RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	31.18	■■■□□ 2.58
PPP4C-205	ENST00000563200	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		31.18	■■■□□ 2.58
PPP4C-205	ENST00000563200	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	31.17	■■■□□ 2.58
PPP4C-205	ENST00000563200	CABP2	Q9NPB3	220 aa		31.17	■■■□□ 2.58
PPP4C-205	ENST00000563200	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		31.17	■■■□□ 2.58
PPP4C-205	ENST00000563200	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	31.15	■■■□□ 2.58
PPP4C-205	ENST00000563200	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	31.15	■■■□□ 2.58
PPP4C-205	ENST00000563200	TONSL	Q96HA7	1378 aa		31.15	■■■□□ 2.58
PPP4C-205	ENST00000563200	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		31.15	■■■□□ 2.58
PPP4C-205	ENST00000563200	EP400	Q96L91	3159 aa		31.15	■■■□□ 2.58
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM83G	A6ND36	823 aa		31.14	■■■□□ 2.58
PPP4C-205	ENST00000563200	GLI3	P10071	1580 aa		31.12	■■■□□ 2.57
PPP4C-205	ENST00000563200	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		31.11	■■■□□ 2.57
PPP4C-205	ENST00000563200	EVC2	Q86UK5	1308 aa		31.09	■■■□□ 2.57
PPP4C-205	ENST00000563200	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	31.08	■■■□□ 2.57
PPP4C-205	ENST00000563200	NRAP	Q86VF7	1730 aa		31.08	■■■□□ 2.57
PPP4C-205	ENST00000563200	VPS72	Q15906	364 aa		31.07	■■■□□ 2.57
PPP4C-205	ENST00000563200	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	31.06	■■■□□ 2.56
PPP4C-205	ENST00000563200	CABP1	Q9NZU7	370 aa		31.06	■■■□□ 2.56
PPP4C-205	ENST00000563200	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		31.05	■■■□□ 2.56
PPP4C-205	ENST00000563200	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		31.04	■■■□□ 2.56
PPP4C-205	ENST00000563200	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	31.02	■■■□□ 2.56
PPP4C-205	ENST00000563200	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		31.02	■■■□□ 2.56
PPP4C-205	ENST00000563200	BTG4	Q9NY30	223 aa		31.02	■■■□□ 2.56
PPP4C-205	ENST00000563200	USP6	P35125	1406 aa		31.01	■■■□□ 2.55
PPP4C-205	ENST00000563200	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		31	■■■□□ 2.55
PPP4C-205	ENST00000563200	ABTB2	Q8N961	1025 aa		31	■■■□□ 2.55
PPP4C-205	ENST00000563200	SSH2	Q76I76	1423 aa		30.99	■■■□□ 2.55
PPP4C-205	ENST00000563200	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	30.98	■■■□□ 2.55
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA0232	Q92628	1395 aa		30.98	■■■□□ 2.55
PPP4C-205	ENST00000563200	USP19	O94966	1318 aa		30.98	■■■□□ 2.55
PPP4C-205	ENST00000563200	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		30.97	■■■□□ 2.55
PPP4C-205	ENST00000563200	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		30.97	■■■□□ 2.55
PPP4C-205	ENST00000563200	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		30.95	■■■□□ 2.55
PPP4C-205	ENST00000563200	AKAP12	Q02952	1782 aa		30.94	■■■□□ 2.54
PPP4C-205	ENST00000563200	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	30.93	■■■□□ 2.54
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	30.93	■■■□□ 2.54
PPP4C-205	ENST00000563200	NLRP13	Q86W25	1043 aa		30.91	■■■□□ 2.54
PPP4C-205	ENST00000563200	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		30.91	■■■□□ 2.54
PPP4C-205	ENST00000563200	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	30.91	■■■□□ 2.54
PPP4C-205	ENST00000563200	CHRNA2	Q15822	529 aa		30.9	■■■□□ 2.54
PPP4C-205	ENST00000563200	CPD	O75976	1380 aa		30.9	■■■□□ 2.54
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	30.9	■■■□□ 2.54
PPP4C-205	ENST00000563200	PIK3C2A	O00443	1686 aa		30.89	■■■□□ 2.54
PPP4C-205	ENST00000563200	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		30.88	■■■□□ 2.53
PPP4C-205	ENST00000563200	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		30.88	■■■□□ 2.53
PPP4C-205	ENST00000563200	GC	P02774	474 aa		30.88	■■■□□ 2.53
PPP4C-205	ENST00000563200	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		30.87	■■■□□ 2.53
PPP4C-205	ENST00000563200	SLIT3	O75094	1523 aa		30.86	■■■□□ 2.53
PPP4C-205	ENST00000563200	NLRP6	P59044	892 aa		30.84	■■■□□ 2.53
PPP4C-205	ENST00000563200	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		30.84	■■■□□ 2.53
PPP4C-205	ENST00000563200	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		30.84	■■■□□ 2.53
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	30.83	■■■□□ 2.53
PPP4C-205	ENST00000563200	TESK2	Q96S53	571 aa		30.83	■■■□□ 2.53
PPP4C-205	ENST00000563200	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		30.83	■■■□□ 2.53
PPP4C-205	ENST00000563200	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		30.83	■■■□□ 2.53
PPP4C-205	ENST00000563200	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		30.82	■■■□□ 2.52
PPP4C-205	ENST00000563200	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		30.81	■■■□□ 2.52
PPP4C-205	ENST00000563200	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	30.81	■■■□□ 2.52
PPP4C-205	ENST00000563200	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		30.81	■■■□□ 2.52
PPP4C-205	ENST00000563200	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		30.8	■■■□□ 2.52
PPP4C-205	ENST00000563200	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	30.8	■■■□□ 2.52
PPP4C-205	ENST00000563200	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		30.8	■■■□□ 2.52
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC125	Q86Z20	511 aa		30.8	■■■□□ 2.52
PPP4C-205	ENST00000563200	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		30.79	■■■□□ 2.52
PPP4C-205	ENST00000563200	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		30.79	■■■□□ 2.52
PPP4C-205	ENST00000563200	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		30.78	■■■□□ 2.52
PPP4C-205	ENST00000563200	STRN4	Q9NRL3	753 aa		30.77	■■■□□ 2.52
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		30.74	■■■□□ 2.51
PPP4C-205	ENST00000563200	COL18A1	P39060	1754 aa		30.73	■■■□□ 2.51
PPP4C-205	ENST00000563200	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	30.73	■■■□□ 2.51
PPP4C-205	ENST00000563200	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		30.73	■■■□□ 2.51
PPP4C-205	ENST00000563200	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	30.73	■■■□□ 2.51
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A0G2JS52	829 aa		30.73	■■■□□ 2.51
PPP4C-205	ENST00000563200	MYT1	Q01538	1121 aa		30.73	■■■□□ 2.51
PPP4C-205	ENST00000563200	EVA1C	P58658	441 aa		30.72	■■■□□ 2.51
PPP4C-205	ENST00000563200	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	30.72	■■■□□ 2.51
PPP4C-205	ENST00000563200	TMC1	Q8TDI8	760 aa		30.72	■■■□□ 2.51
PPP4C-205	ENST00000563200	USP54	Q70EL1	1684 aa		30.71	■■■□□ 2.51
PPP4C-205	ENST00000563200	USP47	Q96K76	1375 aa		30.71	■■■□□ 2.51
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC24A1	O60721	1099 aa		30.7	■■■□□ 2.5
PPP4C-205	ENST00000563200	NFAT5	O94916	1531 aa		30.69	■■■□□ 2.5
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PP64	1363 aa		30.68	■■■□□ 2.5
PPP4C-205	ENST00000563200	USP31	Q70CQ4	1352 aa		30.68	■■■□□ 2.5
PPP4C-205	ENST00000563200	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		30.68	■■■□□ 2.5
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		30.68	■■■□□ 2.5
PPP4C-205	ENST00000563200	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	30.67	■■■□□ 2.5
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		30.67	■■■□□ 2.5
PPP4C-205	ENST00000563200	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		30.67	■■■□□ 2.5
PPP4C-205	ENST00000563200	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	30.66	■■■□□ 2.5
PPP4C-205	ENST00000563200	USP35	Q9P2H5	1018 aa		30.66	■■■□□ 2.5
PPP4C-205	ENST00000563200	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	30.66	■■■□□ 2.5
PPP4C-205	ENST00000563200	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		30.66	■■■□□ 2.5
PPP4C-205	ENST00000563200	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		30.65	■■■□□ 2.5
PPP4C-205	ENST00000563200	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		30.64	■■■□□ 2.5
PPP4C-205	ENST00000563200	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		30.64	■■■□□ 2.5
PPP4C-205	ENST00000563200	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		30.64	■■■□□ 2.5
PPP4C-205	ENST00000563200	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		30.64	■■■□□ 2.49
PPP4C-205	ENST00000563200	NME9	Q86XW9	330 aa		30.64	■■■□□ 2.49
PPP4C-205	ENST00000563200	CRB1	P82279	1406 aa		30.62	■■■□□ 2.49

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