RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636351.1

CLN3-247, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5

Gene CLN3, Length 1,292 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-247ENST00000636351 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.45■■□□□ 1.66
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CLN3-247ENST00000636351 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
CLN3-247ENST00000636351 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.41■■□□□ 1.66
CLN3-247ENST00000636351 NRAPQ86VF7 1730 aa25.4■■□□□ 1.66
CLN3-247ENST00000636351 KRT27Q7Z3Y8 459 aa25.4■■□□□ 1.66
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CLN3-247ENST00000636351 BTG4Q9NY30 223 aa25.4■■□□□ 1.66
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CLN3-247ENST00000636351 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CLN3-247ENST00000636351 NLRP6P59044 892 aa24.97■■□□□ 1.59
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CLN3-247ENST00000636351 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CLN3-247ENST00000636351 PIK3C2AO00443 1686 aa24.93■■□□□ 1.58
CLN3-247ENST00000636351 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.93■■□□□ 1.58
CLN3-247ENST00000636351 RREB1Q92766 1687 aa24.92■■□□□ 1.58
CLN3-247ENST00000636351 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.91■■□□□ 1.581e-9■■■■□ 22.4
CLN3-247ENST00000636351 TESK2Q96S53 571 aa24.91■■□□□ 1.58
CLN3-247ENST00000636351 SLC24A1O60721 1099 aa24.9■■□□□ 1.58
CLN3-247ENST00000636351 NUP188Q5SRE5 1749 aa24.89■■□□□ 1.58
CLN3-247ENST00000636351 TMF1P82094 1093 aa24.88■■□□□ 1.57
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