RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 ENO4A6NNW6 628 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 WNT3AP56704 352 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 SPPL2BQ8TCT7 592 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 ACMSDQ8TDX5 336 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 KLHL5Q96PQ7 755 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 CDRT15Q96T59 188 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 FZD8Q9H461 694 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRJ-208ENST00000615445 TBL1XO60907 577 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 MLNP12872 115 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 PSMC3P17980 439 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 AIF1P55008 147 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 ASAH2Q9NR71 780 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 ARL15Q9NXU5 204 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 FZD9O00144 591 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 TFEBP19484 476 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 CLCN5P51795 746 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 LILRA4P59901 499 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 TAF10Q12962 218 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 BBS7Q8IWZ6 715 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 ASB2Q96Q27 587 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 OMDQ99983 421 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 TTPALQ9BTX7 342 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 HSPA14Q0VDF9 509 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 TBCELQ5QJ74 424 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 KCTD4Q8WVF5 259 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 SEPHS2Q99611 448 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 MIEF1Q9NQG6 463 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 OPTCQ9UBM4 332 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 CARNS1A5YM72 827 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 DHX15O43143 795 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 C22orf31O95567 290 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 RFX3P48380 749 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 CLCNKBP51801 687 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 CRY1Q16526 586 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 SIAH1Q8IUQ4 282 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 PLD3Q8IV08 490 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 PTPRNQ16849 979 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 TTC27Q6P3X3 843 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 KLHL4Q9C0H6 718 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 ZBTB14O43829 449 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 ME2P23368 584 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 NCALDP61601 193 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 SGCGQ13326 291 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 STXBP5Q5T5C0 1151 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 FBXL19Q6PCT2 694 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 MICU2Q8IYU8 434 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 BPIFA1Q9NP55 256 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 INPP4BO15327 924 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 CLK1P49759 484 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 CDK18Q07002 472 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 SNX30Q5VWJ9 437 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 CCDC81Q6ZN84 652 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 TNS4Q8IZW8 715 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 NSMCE2Q96MF7 247 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC25A23Q9BV35 468 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 TYMPP19971 482 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 PLCL1Q15111 1095 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 ADCK1Q86TW2 530 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 ERLEC1Q96DZ1 483 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 PDP2Q9P2J9 529 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 POTEHQ6S545 545 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 VSTM1Q6UX27 236 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 DSG4Q86SJ6 1040 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM199Q8N511 208 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 RIN3Q8TB24 985 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 HIPK3Q9H422 1215 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 NR2E1Q9Y466 385 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 A0A1W2PQH9 124 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 TBC1D3BA6NDS4 549 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 CD48P09326 243 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 ACADMP11310 421 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM45BPQ6NSW5 357 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 IYDQ6PHW0 289 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 RD3Q7Z3Z2 195 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRJ-208ENST00000615445 C11orf74Q86VG3 221 aa20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms