RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610893.4

LTBP4-232, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene LTBP4, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4-232ENST00000610893 ALS2Q96Q42 1657 aa28.55■■■□□ 2.16
LTBP4-232ENST00000610893 NEUROD1Q13562 356 aa28.55■■■□□ 2.16
LTBP4-232ENST00000610893 GLI3P10071 1580 aa28.54■■■□□ 2.16
LTBP4-232ENST00000610893 BTG4Q9NY30 223 aa28.54■■■□□ 2.16
LTBP4-232ENST00000610893 ITSN1Q15811 1721 aa28.53■■■□□ 2.16
LTBP4-232ENST00000610893 NWD2Q9ULI1 1742 aa28.53■■■□□ 2.16
LTBP4-232ENST00000610893 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
LTBP4-232ENST00000610893 SEPT12Q8IYM1 358 aa28.53■■■□□ 2.16
LTBP4-232ENST00000610893 ABCA3Q99758 1704 aa28.52■■■□□ 2.16
LTBP4-232ENST00000610893 PRDM11Q9NQV5 511 aa28.5■■■□□ 2.15
LTBP4-232ENST00000610893 PLCH1Q4KWH8 1693 aa28.48■■■□□ 2.15
LTBP4-232ENST00000610893 CABP2Q9NPB3 220 aa28.48■■■□□ 2.15
LTBP4-232ENST00000610893 EP400Q96L91 3159 aa28.48■■■□□ 2.15
LTBP4-232ENST00000610893 ABTB2Q8N961 1025 aa28.45■■■□□ 2.14
LTBP4-232ENST00000610893 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
LTBP4-232ENST00000610893 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa28.43■■■□□ 2.14
LTBP4-232ENST00000610893 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa28.43■■■□□ 2.14
LTBP4-232ENST00000610893 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
LTBP4-232ENST00000610893 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
LTBP4-232ENST00000610893 NUTM2GQ5VZR2 741 aa28.43■■■□□ 2.14
LTBP4-232ENST00000610893 KRT27Q7Z3Y8 459 aa28.43■■■□□ 2.14
LTBP4-232ENST00000610893 EVC2Q86UK5 1308 aa28.43■■■□□ 2.14
LTBP4-232ENST00000610893 KIAA0232Q92628 1395 aa28.42■■■□□ 2.14
LTBP4-232ENST00000610893 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
LTBP4-232ENST00000610893 CABP1Q9NZU7 370 aa28.41■■■□□ 2.14
LTBP4-232ENST00000610893 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa28.41■■■□□ 2.14
LTBP4-232ENST00000610893 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa28.41■■■□□ 2.14
LTBP4-232ENST00000610893 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
LTBP4-232ENST00000610893 NLRP13Q86W25 1043 aa28.4■■■□□ 2.14
LTBP4-232ENST00000610893 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
LTBP4-232ENST00000610893 A0A0G2JS52 829 aa28.39■■■□□ 2.14
LTBP4-232ENST00000610893 MYT1Q01538 1121 aa28.39■■■□□ 2.14
LTBP4-232ENST00000610893 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa28.38■■■□□ 2.13
LTBP4-232ENST00000610893 CHRNA2Q15822 529 aa28.37■■■□□ 2.13
LTBP4-232ENST00000610893 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.36■■■□□ 2.13
LTBP4-232ENST00000610893 NRAPQ86VF7 1730 aa28.36■■■□□ 2.13
LTBP4-232ENST00000610893 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
LTBP4-232ENST00000610893 USP19O94966 1318 aa28.36■■■□□ 2.13
LTBP4-232ENST00000610893 ZRANB1Q9UGI0 708 aa28.35■■■□□ 2.13
LTBP4-232ENST00000610893 QRICH2Q9H0J4 1663 aa28.35■■■□□ 2.13
LTBP4-232ENST00000610893 GCP02774 474 aa28.33■■■□□ 2.13
LTBP4-232ENST00000610893 CPDO75976 1380 aa28.33■■■□□ 2.13
LTBP4-232ENST00000610893 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
LTBP4-232ENST00000610893 STRN4Q9NRL3 753 aa28.32■■■□□ 2.12
LTBP4-232ENST00000610893 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa28.32■■■□□ 2.12
LTBP4-232ENST00000610893 BRWD3Q6RI45 1802 aa28.32■■■□□ 2.12
LTBP4-232ENST00000610893 EVA1CP58658 441 aa28.31■■■□□ 2.12
LTBP4-232ENST00000610893 USP6P35125 1406 aa28.31■■■□□ 2.12
LTBP4-232ENST00000610893 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
LTBP4-232ENST00000610893 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
LTBP4-232ENST00000610893 NLRP6P59044 892 aa28.29■■■□□ 2.12
LTBP4-232ENST00000610893 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.28■■■□□ 2.12
LTBP4-232ENST00000610893 TONSLQ96HA7 1378 aa28.27■■■□□ 2.12
LTBP4-232ENST00000610893 DEFB132Q7Z7B7 95 aa28.26■■■□□ 2.11
LTBP4-232ENST00000610893 SSH2Q76I76 1423 aa28.26■■■□□ 2.11
LTBP4-232ENST00000610893 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa28.24■■■□□ 2.11
LTBP4-232ENST00000610893 BARGINQ6ZT62 677 aa28.24■■■□□ 2.11
LTBP4-232ENST00000610893 NRKQ7Z2Y5 1582 aa28.24■■■□□ 2.11
LTBP4-232ENST00000610893 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa28.22■■■□□ 2.11
LTBP4-232ENST00000610893 BAG6P46379 1132 aa28.21■■■□□ 2.11
LTBP4-232ENST00000610893 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
LTBP4-232ENST00000610893 USP35Q9P2H5 1018 aa28.21■■■□□ 2.11
LTBP4-232ENST00000610893 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa28.2■■■□□ 2.1
LTBP4-232ENST00000610893 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa28.19■■■□□ 2.1
LTBP4-232ENST00000610893 TCP11L2Q8N4U5 519 aa28.19■■■□□ 2.1
LTBP4-232ENST00000610893 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
LTBP4-232ENST00000610893 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa28.19■■■□□ 2.1
LTBP4-232ENST00000610893 TTC21AQ8NDW8 1320 aa28.18■■■□□ 2.1
LTBP4-232ENST00000610893 FAM182BQ5T319 152 aa28.18■■■□□ 2.1
LTBP4-232ENST00000610893 AATKQ6ZMQ8 1374 aa28.18■■■□□ 2.1
LTBP4-232ENST00000610893 FAM196AQ6ZSG2 479 aa28.17■■■□□ 2.1
LTBP4-232ENST00000610893 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
LTBP4-232ENST00000610893 KCNH5Q8NCM2 988 aa28.16■■■□□ 2.1
LTBP4-232ENST00000610893 PDE3BQ13370 1112 aa28.15■■■□□ 2.1
LTBP4-232ENST00000610893 LMO7Q8WWI1 1683 aa28.15■■■□□ 2.1
LTBP4-232ENST00000610893 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
LTBP4-232ENST00000610893 SLIT3O75094 1523 aa28.14■■■□□ 2.1
LTBP4-232ENST00000610893 ZBTB7CA1YPR0 619 aa28.13■■■□□ 2.09
LTBP4-232ENST00000610893 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
LTBP4-232ENST00000610893 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
LTBP4-232ENST00000610893 ARHGEF25Q86VW2 580 aa28.11■■■□□ 2.09
LTBP4-232ENST00000610893 SLC24A1O60721 1099 aa28.1■■■□□ 2.09
LTBP4-232ENST00000610893 CRB1P82279 1406 aa28.09■■■□□ 2.09
LTBP4-232ENST00000610893 PIK3C2AO00443 1686 aa28.08■■■□□ 2.09
LTBP4-232ENST00000610893 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
LTBP4-232ENST00000610893 TMC1Q8TDI8 760 aa28.08■■■□□ 2.09
LTBP4-232ENST00000610893 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
LTBP4-232ENST00000610893 TRIM37O94972 964 aa28.06■■■□□ 2.08
LTBP4-232ENST00000610893 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa28.06■■■□□ 2.08
LTBP4-232ENST00000610893 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
LTBP4-232ENST00000610893 AXIN2Q9Y2T1 843 aa28.06■■■□□ 2.08
LTBP4-232ENST00000610893 DISP2A7MBM2 1401 aa28.06■■■□□ 2.08
LTBP4-232ENST00000610893 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa28.05■■■□□ 2.08
LTBP4-232ENST00000610893 AKAP12Q02952 1782 aa28.04■■■□□ 2.08
LTBP4-232ENST00000610893 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP28.04■■■□□ 2.08
LTBP4-232ENST00000610893 TERF2IPQ9NYB0 399 aa28.04■■■□□ 2.08
LTBP4-232ENST00000610893 USP31Q70CQ4 1352 aa28.03■■■□□ 2.08
LTBP4-232ENST00000610893 WDR17Q8IZU2 1322 aa28.03■■■□□ 2.08
LTBP4-232ENST00000610893 RGPD1P0DJD0 1748 aa28.02■■■□□ 2.08
LTBP4-232ENST00000610893 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms