RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605847.5

NEDD8-MDP1-204, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD8-MDP1, Length 758 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.96■■□□□ 1.27
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PRDM11Q9NQV5 511 aa22.96■■□□□ 1.27
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 APBA3O96018 575 aa22.95■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.95■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.94■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.94■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.93■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.92■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NBPF14Q5TI25 921 aa22.92■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.91■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.9■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 STRN4Q9NRL3 753 aa22.9■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ALS2Q96Q42 1657 aa22.9■■□□□ 1.26
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PDE3BQ13370 1112 aa22.88■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DLC1Q96QB1 1528 aa22.87■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 USP35Q9P2H5 1018 aa22.87■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CHRNA2Q15822 529 aa22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SPON1Q9HCB6 807 aa22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KIAA0232Q92628 1395 aa22.85■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.84■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 EVA1CP58658 441 aa22.83■■□□□ 1.25
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.82■■□□□ 1.24
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 WASLO00401 505 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa22.8■■□□□ 1.24
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KCNQ2O43526 872 aa22.8■■□□□ 1.24
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 BARGINQ6ZT62 677 aa22.8■■□□□ 1.24
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RREB1Q92766 1687 aa22.8■■□□□ 1.24
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NINLQ9Y2I6 1382 aa22.78■■□□□ 1.24
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.77■■□□□ 1.24
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.76■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TCP11L2Q8N4U5 519 aa22.75■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SSH2Q76I76 1423 aa22.74■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ATP7BP35670 1465 aa22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ADGRB1O14514 1584 aa22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ITSN1Q15811 1721 aa22.69■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.68■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ABTB2Q8N961 1025 aa22.67■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa22.65■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ACEP12821 1306 aa22.64■■□□□ 1.22
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.64■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa22.64■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 OVOS2Q6IE36 1432 aa22.64■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CPDO75976 1380 aa22.63■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PLSCR1O15162 318 aa22.63■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.63■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NRKQ7Z2Y5 1582 aa22.63■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CDK19Q9BWU1 502 aa22.62■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NLRP13Q86W25 1043 aa22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LMO7Q8WWI1 1683 aa22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZBTB7AO95365 584 aa22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DDB1Q16531 1140 aa22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CRB1P82279 1406 aa22.58■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GCP02774 474 aa22.58■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 STAC3Q96MF2 364 aa22.58■■□□□ 1.21
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 USP19O94966 1318 aa22.57■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.57■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.56■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.55■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CASZ1Q86V15 1759 aa22.53■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa22.53■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 STK32BQ9NY57 414 aa22.53■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PEAK1Q9H792 1746 aa22.52■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PTGER2P43116 358 aa22.52■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa22.52■■□□□ 1.2
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SYT17Q9BSW7 474 aa22.51■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MYOM1P52179 1685 aa22.5■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LRRC37A3O60309 1634 aa22.49■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.49■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PROM2Q8N271 834 aa22.49■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C1QTNF8P60827 252 aa22.48■■□□□ 1.19
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
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