RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591387.5

CTIF-209, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 859 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-209ENST00000591387 PLEKHG5O94827 1062 aa25.79■■□□□ 1.72
CTIF-209ENST00000591387 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
CTIF-209ENST00000591387 ACEP12821 1306 aa25.79■■□□□ 1.72
CTIF-209ENST00000591387 PLCH1Q4KWH8 1693 aa25.78■■□□□ 1.72
CTIF-209ENST00000591387 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.78■■□□□ 1.72
CTIF-209ENST00000591387 FAM83GA6ND36 823 aa25.76■■□□□ 1.71
CTIF-209ENST00000591387 VPS72Q15906 364 aa25.76■■□□□ 1.71
CTIF-209ENST00000591387 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.76■■□□□ 1.71
CTIF-209ENST00000591387 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa25.75■■□□□ 1.71
CTIF-209ENST00000591387 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.74■■□□□ 1.71
CTIF-209ENST00000591387 CABP2Q9NPB3 220 aa25.74■■□□□ 1.71
CTIF-209ENST00000591387 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa25.73■■□□□ 1.71
CTIF-209ENST00000591387 EVC2Q86UK5 1308 aa25.73■■□□□ 1.71
CTIF-209ENST00000591387 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
CTIF-209ENST00000591387 GLI3P10071 1580 aa25.73■■□□□ 1.71
CTIF-209ENST00000591387 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
CTIF-209ENST00000591387 TONSLQ96HA7 1378 aa25.72■■□□□ 1.71
CTIF-209ENST00000591387 BTG4Q9NY30 223 aa25.68■■□□□ 1.7
CTIF-209ENST00000591387 NRAPQ86VF7 1730 aa25.68■■□□□ 1.7
CTIF-209ENST00000591387 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
CTIF-209ENST00000591387 ABTB2Q8N961 1025 aa25.67■■□□□ 1.7
CTIF-209ENST00000591387 PRDM11Q9NQV5 511 aa25.67■■□□□ 1.7
CTIF-209ENST00000591387 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
CTIF-209ENST00000591387 CABP1Q9NZU7 370 aa25.66■■□□□ 1.7
CTIF-209ENST00000591387 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
CTIF-209ENST00000591387 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.64■■□□□ 1.7
CTIF-209ENST00000591387 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.64■■□□□ 1.69
CTIF-209ENST00000591387 NUTM2GQ5VZR2 741 aa25.63■■□□□ 1.69
CTIF-209ENST00000591387 NLRP13Q86W25 1043 aa25.63■■□□□ 1.69
CTIF-209ENST00000591387 CCDC125Q86Z20 511 aa25.63■■□□□ 1.69
CTIF-209ENST00000591387 SEPT12Q8IYM1 358 aa25.63■■□□□ 1.69
CTIF-209ENST00000591387 KIAA0232Q92628 1395 aa25.62■■□□□ 1.69
CTIF-209ENST00000591387 BRWD3Q6RI45 1802 aa25.62■■□□□ 1.69
CTIF-209ENST00000591387 USP6P35125 1406 aa25.61■■□□□ 1.69
CTIF-209ENST00000591387 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
CTIF-209ENST00000591387 USP19O94966 1318 aa25.6■■□□□ 1.69
CTIF-209ENST00000591387 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
CTIF-209ENST00000591387 CPDO75976 1380 aa25.57■■□□□ 1.68
CTIF-209ENST00000591387 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa25.57■■□□□ 1.68
CTIF-209ENST00000591387 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa25.57■■□□□ 1.68
CTIF-209ENST00000591387 NRKQ7Z2Y5 1582 aa25.56■■□□□ 1.68
CTIF-209ENST00000591387 SSH2Q76I76 1423 aa25.55■■□□□ 1.68
CTIF-209ENST00000591387 GCP02774 474 aa25.55■■□□□ 1.68
CTIF-209ENST00000591387 CHRNA2Q15822 529 aa25.55■■□□□ 1.68
CTIF-209ENST00000591387 AKAP12Q02952 1782 aa25.54■■□□□ 1.68
CTIF-209ENST00000591387 KRT27Q7Z3Y8 459 aa25.54■■□□□ 1.68
CTIF-209ENST00000591387 NLRP6P59044 892 aa25.53■■□□□ 1.68
CTIF-209ENST00000591387 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
CTIF-209ENST00000591387 A0A0G2JS52 829 aa25.51■■□□□ 1.67
CTIF-209ENST00000591387 MYT1Q01538 1121 aa25.51■■□□□ 1.67
CTIF-209ENST00000591387 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
CTIF-209ENST00000591387 EVA1CP58658 441 aa25.5■■□□□ 1.67
CTIF-209ENST00000591387 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
CTIF-209ENST00000591387 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa25.5■■□□□ 1.67
CTIF-209ENST00000591387 EP400Q96L91 3159 aa25.5■■□□□ 1.67
CTIF-209ENST00000591387 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
CTIF-209ENST00000591387 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa25.49■■□□□ 1.67
CTIF-209ENST00000591387 TTC21AQ8NDW8 1320 aa25.49■■□□□ 1.67
CTIF-209ENST00000591387 SLC24A1O60721 1099 aa25.49■■□□□ 1.67
CTIF-209ENST00000591387 STRN4Q9NRL3 753 aa25.49■■□□□ 1.67
CTIF-209ENST00000591387 LMO7Q8WWI1 1683 aa25.48■■□□□ 1.67
CTIF-209ENST00000591387 SLIT3O75094 1523 aa25.48■■□□□ 1.67
CTIF-209ENST00000591387 PIK3C2AO00443 1686 aa25.48■■□□□ 1.67
CTIF-209ENST00000591387 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa25.48■■□□□ 1.67
CTIF-209ENST00000591387 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
CTIF-209ENST00000591387 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa25.46■■□□□ 1.67
CTIF-209ENST00000591387 MON2Q7Z3U7 1717 aa25.45■■□□□ 1.66
CTIF-209ENST00000591387 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.44■■□□□ 1.66
CTIF-209ENST00000591387 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
CTIF-209ENST00000591387 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.44■■□□□ 1.66
CTIF-209ENST00000591387 BARGINQ6ZT62 677 aa25.43■■□□□ 1.66
CTIF-209ENST00000591387 KCNH5Q8NCM2 988 aa25.43■■□□□ 1.66
CTIF-209ENST00000591387 AATKQ6ZMQ8 1374 aa25.43■■□□□ 1.66
CTIF-209ENST00000591387 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.4■■□□□ 1.66
CTIF-209ENST00000591387 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CTIF-209ENST00000591387 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CTIF-209ENST00000591387 TMC1Q8TDI8 760 aa25.4■■□□□ 1.66
CTIF-209ENST00000591387 TESK2Q96S53 571 aa25.4■■□□□ 1.66
CTIF-209ENST00000591387 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CTIF-209ENST00000591387 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CTIF-209ENST00000591387 TCP11L2Q8N4U5 519 aa25.39■■□□□ 1.66
CTIF-209ENST00000591387 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.38■■□□□ 1.65
CTIF-209ENST00000591387 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.38■■□□□ 1.65
CTIF-209ENST00000591387 USP35Q9P2H5 1018 aa25.38■■□□□ 1.65
CTIF-209ENST00000591387 CD163L1Q9NR16 1453 aa25.38■■□□□ 1.65
CTIF-209ENST00000591387 COL18A1P39060 1754 aa25.37■■□□□ 1.65
CTIF-209ENST00000591387 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.37■■□□□ 1.65
CTIF-209ENST00000591387 USP31Q70CQ4 1352 aa25.36■■□□□ 1.65
CTIF-209ENST00000591387 ZBTB7CA1YPR0 619 aa25.36■■□□□ 1.65
CTIF-209ENST00000591387 ARHGEF25Q86VW2 580 aa25.36■■□□□ 1.65
CTIF-209ENST00000591387 ZRANB1Q9UGI0 708 aa25.36■■□□□ 1.65
CTIF-209ENST00000591387 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.35■■□□□ 1.65
CTIF-209ENST00000591387 CRB1P82279 1406 aa25.35■■□□□ 1.65
CTIF-209ENST00000591387 USP54Q70EL1 1684 aa25.34■■□□□ 1.65
CTIF-209ENST00000591387 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.34■■□□□ 1.65
CTIF-209ENST00000591387 RGPD1P0DJD0 1748 aa25.33■■□□□ 1.65
CTIF-209ENST00000591387 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
CTIF-209ENST00000591387 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.33■■□□□ 1.65
CTIF-209ENST00000591387 BAG6P46379 1132 aa25.32■■□□□ 1.64
CTIF-209ENST00000591387 PDE3BQ13370 1112 aa25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms