RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-201ENST00000325897 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-201ENST00000325897 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-201ENST00000325897 HSPBP1Q9NZL4 362 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-201ENST00000325897 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-201ENST00000325897 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
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CLVS1-201ENST00000325897 TRAV20A0A0B4J274 112 aa5.06□□□□□ -1.6
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CLVS1-201ENST00000325897 ZNF212Q9UDV6 495 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-201ENST00000325897 CYTH4Q9UIA0 394 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-201ENST00000325897 FEM1BQ9UK73 627 aa5.06□□□□□ -1.6
CLVS1-201ENST00000325897 SIPA1L1O43166 1804 aa5.05□□□□□ -1.6
CLVS1-201ENST00000325897 MYH7BA7E2Y1 1941 aa5.05□□□□□ -1.6
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