RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619998.1

GGTLC3-201, Transcript of gamma-glutamyltransferase light chain family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene GGTLC3, Length 968 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3-201ENST00000619998 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa29.32■■■□□ 2.28
GGTLC3-201ENST00000619998 CABLES1Q8TDN4 633 aa29.32■■■□□ 2.28
GGTLC3-201ENST00000619998 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
GGTLC3-201ENST00000619998 TESK2Q96S53 571 aa29.3■■■□□ 2.28
GGTLC3-201ENST00000619998 USP21Q9UK80 565 aa29.3■■■□□ 2.28
GGTLC3-201ENST00000619998 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
GGTLC3-201ENST00000619998 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
GGTLC3-201ENST00000619998 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
GGTLC3-201ENST00000619998 USP47Q96K76 1375 aa29.27■■■□□ 2.28
GGTLC3-201ENST00000619998 RXRBP28702 533 aa29.27■■■□□ 2.28
GGTLC3-201ENST00000619998 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
GGTLC3-201ENST00000619998 USP6P35125 1406 aa29.25■■■□□ 2.27
GGTLC3-201ENST00000619998 PLEKHG5O94827 1062 aa29.24■■■□□ 2.27
GGTLC3-201ENST00000619998 ABTB2Q8N961 1025 aa29.24■■■□□ 2.27
GGTLC3-201ENST00000619998 ABCA3Q99758 1704 aa29.23■■■□□ 2.27
GGTLC3-201ENST00000619998 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
GGTLC3-201ENST00000619998 BCL9LQ86UU0 1499 aa29.23■■■□□ 2.27
GGTLC3-201ENST00000619998 SLIT2O94813 1529 aa29.22■■■□□ 2.27
GGTLC3-201ENST00000619998 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
GGTLC3-201ENST00000619998 SSH2Q76I76 1423 aa29.2■■■□□ 2.27
GGTLC3-201ENST00000619998 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
GGTLC3-201ENST00000619998 NLRP13Q86W25 1043 aa29.19■■■□□ 2.26
GGTLC3-201ENST00000619998 UNC5CLQ8IV45 518 aa29.19■■■□□ 2.26
GGTLC3-201ENST00000619998 ATRNO75882 1429 aa29.19■■■□□ 2.26
GGTLC3-201ENST00000619998 FAM83GA6ND36 823 aa29.17■■■□□ 2.26
GGTLC3-201ENST00000619998 TMF1P82094 1093 aa29.17■■■□□ 2.26
GGTLC3-201ENST00000619998 NUTM2GQ5VZR2 741 aa29.17■■■□□ 2.26
GGTLC3-201ENST00000619998 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa29.17■■■□□ 2.26
GGTLC3-201ENST00000619998 USP19O94966 1318 aa29.16■■■□□ 2.26
GGTLC3-201ENST00000619998 NINLQ9Y2I6 1382 aa29.15■■■□□ 2.26
GGTLC3-201ENST00000619998 TMC1Q8TDI8 760 aa29.15■■■□□ 2.26
GGTLC3-201ENST00000619998 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
GGTLC3-201ENST00000619998 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa29.14■■■□□ 2.25
GGTLC3-201ENST00000619998 TTC21AQ8NDW8 1320 aa29.14■■■□□ 2.25
GGTLC3-201ENST00000619998 CDCA8Q53HL2 280 aa29.13■■■□□ 2.25
GGTLC3-201ENST00000619998 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa29.13■■■□□ 2.25
GGTLC3-201ENST00000619998 TERF2IPQ9NYB0 399 aa29.13■■■□□ 2.25
GGTLC3-201ENST00000619998 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
GGTLC3-201ENST00000619998 AKAP12Q02952 1782 aa29.13■■■□□ 2.25
GGTLC3-201ENST00000619998 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
GGTLC3-201ENST00000619998 NLRP6P59044 892 aa29.11■■■□□ 2.25
GGTLC3-201ENST00000619998 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
GGTLC3-201ENST00000619998 PRDM11Q9NQV5 511 aa29.11■■■□□ 2.25
GGTLC3-201ENST00000619998 NWD2Q9ULI1 1742 aa29.11■■■□□ 2.25
GGTLC3-201ENST00000619998 CD163L1Q9NR16 1453 aa29.1■■■□□ 2.25
GGTLC3-201ENST00000619998 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
GGTLC3-201ENST00000619998 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
GGTLC3-201ENST00000619998 KIAA0232Q92628 1395 aa29.09■■■□□ 2.25
GGTLC3-201ENST00000619998 GCP02774 474 aa29.08■■■□□ 2.25
GGTLC3-201ENST00000619998 VPS72Q15906 364 aa29.08■■■□□ 2.25
GGTLC3-201ENST00000619998 BTG4Q9NY30 223 aa29.08■■■□□ 2.25
GGTLC3-201ENST00000619998 PLCH1Q4KWH8 1693 aa29.08■■■□□ 2.25
GGTLC3-201ENST00000619998 CPDO75976 1380 aa29.07■■■□□ 2.24
GGTLC3-201ENST00000619998 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
GGTLC3-201ENST00000619998 MON2Q7Z3U7 1717 aa29.06■■■□□ 2.24
GGTLC3-201ENST00000619998 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP29.05■■■□□ 2.24
GGTLC3-201ENST00000619998 NRKQ7Z2Y5 1582 aa29.05■■■□□ 2.24
GGTLC3-201ENST00000619998 RGS12O14924 1447 aa29.04■■■□□ 2.24
GGTLC3-201ENST00000619998 PIK3C2AO00443 1686 aa29.04■■■□□ 2.24
GGTLC3-201ENST00000619998 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
GGTLC3-201ENST00000619998 A0A1W2PP64 1363 aa29.03■■■□□ 2.24
GGTLC3-201ENST00000619998 SLIT3O75094 1523 aa29.03■■■□□ 2.24
GGTLC3-201ENST00000619998 KCNH5Q8NCM2 988 aa29.01■■■□□ 2.23
GGTLC3-201ENST00000619998 USP31Q70CQ4 1352 aa29.01■■■□□ 2.23
GGTLC3-201ENST00000619998 CHRNA2Q15822 529 aa29■■■□□ 2.23
GGTLC3-201ENST00000619998 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP28.99■■■□□ 2.23
GGTLC3-201ENST00000619998 NRAPQ86VF7 1730 aa28.98■■■□□ 2.23
GGTLC3-201ENST00000619998 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
GGTLC3-201ENST00000619998 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa28.98■■■□□ 2.23
GGTLC3-201ENST00000619998 GLI3P10071 1580 aa28.97■■■□□ 2.23
GGTLC3-201ENST00000619998 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
GGTLC3-201ENST00000619998 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
GGTLC3-201ENST00000619998 AATKQ6ZMQ8 1374 aa28.94■■■□□ 2.22
GGTLC3-201ENST00000619998 NME9Q86XW9 330 aa28.94■■■□□ 2.22
GGTLC3-201ENST00000619998 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa28.93■■■□□ 2.22
GGTLC3-201ENST00000619998 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa28.93■■■□□ 2.22
GGTLC3-201ENST00000619998 EVA1CP58658 441 aa28.91■■■□□ 2.22
GGTLC3-201ENST00000619998 ARHGEF25Q86VW2 580 aa28.91■■■□□ 2.22
GGTLC3-201ENST00000619998 USP54Q70EL1 1684 aa28.9■■■□□ 2.22
GGTLC3-201ENST00000619998 LMO7Q8WWI1 1683 aa28.9■■■□□ 2.22
GGTLC3-201ENST00000619998 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa28.9■■■□□ 2.22
GGTLC3-201ENST00000619998 ZRANB1Q9UGI0 708 aa28.9■■■□□ 2.22
GGTLC3-201ENST00000619998 STRN4Q9NRL3 753 aa28.89■■■□□ 2.22
GGTLC3-201ENST00000619998 SEPT12Q8IYM1 358 aa28.87■■■□□ 2.21
GGTLC3-201ENST00000619998 NFAT5O94916 1531 aa28.87■■■□□ 2.21
GGTLC3-201ENST00000619998 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa28.87■■■□□ 2.21
GGTLC3-201ENST00000619998 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP28.86■■■□□ 2.21
GGTLC3-201ENST00000619998 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa28.86■■■□□ 2.21
GGTLC3-201ENST00000619998 OVOS2Q6IE36 1432 aa28.86■■■□□ 2.21
GGTLC3-201ENST00000619998 ZBTB7CA1YPR0 619 aa28.85■■■□□ 2.21
GGTLC3-201ENST00000619998 SOX12O15370 315 aa28.85■■■□□ 2.21
GGTLC3-201ENST00000619998 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
GGTLC3-201ENST00000619998 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
GGTLC3-201ENST00000619998 COG3Q96JB2 828 aa28.83■■■□□ 2.21
GGTLC3-201ENST00000619998 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
GGTLC3-201ENST00000619998 ABCC6O95255 1503 aa28.81■■■□□ 2.2
GGTLC3-201ENST00000619998 COL18A1P39060 1754 aa28.8■■■□□ 2.2
GGTLC3-201ENST00000619998 MYOM1P52179 1685 aa28.8■■■□□ 2.2
GGTLC3-201ENST00000619998 AXIN2Q9Y2T1 843 aa28.8■■■□□ 2.2
GGTLC3-201ENST00000619998 FYB1O15117 783 aa28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms