RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 RNF146Q9NTX7 359 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 SPATA7Q9P0W8 599 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 FZD10Q9ULW2 581 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 BBIP1A8MTZ0 92 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 TIPRLO75663 272 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 UGT2B4P06133 528 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 GSTT2P0CG29 244 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 GSTT2BP0CG30 244 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 CYBRD1Q53TN4 286 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 NEPROQ6NW34 567 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 PMF1Q6P1K2 205 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 ZNF773Q6PK81 442 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 SLC26A9Q7LBE3 791 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 IGFN1Q86VF2 1251 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 DHFR2Q86XF0 187 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 ZNF786Q8N393 782 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 APBA2Q99767 749 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 C2orf40Q9H1Z8 148 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 GID8Q9NWU2 228 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 SEPT3Q9UH03 358 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 GIT1Q9Y2X7 761 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 COL4A5P29400 1685 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 MAGEB16A2A368 324 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 H0Y858 1186 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 GIPC1O14908 333 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 CLPXO76031 633 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 NFICP08651 508 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 CYP2C9P11712 490 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 CAPGP40121 348 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 MLLT10P55197 1068 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 RALGDSQ12967 914 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 BNIP3Q12983 259 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 GPR107Q5VW38 600 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 IER5Q5VY09 327 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 XAF1Q6GPH4 301 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 KCTD8Q6ZWB6 473 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 CBR4Q8N4T8 237 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 MOCOSQ96EN8 888 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 RHOJQ9H4E5 214 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 TLR9Q9NR96 1032 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 TRIM17Q9Y577 477 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 CPQQ9Y646 472 aa10□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 TCRBV5S2A0A599 114 aa9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 E2F8A0AVK6 867 aa9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 KRBA1A5PL33 1030 aa9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 ZNF839A8K0R7 811 aa9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 ZBTB42B2RXF5 422 aa9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 CFAP99D6REC4 459 aa9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 H0YAE9 185 aa9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 SRP72O76094 671 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 MATN1P21941 496 aa9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 SLC12A1Q13621 1099 aa9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 GRM3Q14832 879 aa9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 NR1D2Q14995 579 aa9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 SCYL2Q6P3W7 929 aa9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 STRADAQ7RTN6 431 aa9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 ERO1BQ86YB8 467 aa9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 ADGRG5Q8IZF4 528 aa9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 CCDC185Q8N715 623 aa9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 AGR3Q8TD06 166 aa9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 CANT1Q8WVQ1 401 aa9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 STARD8Q92502 1023 aa9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 LGMNQ99538 433 aa9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 HGH1Q9BTY7 390 aa9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 SLC25A23Q9BV35 468 aa9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 AKIP1Q9NQ31 210 aa9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 CROTQ9UKG9 612 aa9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 DOLKQ9UPQ8 538 aa9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 NRCAMQ92823 1304 aa9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 ACKR2O00590 384 aa9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 XPOTO43592 962 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 JRKO75564 520 aa9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 GRAP2O75791 330 aa9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 NAGLUP54802 743 aa9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 BNIP2Q12982 314 aa9.99□□□□□ -0.81
HCG18-242ENST00000602319 FXNQ16595 210 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms