RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233190.10

NDUFS1-201, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NDUFS1, Length 11,819 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1-201ENST00000233190 PDHA1P08559 390 aa7□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 CACNA2D1P54289 1103 aa7□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa7□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 MTMR8Q96EF0 704 aa7□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 KLHL1Q9NR64 748 aa7□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 EFR3BQ9Y2G0 817 aa7□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 TREHO43280 583 aa7□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 SCN2BO60939 215 aa7□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 ULK1O75385 1050 aa7□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 APRTP07741 180 aa7□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 SERPINF2P08697 491 aa7□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 RARAP10276 462 aa7□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 CDH3P22223 829 aa7□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 MFSD10Q14728 455 aa7□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 IQSEC1Q6DN90 963 aa7□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 SYT10Q6XYQ8 523 aa7□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 FAM35AQ86V20 835 aa7□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 OR14C36Q8NHC7 312 aa7□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 NINJ1Q92982 152 aa7□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 PCDHB10Q9UN67 800 aa7□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 TMEM2Q9UHN6 1383 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 FCHO1O14526 889 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 CPA1P15085 419 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 CSHL1Q14406 222 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 ALG10Q5BKT4 473 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 SIKE1Q9BRV8 207 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 DDIT4Q9NX09 232 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 LRFN1Q9P244 771 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 DEC1Q9P2X7 70 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 LRCH4O75427 683 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 ELFN1P0C7U0 828 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 SERPINB9P50453 376 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 FAM133AQ8N9E0 248 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 CDH19Q9H159 772 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 GMIPQ9P107 970 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 GMPPBQ9Y5P6 360 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 IGSF3O75054 1194 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 NR1D2Q14995 579 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 SLC29A4Q7RTT9 530 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 BORCS8Q96FH0 119 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 ADGRB2O60241 1585 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 TTC34A8MYJ7 566 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 SERPINA3P01011 423 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 OR12D1P0DN82 309 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 EPHB2P29323 1055 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 GPM6BQ13491 265 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 XPR1Q9UBH6 696 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 GYG2O15488 501 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 NUAK1O60285 661 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 CRISP1P54107 249 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 AP1ARQ63HQ0 302 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 FAM151AQ8WW52 585 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 IRAK3Q9Y616 596 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 HSF2Q03933 536 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 IRGCQ6NXR0 463 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 DEF8Q6ZN54 512 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 TMEM26Q6ZUK4 368 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 LGMNQ99538 433 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 PHF11Q9UIL8 331 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 CLASP1Q7Z460 1538 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 DCLK1O15075 740 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 ARP10275 920 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 TBX4P57082 545 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 ELP6Q0PNE2 266 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 GALNT13Q8IUC8 556 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 VCPKMTQ9H867 229 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 SLAMF7Q9NQ25 335 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 MTMR4Q9NYA4 1195 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 PREX2Q70Z35 1606 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 A0A1B0GTH6 734 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 BMP7P18075 431 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 HCAR3P49019 387 aa6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
NDUFS1-201ENST00000233190 MYBPC3Q14896 1274 aa6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms