RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567949.5

CTU2-210, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTU2, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-210ENST00000567949 KCNA6P17658 529 aa27.02■■□□□ 1.92
CTU2-210ENST00000567949 PNPLA6Q8IY17 1366 aa27.01■■□□□ 1.91
CTU2-210ENST00000567949 NME9Q86XW9 330 aa27■■□□□ 1.91
CTU2-210ENST00000567949 PPP4R2Q9NY27 417 aa26.99■■□□□ 1.91
CTU2-210ENST00000567949 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.99■■□□□ 1.91
CTU2-210ENST00000567949 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
CTU2-210ENST00000567949 ACEP12821 1306 aa26.99■■□□□ 1.91
CTU2-210ENST00000567949 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
CTU2-210ENST00000567949 NUTM2FA1L443 756 aa26.98■■□□□ 1.91
CTU2-210ENST00000567949 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
CTU2-210ENST00000567949 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.98■■□□□ 1.91
CTU2-210ENST00000567949 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.98■■□□□ 1.91
CTU2-210ENST00000567949 SLFN5Q08AF3 891 aa26.97■■□□□ 1.91
CTU2-210ENST00000567949 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.97■■□□□ 1.91
CTU2-210ENST00000567949 POLKQ9UBT6 870 aa26.96■■□□□ 1.91
CTU2-210ENST00000567949 RRP1P56182 461 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
CTU2-210ENST00000567949 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
CTU2-210ENST00000567949 COG3Q96JB2 828 aa26.95■■□□□ 1.9
CTU2-210ENST00000567949 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.95■■□□□ 1.9
CTU2-210ENST00000567949 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
CTU2-210ENST00000567949 USP6P35125 1406 aa26.94■■□□□ 1.9
CTU2-210ENST00000567949 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.94■■□□□ 1.9
CTU2-210ENST00000567949 ZRANB1Q9UGI0 708 aa26.94■■□□□ 1.9
CTU2-210ENST00000567949 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa26.93■■□□□ 1.9
CTU2-210ENST00000567949 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
CTU2-210ENST00000567949 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
CTU2-210ENST00000567949 ANKARQ7Z5J8 1434 aa26.92■■□□□ 1.9
CTU2-210ENST00000567949 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
CTU2-210ENST00000567949 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
CTU2-210ENST00000567949 WWC1Q8IX03 1113 aa26.91■■□□□ 1.9
CTU2-210ENST00000567949 E9PSI1 815 aa26.9■■□□□ 1.9
CTU2-210ENST00000567949 FBLN1P23142 703 aa26.9■■□□□ 1.9
CTU2-210ENST00000567949 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
CTU2-210ENST00000567949 SSH2Q76I76 1423 aa26.89■■□□□ 1.9
CTU2-210ENST00000567949 FMN2Q9NZ56 1722 aa26.89■■□□□ 1.9
CTU2-210ENST00000567949 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
CTU2-210ENST00000567949 CCDC27Q2M243 656 aa26.88■■□□□ 1.89
CTU2-210ENST00000567949 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
CTU2-210ENST00000567949 PLEKHF1Q96S99 279 aa26.87■■□□□ 1.89
CTU2-210ENST00000567949 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
CTU2-210ENST00000567949 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
CTU2-210ENST00000567949 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
CTU2-210ENST00000567949 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa26.86■■□□□ 1.89
CTU2-210ENST00000567949 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.86■■□□□ 1.89
CTU2-210ENST00000567949 NALCNQ8IZF0 1738 aa26.85■■□□□ 1.89
CTU2-210ENST00000567949 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa26.85■■□□□ 1.89
CTU2-210ENST00000567949 OVOS2Q6IE36 1432 aa26.85■■□□□ 1.89
CTU2-210ENST00000567949 NEUROD2Q15784 382 aa26.85■■□□□ 1.89
CTU2-210ENST00000567949 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.85■■□□□ 1.89
CTU2-210ENST00000567949 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.84■■□□□ 1.89
CTU2-210ENST00000567949 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
CTU2-210ENST00000567949 WDR63Q8IWG1 891 aa26.83■■□□□ 1.89
CTU2-210ENST00000567949 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
CTU2-210ENST00000567949 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.8■■□□□ 1.88
CTU2-210ENST00000567949 FCHSD2O94868 740 aa26.8■■□□□ 1.88
CTU2-210ENST00000567949 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
CTU2-210ENST00000567949 USP31Q70CQ4 1352 aa26.79■■□□□ 1.88
CTU2-210ENST00000567949 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa26.79■■□□□ 1.88
CTU2-210ENST00000567949 IL13P35225 146 aa26.78■■□□□ 1.88
CTU2-210ENST00000567949 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa26.78■■□□□ 1.88
CTU2-210ENST00000567949 NWD1Q149M9 1564 aa26.78■■□□□ 1.88
CTU2-210ENST00000567949 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
CTU2-210ENST00000567949 LRRC7Q96NW7 1537 aa26.75■■□□□ 1.87
CTU2-210ENST00000567949 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.75■■□□□ 1.87
CTU2-210ENST00000567949 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
CTU2-210ENST00000567949 PLIN1O60240 522 aa26.73■■□□□ 1.87
CTU2-210ENST00000567949 EXOC6Q8TAG9 804 aa26.71■■□□□ 1.87
CTU2-210ENST00000567949 PIK3C2AO00443 1686 aa26.71■■□□□ 1.87
CTU2-210ENST00000567949 PRKAR2BP31323 418 aa26.71■■□□□ 1.87
CTU2-210ENST00000567949 PHF8Q9UPP1 1060 aa26.71■■□□□ 1.87
CTU2-210ENST00000567949 TRIM35Q9UPQ4 493 aa26.7■■□□□ 1.86
CTU2-210ENST00000567949 CCDC136Q96JN2 1154 aa26.69■■□□□ 1.86
CTU2-210ENST00000567949 NEFMP07197 916 aa26.69■■□□□ 1.86
CTU2-210ENST00000567949 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
CTU2-210ENST00000567949 RIPK4P57078 832 aa26.68■■□□□ 1.86
CTU2-210ENST00000567949 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.68■■□□□ 1.86
CTU2-210ENST00000567949 HMOX1P09601 288 aa26.67■■□□□ 1.86
CTU2-210ENST00000567949 PEAK1Q9H792 1746 aa26.67■■□□□ 1.86
CTU2-210ENST00000567949 USP54Q70EL1 1684 aa26.66■■□□□ 1.86
CTU2-210ENST00000567949 C14orf37Q86TY3 774 aa26.66■■□□□ 1.86
CTU2-210ENST00000567949 IL16Q14005 1332 aa26.64■■□□□ 1.86
CTU2-210ENST00000567949 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
CTU2-210ENST00000567949 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
CTU2-210ENST00000567949 NLRP6P59044 892 aa26.63■■□□□ 1.85
CTU2-210ENST00000567949 CRBNQ96SW2 442 aa26.63■■□□□ 1.85
CTU2-210ENST00000567949 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.63■■□□□ 1.85
CTU2-210ENST00000567949 MAP3K19Q56UN5 1328 aa26.62■■□□□ 1.85
CTU2-210ENST00000567949 NFE2L2Q16236 605 aa26.62■■□□□ 1.85
CTU2-210ENST00000567949 PHACTR3Q96KR7 559 aa26.62■■□□□ 1.85
CTU2-210ENST00000567949 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26.61■■□□□ 1.85
CTU2-210ENST00000567949 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
CTU2-210ENST00000567949 SOX12O15370 315 aa26.61■■□□□ 1.85
CTU2-210ENST00000567949 BCAR3O75815 825 aa26.61■■□□□ 1.85
CTU2-210ENST00000567949 ESCO1Q5FWF5 840 aa26.61■■□□□ 1.85
CTU2-210ENST00000567949 SBNO1A3KN83 1393 aa26.61■■□□□ 1.85
CTU2-210ENST00000567949 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.6■■□□□ 1.85
CTU2-210ENST00000567949 ABTB2Q8N961 1025 aa26.59■■□□□ 1.85
CTU2-210ENST00000567949 FLT4P35916 1363 aa26.59■■□□□ 1.85
CTU2-210ENST00000567949 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
CTU2-210ENST00000567949 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms