RNA–Protein interactions for RNA: YOL031C

SIL1, Transcript of Nucleotide exchange factor for the ER lumenal Hsp70 chaperone Kar2p, yeast

Gene SIL1, Length 1,266 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIL1	YOL031C	YBR287W	P38355	427 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	IRC24	P40580	263 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	BDF2	Q07442	638 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	CYC8	P14922	966 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	YHL008C	P38750	627 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	BUD6	P41697	788 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	GDE1	Q02979	1223 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	YLR125W	Q12138	136 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	MCD1	Q12158	566 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	RAD2	P07276	1031 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	SUV3	P32580	737 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	DLD1	P32891	587 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	SWE1	P32944	819 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	MKS1	P34072	584 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	FIR1	P40020	876 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	NUP82	P40368	713 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	HUL5	P53119	910 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	GPI13	Q07830	1017 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	PHO8	P11491	566 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	UTR2	P32623	467 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	GRX4	P32642	244 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	OSH7	P38755	437 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	TPM2	P40414	161 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	TIM54	P47045	478 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	YJR098C	P47139	656 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	BSC2	Q05611	235 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	SPO75	Q07798	868 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	APC11	Q12157	165 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	SWI5	P08153	709 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	DPB3	P27344	201 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	SFP1	P32432	683 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	SCT1	P32784	759 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	OSH2	Q12451	1283 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SIL1	YOL031C	RAD4	P14736	754 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	THI4	P32318	326 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	YOL057W	Q08225	711 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	TCB1	Q12466	1186 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	SRM1	P21827	482 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	RAD27	P26793	382 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	SCD5	P34758	872 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	HXT8	P40886	569 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	YJR142W	P47173	342 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	DAL4	Q04895	635 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	KAR1	P11927	433 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	STE6	P12866	1290 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	CDC34	P14682	295 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	GAL11	P19659	1081 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	MRPL33	P20084	86 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	RPB10	P22139	70 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	FBP26	P32604	452 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	LDH1	P38139	375 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	ISU1	Q03020	165 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	CAB1	Q04430	367 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	YCS4	Q06156	1176 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	OPI10	Q08202	246 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	PRI2	P20457	528 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	MRC1	P25588	1096 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	YEN1	P40028	759 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	MTO1	P53070	669 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	RSC4	Q02206	625 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	GIN4	Q12263	1142 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	DYS1	P38791	387 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	RAD55	P38953	406 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	UBP12	P39538	1254 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	TYW3	P53177	273 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	YGR125W	P53273	1036 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	YPL034W	Q03083	165 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	RTT10	Q08924	1013 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	FLC1	Q08967	793 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	MCM1	P11746	286 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	GEM1	P39722	662 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	HUL4	P40985	892 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	YGR053C	P53234	283 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	YMR187C	Q03236	431 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SIL1	YOL031C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SIL1	YOL031C	TIM23	P32897	222 aa		4.65	□□□□□ -1.67

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