RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GCN4	YEL009C	YIL165C	P40446	119 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GCN4	YEL009C	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
GCN4	YEL009C	CIT3	P43635	486 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GCN4	YEL009C	SOG2	Q08817	791 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GCN4	YEL009C	SEA4	P38164	1038 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GCN4	YEL009C	ELG1	Q12050	791 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GCN4	YEL009C	TRS33	Q99394	268 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GCN4	YEL009C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
GCN4	YEL009C	MRPL33	P20084	86 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GCN4	YEL009C	VMA3	P25515	160 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GCN4	YEL009C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
GCN4	YEL009C	FAR11	P53917	953 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GCN4	YEL009C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
GCN4	YEL009C	TAF1	P46677	1066 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GCN4	YEL009C	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
GCN4	YEL009C	BSD2	P38356	321 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GCN4	YEL009C	MSH6	Q03834	1242 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GCN4	YEL009C	CDA2	Q06703	312 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GCN4	YEL009C	HSP78	P33416	811 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GCN4	YEL009C	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
GCN4	YEL009C	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
GCN4	YEL009C	FIR1	P40020	876 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GCN4	YEL009C	KTR7	P40504	517 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GCN4	YEL009C	CAB1	Q04430	367 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GCN4	YEL009C	FUS1	P11710	512 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCN4	YEL009C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GCN4	YEL009C	ROM1	P53046	1155 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCN4	YEL009C	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GCN4	YEL009C	RCM1	P53972	490 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCN4	YEL009C	YOR223W	Q12015	292 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCN4	YEL009C	YLL054C	Q12244	843 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCN4	YEL009C	GAL2	P13181	574 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCN4	YEL009C	THI80	P35202	319 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCN4	YEL009C	NEO1	P40527	1151 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCN4	YEL009C	ADP1	P25371	1049 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GCN4	YEL009C	ORC3	P54790	616 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GCN4	YEL009C	BIM1	P40013	344 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCN4	YEL009C	YNR065C	P53751	1116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GCN4	YEL009C	ERS1	P17261	260 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN4	YEL009C	MSN1	P22148	382 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN4	YEL009C	FLR1	P38124	548 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN4	YEL009C	AIM46	P38885	310 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GCN4	YEL009C	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GCN4	YEL009C	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GCN4	YEL009C	BOI1	P38041	980 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GCN4	YEL009C	ALD3	P54114	506 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCN4	YEL009C	YMR074C	Q04773	145 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCN4	YEL009C	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
GCN4	YEL009C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GCN4	YEL009C	TFA2	P36145	328 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCN4	YEL009C	ATG32	P40458	529 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GCN4	YEL009C	YBR197C	P38306	217 aa		4.57	□□□□□ -1.68
GCN4	YEL009C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
GCN4	YEL009C	YJR124C	P47159	448 aa		4.56	□□□□□ -1.68
GCN4	YEL009C	NFS1	P25374	497 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCN4	YEL009C	GPT2	P36148	743 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCN4	YEL009C	FET4	P40988	552 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCN4	YEL009C	RIM8	P53179	542 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GCN4	YEL009C	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
GCN4	YEL009C	SUV3	P32580	737 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GCN4	YEL009C	HXT8	P40886	569 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GCN4	YEL009C	TRE1	Q08919	783 aa		4.53	□□□□□ -1.68
GCN4	YEL009C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
GCN4	YEL009C	HVG1	P0CE11	249 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GCN4	YEL009C	ISC10	P32645	267 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GCN4	YEL009C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
GCN4	YEL009C	GCV1	P48015	400 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GCN4	YEL009C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
GCN4	YEL009C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
GCN4	YEL009C	YPT53	P36019	220 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GCN4	YEL009C	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
GCN4	YEL009C	MRPL22	P53881	309 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GCN4	YEL009C	SSY1	Q03770	852 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GCN4	YEL009C	PNS1	Q12412	539 aa		4.5	□□□□□ -1.69
GCN4	YEL009C	SOD2	P00447	233 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GCN4	YEL009C	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
GCN4	YEL009C	GLO4	Q12320	285 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GCN4	YEL009C	NTA1	P40354	457 aa		4.48	□□□□□ -1.69
GCN4	YEL009C	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
GCN4	YEL009C	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
GCN4	YEL009C	ECM23	Q02710	187 aa		4.47	□□□□□ -1.69
GCN4	YEL009C	YLR358C	O13565	187 aa		4.46	□□□□□ -1.7
GCN4	YEL009C	PRO1	P32264	428 aa		4.46	□□□□□ -1.7
GCN4	YEL009C	ALT1	P52893	592 aa		4.46	□□□□□ -1.7
GCN4	YEL009C	TOD6	P34219	525 aa		4.45	□□□□□ -1.7
GCN4	YEL009C	TGL4	P36165	910 aa		4.45	□□□□□ -1.7
GCN4	YEL009C	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
GCN4	YEL009C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
GCN4	YEL009C	UBX7	P38349	436 aa		4.44	□□□□□ -1.7
GCN4	YEL009C	RGD2	P43556	714 aa		4.44	□□□□□ -1.7
GCN4	YEL009C	YIG1	Q08956	461 aa		4.44	□□□□□ -1.7
GCN4	YEL009C	YVC1	Q12324	675 aa		4.44	□□□□□ -1.7
GCN4	YEL009C	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
GCN4	YEL009C	RAD55	P38953	406 aa		4.43	□□□□□ -1.7
GCN4	YEL009C	PEX7	P39108	375 aa		4.43	□□□□□ -1.7
GCN4	YEL009C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
GCN4	YEL009C	PUN1	Q06991	263 aa		4.43	□□□□□ -1.7
GCN4	YEL009C	SRS2	P12954	1174 aa		4.42	□□□□□ -1.7
GCN4	YEL009C	SMC1	P32908	1225 aa		4.42	□□□□□ -1.7
GCN4	YEL009C	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.42	□□□□□ -1.7

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