RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587269.5

SMAD2-208, Transcript of SMAD family member 2, human

TSL 3

Gene SMAD2, Length 1,042 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMAD2-208	ENST00000587269	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		42.26	■■■■■ 4.36
SMAD2-208	ENST00000587269	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		42.24	■■■■■ 4.35
SMAD2-208	ENST00000587269	BTG4	Q9NY30	223 aa		42.24	■■■■■ 4.35
SMAD2-208	ENST00000587269	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		42.23	■■■■■ 4.35
SMAD2-208	ENST00000587269	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		42.22	■■■■■ 4.35
SMAD2-208	ENST00000587269	CABP2	Q9NPB3	220 aa		42.22	■■■■■ 4.35
SMAD2-208	ENST00000587269	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	42.2	■■■■■ 4.35
SMAD2-208	ENST00000587269	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		42.2	■■■■■ 4.35
SMAD2-208	ENST00000587269	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	42.19	■■■■■ 4.34
SMAD2-208	ENST00000587269		A0A0G2JS52	829 aa		42.19	■■■■■ 4.34
SMAD2-208	ENST00000587269	MYT1	Q01538	1121 aa		42.19	■■■■■ 4.34
SMAD2-208	ENST00000587269	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		42.19	■■■■■ 4.34
SMAD2-208	ENST00000587269	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		42.18	■■■■■ 4.34
SMAD2-208	ENST00000587269	GLI3	P10071	1580 aa		42.18	■■■■■ 4.34
SMAD2-208	ENST00000587269	CCDC125	Q86Z20	511 aa		42.17	■■■■■ 4.34
SMAD2-208	ENST00000587269	ABTB2	Q8N961	1025 aa		42.15	■■■■■ 4.34
SMAD2-208	ENST00000587269	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		42.14	■■■■■ 4.34
SMAD2-208	ENST00000587269	EVC2	Q86UK5	1308 aa		42.14	■■■■■ 4.34
SMAD2-208	ENST00000587269	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		42.13	■■■■■ 4.34
SMAD2-208	ENST00000587269	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	42.13	■■■■■ 4.33
SMAD2-208	ENST00000587269	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		42.12	■■■■■ 4.33
SMAD2-208	ENST00000587269	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		42.1	■■■■■ 4.33
SMAD2-208	ENST00000587269	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	42.09	■■■■■ 4.33
SMAD2-208	ENST00000587269	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	42.08	■■■■■ 4.33
SMAD2-208	ENST00000587269	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	42.08	■■■■■ 4.33
SMAD2-208	ENST00000587269	CABP1	Q9NZU7	370 aa		42.08	■■■■■ 4.33
SMAD2-208	ENST00000587269	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	42.06	■■■■■ 4.32
SMAD2-208	ENST00000587269	KIAA0232	Q92628	1395 aa		42.05	■■■■■ 4.32
SMAD2-208	ENST00000587269	CHRNA2	Q15822	529 aa		42.04	■■■■■ 4.32
SMAD2-208	ENST00000587269	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		42.04	■■■■■ 4.32
SMAD2-208	ENST00000587269	NLRP13	Q86W25	1043 aa		42.04	■■■■■ 4.32
SMAD2-208	ENST00000587269	TONSL	Q96HA7	1378 aa		42.03	■■■■■ 4.32
SMAD2-208	ENST00000587269	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	42.03	■■■■■ 4.32
SMAD2-208	ENST00000587269	EVA1C	P58658	441 aa		42	■■■■■ 4.31
SMAD2-208	ENST00000587269	STRN4	Q9NRL3	753 aa		42	■■■■■ 4.31
SMAD2-208	ENST00000587269	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		42	■■■■■ 4.31
SMAD2-208	ENST00000587269	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	42	■■■■■ 4.31
SMAD2-208	ENST00000587269	NRAP	Q86VF7	1730 aa		41.99	■■■■■ 4.31
SMAD2-208	ENST00000587269	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		41.98	■■■■■ 4.31
SMAD2-208	ENST00000587269	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		41.97	■■■■■ 4.31
SMAD2-208	ENST00000587269	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		41.97	■■■■■ 4.31
SMAD2-208	ENST00000587269	EP400	Q96L91	3159 aa		41.97	■■■■■ 4.31
SMAD2-208	ENST00000587269	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		41.97	■■■■■ 4.31
SMAD2-208	ENST00000587269	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	41.95	■■■■■ 4.31
SMAD2-208	ENST00000587269	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	41.93	■■■■■ 4.3
SMAD2-208	ENST00000587269	NLRP6	P59044	892 aa		41.92	■■■■■ 4.3
SMAD2-208	ENST00000587269	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		41.92	■■■■■ 4.3
SMAD2-208	ENST00000587269	GC	P02774	474 aa		41.91	■■■■■ 4.3
SMAD2-208	ENST00000587269	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	41.91	■■■■■ 4.3
SMAD2-208	ENST00000587269	USP6	P35125	1406 aa		41.88	■■■■■ 4.3
SMAD2-208	ENST00000587269	USP19	O94966	1318 aa		41.88	■■■■■ 4.29
SMAD2-208	ENST00000587269	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		41.87	■■■■■ 4.29
SMAD2-208	ENST00000587269	USP35	Q9P2H5	1018 aa		41.85	■■■■■ 4.29
SMAD2-208	ENST00000587269	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		41.85	■■■■■ 4.29
SMAD2-208	ENST00000587269	CPD	O75976	1380 aa		41.83	■■■■■ 4.29
SMAD2-208	ENST00000587269	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		41.8	■■■■■ 4.28
SMAD2-208	ENST00000587269	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		41.77	■■■■■ 4.28
SMAD2-208	ENST00000587269	SSH2	Q76I76	1423 aa		41.76	■■■■■ 4.28
SMAD2-208	ENST00000587269	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	41.75	■■■■■ 4.27
SMAD2-208	ENST00000587269	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		41.74	■■■■■ 4.27
SMAD2-208	ENST00000587269	BAG6	P46379	1132 aa		41.74	■■■■■ 4.27
SMAD2-208	ENST00000587269	TMC1	Q8TDI8	760 aa		41.73	■■■■■ 4.27
SMAD2-208	ENST00000587269	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	41.73	■■■■■ 4.27
SMAD2-208	ENST00000587269	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		41.73	■■■■■ 4.27
SMAD2-208	ENST00000587269	FAM182B	Q5T319	152 aa		41.72	■■■■■ 4.27
SMAD2-208	ENST00000587269	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		41.71	■■■■■ 4.27
SMAD2-208	ENST00000587269	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		41.71	■■■■■ 4.27
SMAD2-208	ENST00000587269	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		41.71	■■■■■ 4.27
SMAD2-208	ENST00000587269	PDE3B	Q13370	1112 aa		41.7	■■■■■ 4.27
SMAD2-208	ENST00000587269	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		41.69	■■■■■ 4.26
SMAD2-208	ENST00000587269	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		41.69	■■■■■ 4.26
SMAD2-208	ENST00000587269	SOX12	O15370	315 aa		41.66	■■■■■ 4.26
SMAD2-208	ENST00000587269	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	41.66	■■■■■ 4.26
SMAD2-208	ENST00000587269	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		41.65	■■■■■ 4.26
SMAD2-208	ENST00000587269	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	41.65	■■■■■ 4.26
SMAD2-208	ENST00000587269	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		41.64	■■■■■ 4.26
SMAD2-208	ENST00000587269	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		41.63	■■■■■ 4.26
SMAD2-208	ENST00000587269	AKAP12	Q02952	1782 aa		41.63	■■■■■ 4.25
SMAD2-208	ENST00000587269	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	41.62	■■■■■ 4.25
SMAD2-208	ENST00000587269	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		41.62	■■■■■ 4.25
SMAD2-208	ENST00000587269	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	41.62	■■■■■ 4.25	1e-6	■■■□□ 19.1
SMAD2-208	ENST00000587269	PIK3C2A	O00443	1686 aa		41.61	■■■■■ 4.25
SMAD2-208	ENST00000587269	SLIT3	O75094	1523 aa		41.61	■■■■■ 4.25
SMAD2-208	ENST00000587269	SLC24A1	O60721	1099 aa		41.61	■■■■■ 4.25
SMAD2-208	ENST00000587269	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	41.6	■■■■■ 4.25
SMAD2-208	ENST00000587269	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		41.59	■■■■■ 4.25
SMAD2-208	ENST00000587269	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		41.58	■■■■■ 4.25
SMAD2-208	ENST00000587269	CRB1	P82279	1406 aa		41.56	■■■■■ 4.24
SMAD2-208	ENST00000587269	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		41.55	■■■■■ 4.24
SMAD2-208	ENST00000587269	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		41.54	■■■■■ 4.24
SMAD2-208	ENST00000587269	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		41.54	■■■■■ 4.24
SMAD2-208	ENST00000587269	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	41.54	■■■■■ 4.24
SMAD2-208	ENST00000587269	TRIM37	O94972	964 aa		41.53	■■■■■ 4.24
SMAD2-208	ENST00000587269	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		41.53	■■■■■ 4.24
SMAD2-208	ENST00000587269	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	41.53	■■■■■ 4.24
SMAD2-208	ENST00000587269	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		41.52	■■■■■ 4.24
SMAD2-208	ENST00000587269	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		41.49	■■■■■ 4.23
SMAD2-208	ENST00000587269	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		41.46	■■■■■ 4.23
SMAD2-208	ENST00000587269	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		41.46	■■■■■ 4.23
SMAD2-208	ENST00000587269	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		41.46	■■■■■ 4.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms