RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
CS-214ENST00000548849 STAC3Q96MF2 364 aa24.89■■□□□ 1.58
CS-214ENST00000548849 ALS2Q96Q42 1657 aa24.87■■□□□ 1.57
CS-214ENST00000548849 NRAPQ86VF7 1730 aa24.85■■□□□ 1.57
CS-214ENST00000548849 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
CS-214ENST00000548849 BAG6P46379 1132 aa24.82■■□□□ 1.56
CS-214ENST00000548849 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CS-214ENST00000548849 PRDM11Q9NQV5 511 aa24.81■■□□□ 1.56
CS-214ENST00000548849 HRCP23327 699 aa24.8■■□□□ 1.56
CS-214ENST00000548849 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa24.8■■□□□ 1.56
CS-214ENST00000548849 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa24.8■■□□□ 1.56
CS-214ENST00000548849 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CS-214ENST00000548849 FAM182BQ5T319 152 aa24.78■■□□□ 1.56
CS-214ENST00000548849 CDK19Q9BWU1 502 aa24.77■■□□□ 1.56
CS-214ENST00000548849 ITSN1Q15811 1721 aa24.77■■□□□ 1.56
CS-214ENST00000548849 ATP7BP35670 1465 aa24.77■■□□□ 1.56
CS-214ENST00000548849 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa24.76■■□□□ 1.55
CS-214ENST00000548849 CHRNA2Q15822 529 aa24.75■■□□□ 1.55
CS-214ENST00000548849 NUTM2GQ5VZR2 741 aa24.74■■□□□ 1.55
CS-214ENST00000548849 KIAA0232Q92628 1395 aa24.74■■□□□ 1.55
CS-214ENST00000548849 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
CS-214ENST00000548849 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CS-214ENST00000548849 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
CS-214ENST00000548849 STRN4Q9NRL3 753 aa24.73■■□□□ 1.55
CS-214ENST00000548849 ACEP12821 1306 aa24.71■■□□□ 1.55
CS-214ENST00000548849 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.71■■□□□ 1.55
CS-214ENST00000548849 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa24.7■■□□□ 1.54
CS-214ENST00000548849 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.7■■□□□ 1.54
CS-214ENST00000548849 RGPD1P0DJD0 1748 aa24.69■■□□□ 1.54
CS-214ENST00000548849 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa24.69■■□□□ 1.54
CS-214ENST00000548849 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
CS-214ENST00000548849 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
CS-214ENST00000548849 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.67■■□□□ 1.54
CS-214ENST00000548849 EVA1CP58658 441 aa24.67■■□□□ 1.54
CS-214ENST00000548849 USP35Q9P2H5 1018 aa24.67■■□□□ 1.54
CS-214ENST00000548849 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.66■■□□□ 1.54
CS-214ENST00000548849 ABTB2Q8N961 1025 aa24.66■■□□□ 1.54
CS-214ENST00000548849 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.64■■□□□ 1.54
CS-214ENST00000548849 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.64■■□□□ 1.53
CS-214ENST00000548849 LRP5O75197 1615 aa24.64■■□□□ 1.53
CS-214ENST00000548849 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
CS-214ENST00000548849 FAM196AQ6ZSG2 479 aa24.63■■□□□ 1.53
CS-214ENST00000548849 TRIM37O94972 964 aa24.62■■□□□ 1.53
CS-214ENST00000548849 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
CS-214ENST00000548849 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CS-214ENST00000548849 PDE3BQ13370 1112 aa24.6■■□□□ 1.53
CS-214ENST00000548849 DISP2A7MBM2 1401 aa24.6■■□□□ 1.53
CS-214ENST00000548849 SSH2Q76I76 1423 aa24.6■■□□□ 1.53
CS-214ENST00000548849 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
CS-214ENST00000548849 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
CS-214ENST00000548849 BARGINQ6ZT62 677 aa24.59■■□□□ 1.53
CS-214ENST00000548849 CABP2Q9NPB3 220 aa24.59■■□□□ 1.53
CS-214ENST00000548849 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
CS-214ENST00000548849 NLRP13Q86W25 1043 aa24.58■■□□□ 1.53
CS-214ENST00000548849 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.58■■□□□ 1.53
CS-214ENST00000548849 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.58■■□□□ 1.52
CS-214ENST00000548849 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa24.57■■□□□ 1.52
CS-214ENST00000548849 APBA3O96018 575 aa24.57■■□□□ 1.52
CS-214ENST00000548849 GCP02774 474 aa24.56■■□□□ 1.52
CS-214ENST00000548849 CAMKK2Q96RR4 588 aa24.56■■□□□ 1.52
CS-214ENST00000548849 USP19O94966 1318 aa24.56■■□□□ 1.52
CS-214ENST00000548849 CPDO75976 1380 aa24.55■■□□□ 1.52
CS-214ENST00000548849 TCP11L2Q8N4U5 519 aa24.55■■□□□ 1.52
CS-214ENST00000548849 ZBTB7CA1YPR0 619 aa24.52■■□□□ 1.52
CS-214ENST00000548849 CABP1Q9NZU7 370 aa24.52■■□□□ 1.52
CS-214ENST00000548849 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
CS-214ENST00000548849 LMO7Q8WWI1 1683 aa24.51■■□□□ 1.51
CS-214ENST00000548849 NLRP6P59044 892 aa24.5■■□□□ 1.51
CS-214ENST00000548849 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.5■■□□□ 1.51
CS-214ENST00000548849 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
CS-214ENST00000548849 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.48■■□□□ 1.51
CS-214ENST00000548849 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CS-214ENST00000548849 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.46■■□□□ 1.51
CS-214ENST00000548849 USP6P35125 1406 aa24.45■■□□□ 1.51
CS-214ENST00000548849 NBPF14Q5TI25 921 aa24.45■■□□□ 1.5
CS-214ENST00000548849 CRB1P82279 1406 aa24.44■■□□□ 1.5
CS-214ENST00000548849 EVC2Q86UK5 1308 aa24.43■■□□□ 1.5
CS-214ENST00000548849 AATKQ6ZMQ8 1374 aa24.42■■□□□ 1.5
CS-214ENST00000548849 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa24.41■■□□□ 1.5
CS-214ENST00000548849 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
CS-214ENST00000548849 RREB1Q92766 1687 aa24.4■■□□□ 1.5
CS-214ENST00000548849 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
CS-214ENST00000548849 SLIT3O75094 1523 aa24.4■■□□□ 1.5
CS-214ENST00000548849 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.39■■□□□ 1.49
CS-214ENST00000548849 NUP188Q5SRE5 1749 aa24.38■■□□□ 1.49
CS-214ENST00000548849 DDB1Q16531 1140 aa24.38■■□□□ 1.49
CS-214ENST00000548849 NEUROD1Q13562 356 aa24.37■■□□□ 1.49
CS-214ENST00000548849 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
CS-214ENST00000548849 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa24.36■■□□□ 1.49
CS-214ENST00000548849 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa24.36■■□□□ 1.49
CS-214ENST00000548849 OVOS2Q6IE36 1432 aa24.36■■□□□ 1.49
CS-214ENST00000548849 AXIN2Q9Y2T1 843 aa24.36■■□□□ 1.49
CS-214ENST00000548849 PIK3C2AO00443 1686 aa24.36■■□□□ 1.49
CS-214ENST00000548849 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CS-214ENST00000548849 SOX12O15370 315 aa24.35■■□□□ 1.49
CS-214ENST00000548849 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.35■■□□□ 1.49
CS-214ENST00000548849 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa24.35■■□□□ 1.49
CS-214ENST00000548849 WDR17Q8IZU2 1322 aa24.34■■□□□ 1.49
CS-214ENST00000548849 KCNH5Q8NCM2 988 aa24.33■■□□□ 1.49
CS-214ENST00000548849 COL18A1P39060 1754 aa24.33■■□□□ 1.49
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