RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-229ENST00000551936 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
CS-229ENST00000551936 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa20.87■□□□□ 0.93
CS-229ENST00000551936 ACEP12821 1306 aa20.87■□□□□ 0.93
CS-229ENST00000551936 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
CS-229ENST00000551936 NEUROD1Q13562 356 aa20.87■□□□□ 0.93
CS-229ENST00000551936 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.86■□□□□ 0.93
CS-229ENST00000551936 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
CS-229ENST00000551936 BTG4Q9NY30 223 aa20.84■□□□□ 0.93
CS-229ENST00000551936 NRAPQ86VF7 1730 aa20.84■□□□□ 0.93
CS-229ENST00000551936 BRWD3Q6RI45 1802 aa20.83■□□□□ 0.93
CS-229ENST00000551936 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
CS-229ENST00000551936 SEPT12Q8IYM1 358 aa20.83■□□□□ 0.93
CS-229ENST00000551936 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
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CS-229ENST00000551936 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
CS-229ENST00000551936 CABP2Q9NPB3 220 aa20.82■□□□□ 0.92
CS-229ENST00000551936 QRICH2Q9H0J4 1663 aa20.81■□□□□ 0.92
CS-229ENST00000551936 CCDC125Q86Z20 511 aa20.81■□□□□ 0.92
CS-229ENST00000551936 EP400Q96L91 3159 aa20.81■□□□□ 0.92
CS-229ENST00000551936 NUTM2GQ5VZR2 741 aa20.79■□□□□ 0.92
CS-229ENST00000551936 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa20.78■□□□□ 0.92
CS-229ENST00000551936 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
CS-229ENST00000551936 PRDM11Q9NQV5 511 aa20.78■□□□□ 0.92
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CS-229ENST00000551936 ABTB2Q8N961 1025 aa20.76■□□□□ 0.91
CS-229ENST00000551936 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
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CS-229ENST00000551936 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa20.75■□□□□ 0.91
CS-229ENST00000551936 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.75■□□□□ 0.91
CS-229ENST00000551936 CHRNA2Q15822 529 aa20.74■□□□□ 0.91
CS-229ENST00000551936 EVC2Q86UK5 1308 aa20.74■□□□□ 0.91
CS-229ENST00000551936 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
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CS-229ENST00000551936 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
CS-229ENST00000551936 NLRP13Q86W25 1043 aa20.71■□□□□ 0.91
CS-229ENST00000551936 A0A0G2JS52 829 aa20.7■□□□□ 0.9
CS-229ENST00000551936 MYT1Q01538 1121 aa20.7■□□□□ 0.9
CS-229ENST00000551936 NRKQ7Z2Y5 1582 aa20.7■□□□□ 0.9
CS-229ENST00000551936 GCP02774 474 aa20.69■□□□□ 0.9
CS-229ENST00000551936 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa20.69■□□□□ 0.9
CS-229ENST00000551936 USP6P35125 1406 aa20.69■□□□□ 0.9
CS-229ENST00000551936 STRN4Q9NRL3 753 aa20.68■□□□□ 0.9
CS-229ENST00000551936 CPDO75976 1380 aa20.68■□□□□ 0.9
CS-229ENST00000551936 SSH2Q76I76 1423 aa20.67■□□□□ 0.9
CS-229ENST00000551936 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
CS-229ENST00000551936 DEFB132Q7Z7B7 95 aa20.66■□□□□ 0.9
CS-229ENST00000551936 ZRANB1Q9UGI0 708 aa20.66■□□□□ 0.9
CS-229ENST00000551936 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa20.66■□□□□ 0.9
CS-229ENST00000551936 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa20.66■□□□□ 0.9
CS-229ENST00000551936 EVA1CP58658 441 aa20.65■□□□□ 0.9
CS-229ENST00000551936 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
CS-229ENST00000551936 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
CS-229ENST00000551936 LMO7Q8WWI1 1683 aa20.64■□□□□ 0.9
CS-229ENST00000551936 NLRP6P59044 892 aa20.64■□□□□ 0.89
CS-229ENST00000551936 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.64■□□□□ 0.89
CS-229ENST00000551936 TONSLQ96HA7 1378 aa20.63■□□□□ 0.89
CS-229ENST00000551936 FAM182BQ5T319 152 aa20.62■□□□□ 0.89
CS-229ENST00000551936 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
CS-229ENST00000551936 AKAP12Q02952 1782 aa20.62■□□□□ 0.89
CS-229ENST00000551936 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa20.61■□□□□ 0.89
CS-229ENST00000551936 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa20.61■□□□□ 0.89
CS-229ENST00000551936 SLIT3O75094 1523 aa20.61■□□□□ 0.89
CS-229ENST00000551936 PIK3C2AO00443 1686 aa20.61■□□□□ 0.89
CS-229ENST00000551936 BARGINQ6ZT62 677 aa20.6■□□□□ 0.89
CS-229ENST00000551936 USP35Q9P2H5 1018 aa20.6■□□□□ 0.89
CS-229ENST00000551936 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
CS-229ENST00000551936 AATKQ6ZMQ8 1374 aa20.57■□□□□ 0.88
CS-229ENST00000551936 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CS-229ENST00000551936 TTC21AQ8NDW8 1320 aa20.56■□□□□ 0.88
CS-229ENST00000551936 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.56■□□□□ 0.88
CS-229ENST00000551936 BAG6P46379 1132 aa20.56■□□□□ 0.88
CS-229ENST00000551936 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.56■□□□□ 0.88
CS-229ENST00000551936 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CS-229ENST00000551936 COL18A1P39060 1754 aa20.55■□□□□ 0.88
CS-229ENST00000551936 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CS-229ENST00000551936 RGPD1P0DJD0 1748 aa20.55■□□□□ 0.88
CS-229ENST00000551936 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.53■□□□□ 0.88
CS-229ENST00000551936 ARHGEF25Q86VW2 580 aa20.53■□□□□ 0.88
CS-229ENST00000551936 KCNH5Q8NCM2 988 aa20.53■□□□□ 0.88
CS-229ENST00000551936 AXIN2Q9Y2T1 843 aa20.53■□□□□ 0.88
CS-229ENST00000551936 CD163L1Q9NR16 1453 aa20.52■□□□□ 0.88
CS-229ENST00000551936 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CS-229ENST00000551936 MON2Q7Z3U7 1717 aa20.52■□□□□ 0.88
CS-229ENST00000551936 CRB1P82279 1406 aa20.52■□□□□ 0.87
CS-229ENST00000551936 PDE3BQ13370 1112 aa20.51■□□□□ 0.87
CS-229ENST00000551936 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CS-229ENST00000551936 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CS-229ENST00000551936 TMC1Q8TDI8 760 aa20.5■□□□□ 0.87
CS-229ENST00000551936 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa20.5■□□□□ 0.87
CS-229ENST00000551936 TRIM37O94972 964 aa20.49■□□□□ 0.87
CS-229ENST00000551936 DISP2A7MBM2 1401 aa20.49■□□□□ 0.87
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CS-229ENST00000551936 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CS-229ENST00000551936 SOX12O15370 315 aa20.48■□□□□ 0.87
CS-229ENST00000551936 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
CS-229ENST00000551936 TESK2Q96S53 571 aa20.48■□□□□ 0.87
CS-229ENST00000551936 RGPD5Q99666 1765 aa20.48■□□□□ 0.87
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