RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586773.5

CIRBP-211, Transcript of cold inducible RNA binding protein, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene CIRBP, Length 942 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-211ENST00000586773 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa29.13■■■□□ 2.25
CIRBP-211ENST00000586773 CABP1Q9NZU7 370 aa29.12■■■□□ 2.25
CIRBP-211ENST00000586773 SLC24A1O60721 1099 aa29.11■■■□□ 2.25
CIRBP-211ENST00000586773 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
CIRBP-211ENST00000586773 ALS2Q96Q42 1657 aa29.11■■■□□ 2.25
CIRBP-211ENST00000586773 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
CIRBP-211ENST00000586773 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
CIRBP-211ENST00000586773 ATAD2Q6PL18 1390 aa29.08■■■□□ 2.25
CIRBP-211ENST00000586773 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
CIRBP-211ENST00000586773 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
CIRBP-211ENST00000586773 ABTB2Q8N961 1025 aa29.04■■■□□ 2.24
CIRBP-211ENST00000586773 ABCA3Q99758 1704 aa29.03■■■□□ 2.24
CIRBP-211ENST00000586773 UNC5CLQ8IV45 518 aa29.02■■■□□ 2.24
CIRBP-211ENST00000586773 BCL9LQ86UU0 1499 aa29.02■■■□□ 2.24
CIRBP-211ENST00000586773 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa29.01■■■□□ 2.23
CIRBP-211ENST00000586773 SLIT2O94813 1529 aa29■■■□□ 2.23
CIRBP-211ENST00000586773 NLRP13Q86W25 1043 aa29■■■□□ 2.23
CIRBP-211ENST00000586773 ATRNO75882 1429 aa29■■■□□ 2.23
CIRBP-211ENST00000586773 NUTM2GQ5VZR2 741 aa28.99■■■□□ 2.23
CIRBP-211ENST00000586773 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
CIRBP-211ENST00000586773 USP6P35125 1406 aa28.99■■■□□ 2.23
CIRBP-211ENST00000586773 FAM83GA6ND36 823 aa28.97■■■□□ 2.23
CIRBP-211ENST00000586773 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
CIRBP-211ENST00000586773 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
CIRBP-211ENST00000586773 USP47Q96K76 1375 aa28.95■■■□□ 2.22
CIRBP-211ENST00000586773 TMC1Q8TDI8 760 aa28.94■■■□□ 2.22
CIRBP-211ENST00000586773 PRDM11Q9NQV5 511 aa28.94■■■□□ 2.22
CIRBP-211ENST00000586773 NWD2Q9ULI1 1742 aa28.94■■■□□ 2.22
CIRBP-211ENST00000586773 TESK2Q96S53 571 aa28.93■■■□□ 2.22
CIRBP-211ENST00000586773 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa28.93■■■□□ 2.22
CIRBP-211ENST00000586773 PLCH1Q4KWH8 1693 aa28.93■■■□□ 2.22
CIRBP-211ENST00000586773 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
CIRBP-211ENST00000586773 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
CIRBP-211ENST00000586773 NLRP6P59044 892 aa28.91■■■□□ 2.22
CIRBP-211ENST00000586773 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
CIRBP-211ENST00000586773 BTG4Q9NY30 223 aa28.91■■■□□ 2.22
CIRBP-211ENST00000586773 TMF1P82094 1093 aa28.9■■■□□ 2.22
CIRBP-211ENST00000586773 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
CIRBP-211ENST00000586773 VPS72Q15906 364 aa28.9■■■□□ 2.22
CIRBP-211ENST00000586773 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
CIRBP-211ENST00000586773 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
CIRBP-211ENST00000586773 RGS12O14924 1447 aa28.89■■■□□ 2.22
CIRBP-211ENST00000586773 AKAP12Q02952 1782 aa28.89■■■□□ 2.22
CIRBP-211ENST00000586773 TERF2IPQ9NYB0 399 aa28.89■■■□□ 2.22
CIRBP-211ENST00000586773 TTC21AQ8NDW8 1320 aa28.89■■■□□ 2.21
CIRBP-211ENST00000586773 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
CIRBP-211ENST00000586773 USP19O94966 1318 aa28.88■■■□□ 2.21
CIRBP-211ENST00000586773 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa28.88■■■□□ 2.21
CIRBP-211ENST00000586773 KIAA0232Q92628 1395 aa28.88■■■□□ 2.21
CIRBP-211ENST00000586773 SSH2Q76I76 1423 aa28.87■■■□□ 2.21
CIRBP-211ENST00000586773 GCP02774 474 aa28.86■■■□□ 2.21
CIRBP-211ENST00000586773 CDCA8Q53HL2 280 aa28.86■■■□□ 2.21
CIRBP-211ENST00000586773 NINLQ9Y2I6 1382 aa28.86■■■□□ 2.21
CIRBP-211ENST00000586773 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa28.85■■■□□ 2.21
CIRBP-211ENST00000586773 CPDO75976 1380 aa28.82■■■□□ 2.2
CIRBP-211ENST00000586773 NRKQ7Z2Y5 1582 aa28.81■■■□□ 2.2
CIRBP-211ENST00000586773 CHRNA2Q15822 529 aa28.81■■■□□ 2.2
CIRBP-211ENST00000586773 KCNH5Q8NCM2 988 aa28.8■■■□□ 2.2
CIRBP-211ENST00000586773 MON2Q7Z3U7 1717 aa28.8■■■□□ 2.2
CIRBP-211ENST00000586773 EVA1CP58658 441 aa28.79■■■□□ 2.2
CIRBP-211ENST00000586773 PIK3C2AO00443 1686 aa28.79■■■□□ 2.2
CIRBP-211ENST00000586773 NRAPQ86VF7 1730 aa28.78■■■□□ 2.2
CIRBP-211ENST00000586773 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP28.78■■■□□ 2.2
CIRBP-211ENST00000586773 GLI3P10071 1580 aa28.78■■■□□ 2.2
CIRBP-211ENST00000586773 CD163L1Q9NR16 1453 aa28.78■■■□□ 2.2
CIRBP-211ENST00000586773 SLIT3O75094 1523 aa28.76■■■□□ 2.19
CIRBP-211ENST00000586773 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
CIRBP-211ENST00000586773 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP28.75■■■□□ 2.19
CIRBP-211ENST00000586773 STRN4Q9NRL3 753 aa28.75■■■□□ 2.19
CIRBP-211ENST00000586773 A0A1W2PP64 1363 aa28.75■■■□□ 2.19
CIRBP-211ENST00000586773 ZBTB7CA1YPR0 619 aa28.74■■■□□ 2.19
CIRBP-211ENST00000586773 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
CIRBP-211ENST00000586773 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP28.74■■■□□ 2.19
CIRBP-211ENST00000586773 SEPT12Q8IYM1 358 aa28.73■■■□□ 2.19
CIRBP-211ENST00000586773 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa28.72■■■□□ 2.19
CIRBP-211ENST00000586773 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa28.72■■■□□ 2.19
CIRBP-211ENST00000586773 A0A0G2JS52 829 aa28.72■■■□□ 2.19
CIRBP-211ENST00000586773 MYT1Q01538 1121 aa28.72■■■□□ 2.19
CIRBP-211ENST00000586773 USP31Q70CQ4 1352 aa28.7■■■□□ 2.18
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CIRBP-211ENST00000586773 NME9Q86XW9 330 aa28.69■■■□□ 2.18
CIRBP-211ENST00000586773 AATKQ6ZMQ8 1374 aa28.69■■■□□ 2.18
CIRBP-211ENST00000586773 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa28.68■■■□□ 2.18
CIRBP-211ENST00000586773 SOX12O15370 315 aa28.68■■■□□ 2.18
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CIRBP-211ENST00000586773 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa28.67■■■□□ 2.18
CIRBP-211ENST00000586773 LMO7Q8WWI1 1683 aa28.66■■■□□ 2.18
CIRBP-211ENST00000586773 ARHGEF25Q86VW2 580 aa28.65■■■□□ 2.18
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CIRBP-211ENST00000586773 ZRANB1Q9UGI0 708 aa28.63■■■□□ 2.17
CIRBP-211ENST00000586773 USP54Q70EL1 1684 aa28.62■■■□□ 2.17
CIRBP-211ENST00000586773 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
CIRBP-211ENST00000586773 USP35Q9P2H5 1018 aa28.62■■■□□ 2.17
CIRBP-211ENST00000586773 CCDC125Q86Z20 511 aa28.61■■■□□ 2.17
CIRBP-211ENST00000586773 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
CIRBP-211ENST00000586773 COG3Q96JB2 828 aa28.6■■■□□ 2.17
CIRBP-211ENST00000586773 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
CIRBP-211ENST00000586773 BARGINQ6ZT62 677 aa28.59■■■□□ 2.17
CIRBP-211ENST00000586773 TCP11L2Q8N4U5 519 aa28.59■■■□□ 2.17
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