RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa22.11■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC25A41Q8N5S1 370 aa22.11■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HTATIP2Q9BUP3 242 aa22.11■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC46A2Q9BY10 475 aa22.11■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OR51B4Q9Y5P0 310 aa22.11■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SOBPA7XYQ1 873 aa22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CBX4O00257 560 aa22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZMPSTE24O75844 475 aa22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCR2P41597 374 aa22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAGEA12P43365 314 aa22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SIRPB2Q5JXA9 342 aa22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STXBP5Q5T5C0 1151 aa22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNF43Q68DV7 783 aa22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NDUFAF2Q8N183 169 aa22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CARNMT1Q8N4J0 409 aa22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SHKBP1Q8TBC3 707 aa22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAN1C1Q9NR34 630 aa22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TIMM44O43615 452 aa22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FGF1P05230 155 aa22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GJA1P17302 382 aa22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARNTP27540 789 aa22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARF5P84085 180 aa22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDK18Q07002 472 aa22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FSCBQ5H9T9 825 aa22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NLRP9Q7RTR0 991 aa22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LEMD2Q8NC56 503 aa22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRC8CQ8TDW0 803 aa22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM111AQ96PZ2 611 aa22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FEM1AQ9BSK4 669 aa22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCMTD2Q9NV79 361 aa22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ACTL7AQ9Y615 435 aa22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NOTCH4Q99466 2003 aa22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MROH6A6NGR9 719 aa22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LEFTY2O00292 366 aa22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TPP1O14773 563 aa22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GRM6O15303 877 aa22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SNX3O60493 162 aa22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GJB3O75712 270 aa22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARHGEF15O94989 841 aa22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTPN2P17706 415 aa22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IRS1P35568 1242 aa22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDE1BQ01064 536 aa22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYTH1Q15438 398 aa22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPRED2Q7Z698 418 aa22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ALG14Q96F25 216 aa22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 IFT43Q96FT9 208 aa22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIB3Q96RU7 358 aa22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RFPL2O75678 378 aa22.08■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CSPG5O95196 566 aa22.08■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VAPBO95292 243 aa22.08■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CD160O95971 181 aa22.08■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HADHAP40939 763 aa22.08■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDH18Q13634 790 aa22.08■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LAMB3Q13751 1172 aa22.08■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SEPT6Q14141 434 aa22.08■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CNGA3Q16281 694 aa22.08■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UGP2Q16851 508 aa22.08■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MPPE1Q53F39 396 aa22.08■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TSTD2Q5T7W7 516 aa22.08■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FSTL4Q6MZW2 842 aa22.08■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BBS7Q8IWZ6 715 aa22.08■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DCAF4L2Q8NA75 395 aa22.08■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC197Q8NCU1 140 aa22.08■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GRAMD1AQ96CP6 724 aa22.08■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SAMD11Q96NU1 681 aa22.08■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
GADD45GIP1-201ENST00000316939 E2F8A0AVK6 867 aa22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC78A2IDD5 438 aa22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 INSIG1O15503 277 aa22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NUMBP49757 651 aa22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SERPINB8P50452 374 aa22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ITIH4Q14624 930 aa22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 C6orf89Q6UWU4 347 aa22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DCLK2Q8N568 766 aa22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PEX13Q92968 403 aa22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NUDCD1Q96RS6 583 aa22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC13A1Q9BZW2 595 aa22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NOD2Q9HC29 1040 aa22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1-201ENST00000316939 VPS28Q9UK41 221 aa22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms