CPA6NN73 597 aa20.45■□□□□ 0.86
CFC1-201ENST00000259216 DFFAO00273 331 aa20.45■□□□□ 0.86
CFC1-201ENST00000259216 MMP20O60882 483 aa20.45■□□□□ 0.86
CFC1-201ENST00000259216 PALMO75781 387 aa20.45■□□□□ 0.86
CFC1-201ENST00000259216 PIAS2O75928 621 aa20.45■□□□□ 0.86
CFC1-201ENST00000259216 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CFC1-201ENST00000259216 IGFALSP35858 605 aa20.45■□□□□ 0.86
CFC1-201ENST00000259216 SUOXP51687 545 aa20.45■□□□□ 0.86
CFC1-201ENST00000259216 SLC10A7Q0GE19 358 aa20.45■□□□□ 0.86
CFC1-201ENST00000259216 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CFC1-201ENST00000259216 NFKBIBQ15653 356 aa20.45■□□□□ 0.86
CFC1-201ENST00000259216 SLC18A3Q16572 532 aa20.45■□□□□ 0.86
CFC1-201ENST00000259216 UGP2Q16851 508 aa20.45■□□□□ 0.86
CFC1-201ENST00000259216 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CFC1-201ENST00000259216 SRLQ86TD4 932 aa20.45■□□□□ 0.86
CFC1-201ENST00000259216 OR8K1Q8NGG5 319 aa20.45■□□□□ 0.86
CFC1-201ENST00000259216 PSKH2Q96QS6 385 aa20.45■□□□□ 0.86
CFC1-201ENST00000259216 TSPY26PQ9H489 355 aa20.45■□□□□ 0.86
CFC1-201ENST00000259216 KLF15Q9UIH9 416 aa20.45■□□□□ 0.86
CFC1-201ENST00000259216 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa20.45■□□□□ 0.86
CFC1-201ENST00000259216 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CFC1-201ENST00000259216 NEMP1O14524 444 aa20.44■□□□□ 0.86
CFC1-201ENST00000259216 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.86
CFC1-201ENST00000259216 SGCGQ13326 291 aa20.44■□□□□ 0.86
CFC1-201ENST00000259216 CAMK2BQ13554 666 aa20.44■□□□□ 0.86
CFC1-201ENST00000259216 GRM3Q14832 879 aa20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms