RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589452.1

PQLC1-210, Transcript of PQ loop repeat containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene PQLC1, Length 704 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC1-210ENST00000589452 CABP2Q9NPB3 220 aa41.36■■■■■ 4.21
PQLC1-210ENST00000589452 NBPF8Q3BBV2 869 aa41.35■■■■■ 4.21
PQLC1-210ENST00000589452 PLCH1Q4KWH8 1693 aa41.35■■■■■ 4.21
PQLC1-210ENST00000589452 PLEKHG3A1L390 1219 aa41.34■■■■■ 4.21
PQLC1-210ENST00000589452 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP41.33■■■■■ 4.21
PQLC1-210ENST00000589452 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
PQLC1-210ENST00000589452 RALGAPBQ86X10 1494 aa41.33■■■■■ 4.21
PQLC1-210ENST00000589452 GLI3P10071 1580 aa41.31■■■■■ 4.2
PQLC1-210ENST00000589452 NWD2Q9ULI1 1742 aa41.29■■■■■ 4.2
PQLC1-210ENST00000589452 NUTM2GQ5VZR2 741 aa41.28■■■■■ 4.2
PQLC1-210ENST00000589452 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa41.27■■■■■ 4.2
PQLC1-210ENST00000589452 VPS72Q15906 364 aa41.27■■■■■ 4.2
PQLC1-210ENST00000589452 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa41.26■■■■■ 4.19
PQLC1-210ENST00000589452 ATAD2Q6PL18 1390 aa41.25■■■■■ 4.19
PQLC1-210ENST00000589452 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
PQLC1-210ENST00000589452 BTG4Q9NY30 223 aa41.22■■■■■ 4.19
PQLC1-210ENST00000589452 CABP1Q9NZU7 370 aa41.19■■■■■ 4.18
PQLC1-210ENST00000589452 TONSLQ96HA7 1378 aa41.19■■■■■ 4.18
PQLC1-210ENST00000589452 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP41.19■■■■■ 4.18
PQLC1-210ENST00000589452 EVC2Q86UK5 1308 aa41.18■■■■■ 4.18
PQLC1-210ENST00000589452 PRDM11Q9NQV5 511 aa41.17■■■■■ 4.18
PQLC1-210ENST00000589452 NRAPQ86VF7 1730 aa41.17■■■■■ 4.18
PQLC1-210ENST00000589452 ABTB2Q8N961 1025 aa41.15■■■■■ 4.18
PQLC1-210ENST00000589452 SEPT12Q8IYM1 358 aa41.14■■■■■ 4.18
PQLC1-210ENST00000589452 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP41.14■■■■■ 4.18
PQLC1-210ENST00000589452 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.17
PQLC1-210ENST00000589452 KIAA0232Q92628 1395 aa41.12■■■■■ 4.17
PQLC1-210ENST00000589452 CHRNA2Q15822 529 aa41.12■■■■■ 4.17
PQLC1-210ENST00000589452 BRWD3Q6RI45 1802 aa41.11■■■■■ 4.17
PQLC1-210ENST00000589452 CARD11Q9BXL7 1154 aa41.1■■■■■ 4.17
PQLC1-210ENST00000589452 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP41.08■■■■■ 4.17
PQLC1-210ENST00000589452 USP6P35125 1406 aa41.04■■■■■ 4.16
PQLC1-210ENST00000589452 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
PQLC1-210ENST00000589452 USP19O94966 1318 aa41.02■■■■■ 4.16
PQLC1-210ENST00000589452 NLRP13Q86W25 1043 aa41.02■■■■■ 4.16
PQLC1-210ENST00000589452 A0A0G2JS52 829 aa41.01■■■■■ 4.16
PQLC1-210ENST00000589452 MYT1Q01538 1121 aa41.01■■■■■ 4.16
PQLC1-210ENST00000589452 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa41■■■■■ 4.15
PQLC1-210ENST00000589452 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa41■■■■■ 4.15
PQLC1-210ENST00000589452 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP40.99■■■■■ 4.15
PQLC1-210ENST00000589452 NRKQ7Z2Y5 1582 aa40.99■■■■■ 4.15
PQLC1-210ENST00000589452 STRN4Q9NRL3 753 aa40.99■■■■■ 4.15
PQLC1-210ENST00000589452 GCP02774 474 aa40.96■■■■■ 4.15
PQLC1-210ENST00000589452 KRT27Q7Z3Y8 459 aa40.96■■■■■ 4.15
PQLC1-210ENST00000589452 NLRP6P59044 892 aa40.95■■■■■ 4.15
PQLC1-210ENST00000589452 SSH2Q76I76 1423 aa40.94■■■■■ 4.14
PQLC1-210ENST00000589452 CCDC125Q86Z20 511 aa40.93■■■■■ 4.14
PQLC1-210ENST00000589452 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa40.92■■■■■ 4.14
PQLC1-210ENST00000589452 CPDO75976 1380 aa40.91■■■■■ 4.14
PQLC1-210ENST00000589452 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP40.9■■■■■ 4.14
PQLC1-210ENST00000589452 EVA1CP58658 441 aa40.89■■■■■ 4.14
PQLC1-210ENST00000589452 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa40.89■■■■■ 4.14
PQLC1-210ENST00000589452 AKAP12Q02952 1782 aa40.89■■■■■ 4.14
PQLC1-210ENST00000589452 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa40.88■■■■■ 4.14
PQLC1-210ENST00000589452 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa40.88■■■■■ 4.13
PQLC1-210ENST00000589452 PIK3C2AO00443 1686 aa40.86■■■■■ 4.13
PQLC1-210ENST00000589452 ZBTB7CA1YPR0 619 aa40.86■■■■■ 4.13
PQLC1-210ENST00000589452 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP40.84■■■■■ 4.13
PQLC1-210ENST00000589452 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
PQLC1-210ENST00000589452 LMO7Q8WWI1 1683 aa40.84■■■■■ 4.13
PQLC1-210ENST00000589452 USP35Q9P2H5 1018 aa40.83■■■■■ 4.13
PQLC1-210ENST00000589452 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.13
PQLC1-210ENST00000589452 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.12
PQLC1-210ENST00000589452 SLIT3O75094 1523 aa40.82■■■■■ 4.12
PQLC1-210ENST00000589452 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa40.81■■■■■ 4.12
PQLC1-210ENST00000589452 FAM182BQ5T319 152 aa40.8■■■■■ 4.12
PQLC1-210ENST00000589452 TMC1Q8TDI8 760 aa40.79■■■■■ 4.12
PQLC1-210ENST00000589452 EP400Q96L91 3159 aa40.78■■■■■ 4.12
PQLC1-210ENST00000589452 TTC21AQ8NDW8 1320 aa40.77■■■■■ 4.12
PQLC1-210ENST00000589452 DEFB132Q7Z7B7 95 aa40.77■■■■■ 4.12
PQLC1-210ENST00000589452 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa40.76■■■■■ 4.12
PQLC1-210ENST00000589452 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
PQLC1-210ENST00000589452 PCGF6Q9BYE7 350 aa40.75■■■■■ 4.11
PQLC1-210ENST00000589452 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa40.75■■■■■ 4.11
PQLC1-210ENST00000589452 SOX12O15370 315 aa40.73■■■■■ 4.11
PQLC1-210ENST00000589452 TESK2Q96S53 571 aa40.73■■■■■ 4.11
PQLC1-210ENST00000589452 MON2Q7Z3U7 1717 aa40.73■■■■■ 4.11
PQLC1-210ENST00000589452 CD163L1Q9NR16 1453 aa40.72■■■■■ 4.11
PQLC1-210ENST00000589452 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP40.72■■■■■ 4.112e-6■□□□□ 9.5
PQLC1-210ENST00000589452 ZRANB1Q9UGI0 708 aa40.71■■■■■ 4.11
PQLC1-210ENST00000589452 AATKQ6ZMQ8 1374 aa40.71■■■■■ 4.11
PQLC1-210ENST00000589452 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP40.7■■■■■ 4.11
PQLC1-210ENST00000589452 BARGINQ6ZT62 677 aa40.69■■■■■ 4.1
PQLC1-210ENST00000589452 TCP11L2Q8N4U5 519 aa40.69■■■■■ 4.1
PQLC1-210ENST00000589452 COL18A1P39060 1754 aa40.66■■■■■ 4.1
PQLC1-210ENST00000589452 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
PQLC1-210ENST00000589452 KCNH5Q8NCM2 988 aa40.66■■■■■ 4.1
PQLC1-210ENST00000589452 ARHGEF25Q86VW2 580 aa40.65■■■■■ 4.1
PQLC1-210ENST00000589452 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP40.65■■■■■ 4.1
PQLC1-210ENST00000589452 AXIN2Q9Y2T1 843 aa40.65■■■■■ 4.1
PQLC1-210ENST00000589452 NME9Q86XW9 330 aa40.64■■■■■ 4.1
PQLC1-210ENST00000589452 CRB1P82279 1406 aa40.6■■■■■ 4.09
PQLC1-210ENST00000589452 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP40.6■■■■■ 4.09
PQLC1-210ENST00000589452 TERF2IPQ9NYB0 399 aa40.59■■■■■ 4.09
PQLC1-210ENST00000589452 A0A1W2PP64 1363 aa40.59■■■■■ 4.09
PQLC1-210ENST00000589452 USP31Q70CQ4 1352 aa40.58■■■■■ 4.09
PQLC1-210ENST00000589452 NFAT5O94916 1531 aa40.57■■■■■ 4.09
PQLC1-210ENST00000589452 RGPD5Q99666 1765 aa40.57■■■■■ 4.09
PQLC1-210ENST00000589452 PDE3BQ13370 1112 aa40.57■■■■■ 4.09
PQLC1-210ENST00000589452 USP47Q96K76 1375 aa40.57■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms