RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591848.1

AFG3L2-204, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 2, humanhuman

TSL 3

Gene AFG3L2, Length 446 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2-204ENST00000591848 ALS2Q96Q42 1657 aa24.78■■□□□ 1.56
AFG3L2-204ENST00000591848 ABCA3Q99758 1704 aa24.78■■□□□ 1.56
AFG3L2-204ENST00000591848 NWD2Q9ULI1 1742 aa24.76■■□□□ 1.55
AFG3L2-204ENST00000591848 BTG4Q9NY30 223 aa24.76■■□□□ 1.55
AFG3L2-204ENST00000591848 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
AFG3L2-204ENST00000591848 PLCH1Q4KWH8 1693 aa24.75■■□□□ 1.55
AFG3L2-204ENST00000591848 CCDC125Q86Z20 511 aa24.74■■□□□ 1.55
AFG3L2-204ENST00000591848 CABP2Q9NPB3 220 aa24.74■■□□□ 1.55
AFG3L2-204ENST00000591848 GLI3P10071 1580 aa24.74■■□□□ 1.55
AFG3L2-204ENST00000591848 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.73■■□□□ 1.55
AFG3L2-204ENST00000591848 SEPT12Q8IYM1 358 aa24.73■■□□□ 1.55
AFG3L2-204ENST00000591848 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.73■■□□□ 1.55
AFG3L2-204ENST00000591848 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
AFG3L2-204ENST00000591848 ABTB2Q8N961 1025 aa24.71■■□□□ 1.55
AFG3L2-204ENST00000591848 A0A0G2JS52 829 aa24.7■■□□□ 1.54
AFG3L2-204ENST00000591848 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
AFG3L2-204ENST00000591848 MYT1Q01538 1121 aa24.7■■□□□ 1.54
AFG3L2-204ENST00000591848 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.69■■□□□ 1.54
AFG3L2-204ENST00000591848 EVC2Q86UK5 1308 aa24.69■■□□□ 1.54
AFG3L2-204ENST00000591848 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
AFG3L2-204ENST00000591848 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.69■■□□□ 1.54
AFG3L2-204ENST00000591848 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.68■■□□□ 1.54
AFG3L2-204ENST00000591848 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.68■■□□□ 1.54
AFG3L2-204ENST00000591848 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
AFG3L2-204ENST00000591848 CABP1Q9NZU7 370 aa24.67■■□□□ 1.54
AFG3L2-204ENST00000591848 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
AFG3L2-204ENST00000591848 CHRNA2Q15822 529 aa24.65■■□□□ 1.54
AFG3L2-204ENST00000591848 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
AFG3L2-204ENST00000591848 KRT27Q7Z3Y8 459 aa24.65■■□□□ 1.54
AFG3L2-204ENST00000591848 NLRP13Q86W25 1043 aa24.65■■□□□ 1.54
AFG3L2-204ENST00000591848 KIAA0232Q92628 1395 aa24.65■■□□□ 1.54
AFG3L2-204ENST00000591848 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.64■■□□□ 1.53
AFG3L2-204ENST00000591848 BRWD3Q6RI45 1802 aa24.63■■□□□ 1.53
AFG3L2-204ENST00000591848 NRAPQ86VF7 1730 aa24.62■■□□□ 1.53
AFG3L2-204ENST00000591848 EVA1CP58658 441 aa24.62■■□□□ 1.53
AFG3L2-204ENST00000591848 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
AFG3L2-204ENST00000591848 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
AFG3L2-204ENST00000591848 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa24.61■■□□□ 1.53
AFG3L2-204ENST00000591848 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa24.61■■□□□ 1.53
AFG3L2-204ENST00000591848 STRN4Q9NRL3 753 aa24.61■■□□□ 1.53
AFG3L2-204ENST00000591848 TONSLQ96HA7 1378 aa24.61■■□□□ 1.53
AFG3L2-204ENST00000591848 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.59■■□□□ 1.53
AFG3L2-204ENST00000591848 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
AFG3L2-204ENST00000591848 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
AFG3L2-204ENST00000591848 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
AFG3L2-204ENST00000591848 GCP02774 474 aa24.57■■□□□ 1.52
AFG3L2-204ENST00000591848 NLRP6P59044 892 aa24.57■■□□□ 1.52
AFG3L2-204ENST00000591848 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.57■■□□□ 1.52
AFG3L2-204ENST00000591848 USP19O94966 1318 aa24.56■■□□□ 1.52
AFG3L2-204ENST00000591848 USP6P35125 1406 aa24.55■■□□□ 1.52
AFG3L2-204ENST00000591848 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa24.55■■□□□ 1.52
AFG3L2-204ENST00000591848 CPDO75976 1380 aa24.53■■□□□ 1.52
AFG3L2-204ENST00000591848 ZBTB7CA1YPR0 619 aa24.52■■□□□ 1.52
AFG3L2-204ENST00000591848 USP35Q9P2H5 1018 aa24.52■■□□□ 1.52
AFG3L2-204ENST00000591848 DEFB132Q7Z7B7 95 aa24.5■■□□□ 1.51
AFG3L2-204ENST00000591848 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.5■■□□□ 1.51
AFG3L2-204ENST00000591848 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
AFG3L2-204ENST00000591848 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.48■■□□□ 1.51
AFG3L2-204ENST00000591848 SSH2Q76I76 1423 aa24.47■■□□□ 1.51
AFG3L2-204ENST00000591848 BAG6P46379 1132 aa24.47■■□□□ 1.51
AFG3L2-204ENST00000591848 FAM182BQ5T319 152 aa24.47■■□□□ 1.51
AFG3L2-204ENST00000591848 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa24.46■■□□□ 1.51
AFG3L2-204ENST00000591848 EP400Q96L91 3159 aa24.46■■□□□ 1.51
AFG3L2-204ENST00000591848 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.46■■□□□ 1.51
AFG3L2-204ENST00000591848 BARGINQ6ZT62 677 aa24.46■■□□□ 1.51
AFG3L2-204ENST00000591848 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
AFG3L2-204ENST00000591848 TTC21AQ8NDW8 1320 aa24.45■■□□□ 1.5
AFG3L2-204ENST00000591848 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.45■■□□□ 1.5
AFG3L2-204ENST00000591848 PDE3BQ13370 1112 aa24.44■■□□□ 1.5
AFG3L2-204ENST00000591848 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.44■■□□□ 1.5
AFG3L2-204ENST00000591848 TMC1Q8TDI8 760 aa24.44■■□□□ 1.5
AFG3L2-204ENST00000591848 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
AFG3L2-204ENST00000591848 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa24.43■■□□□ 1.5
AFG3L2-204ENST00000591848 FAM196AQ6ZSG2 479 aa24.42■■□□□ 1.5
AFG3L2-204ENST00000591848 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.42■■□□□ 1.5
AFG3L2-204ENST00000591848 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
AFG3L2-204ENST00000591848 AKAP12Q02952 1782 aa24.41■■□□□ 1.5
AFG3L2-204ENST00000591848 LMO7Q8WWI1 1683 aa24.4■■□□□ 1.5
AFG3L2-204ENST00000591848 SOX12O15370 315 aa24.4■■□□□ 1.5
AFG3L2-204ENST00000591848 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
AFG3L2-204ENST00000591848 SLIT3O75094 1523 aa24.4■■□□□ 1.5
AFG3L2-204ENST00000591848 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.39■■□□□ 1.49
AFG3L2-204ENST00000591848 PIK3C2AO00443 1686 aa24.39■■□□□ 1.49
AFG3L2-204ENST00000591848 SLC24A1O60721 1099 aa24.38■■□□□ 1.49
AFG3L2-204ENST00000591848 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
AFG3L2-204ENST00000591848 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24.37■■□□□ 1.49
AFG3L2-204ENST00000591848 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.37■■□□□ 1.49
AFG3L2-204ENST00000591848 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
AFG3L2-204ENST00000591848 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.37■■□□□ 1.49
AFG3L2-204ENST00000591848 CRB1P82279 1406 aa24.36■■□□□ 1.49
AFG3L2-204ENST00000591848 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
AFG3L2-204ENST00000591848 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.36■■□□□ 1.49
AFG3L2-204ENST00000591848 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.35■■□□□ 1.49
AFG3L2-204ENST00000591848 TRIM37O94972 964 aa24.35■■□□□ 1.49
AFG3L2-204ENST00000591848 AXIN2Q9Y2T1 843 aa24.34■■□□□ 1.49
AFG3L2-204ENST00000591848 RGPD1P0DJD0 1748 aa24.34■■□□□ 1.49
AFG3L2-204ENST00000591848 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa24.33■■□□□ 1.49
AFG3L2-204ENST00000591848 WDR17Q8IZU2 1322 aa24.31■■□□□ 1.48
AFG3L2-204ENST00000591848 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.3■■□□□ 1.48
AFG3L2-204ENST00000591848 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms