RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548746.5

CS-213, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-213ENST00000548746 KRT28Q7Z3Y7 464 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-213ENST00000548746 CD163L1Q9NR16 1453 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-213ENST00000548746 USP6P35125 1406 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-213ENST00000548746 ACEP12821 1306 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-213ENST00000548746 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-213ENST00000548746 CABP2Q9NPB3 220 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-213ENST00000548746 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-213ENST00000548746 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CS-213ENST00000548746 MYOM1P52179 1685 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-213ENST00000548746 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CS-213ENST00000548746 NWD2Q9ULI1 1742 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-213ENST00000548746 DISP3Q9P2K9 1392 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-213ENST00000548746 PIK3C2AO00443 1686 aa8.34□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 POTEDQ86YR6 584 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 CABP1Q9NZU7 370 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 SLIT3O75094 1523 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 USP19O94966 1318 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 PLCH1Q4KWH8 1693 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 SLIT2O94813 1529 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 TMF1P82094 1093 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 NRAPQ86VF7 1730 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 TTC21AQ8NDW8 1320 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 CDCA8Q53HL2 280 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 A0A1W2PP64 1363 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 CPDO75976 1380 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 USP31Q70CQ4 1352 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 LMO7Q8WWI1 1683 aa8.3□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 ABCC6O95255 1503 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 BCL9LQ86UU0 1499 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 NFAT5O94916 1531 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 ATRNO75882 1429 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 TERF2IPQ9NYB0 399 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 OVOS2Q6IE36 1432 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 AFF2P51816 1311 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 COL18A1P39060 1754 aa8.27□□□□□ -1.08
CS-213ENST00000548746 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 POTEAQ6S8J7 498 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 KIF20BQ96Q89 1820 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 ADAMTS2O95450 1211 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 NLRP13Q86W25 1043 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 ABTB2Q8N961 1025 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 CABLES1Q8TDN4 633 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 C8orf37Q96NL8 207 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 ILDR2Q71H61 639 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 TMC1Q8TDI8 760 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 NGLY1Q96IV0 654 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 GLI3P10071 1580 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 KIAA0232Q92628 1395 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 FAM83GA6ND36 823 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 GCP02774 474 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 LMOD2Q6P5Q4 547 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 UNC5CLQ8IV45 518 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 USP21Q9UK80 565 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 LTN1O94822 1766 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 AATKQ6ZMQ8 1374 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 NLRP6P59044 892 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 KCNH5Q8NCM2 988 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 NSD3Q9BZ95 1437 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 VPS72Q15906 364 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 NUTM2GQ5VZR2 741 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 NME9Q86XW9 330 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 CARD14Q9BXL6 1004 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 PRDM11Q9NQV5 511 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 KIF7Q2M1P5 1343 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 RGS12O14924 1447 aa8.21□□□□□ -1.09
CS-213ENST00000548746 RGPD5Q99666 1765 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 RXRBP28702 533 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 ARHGEF25Q86VW2 580 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 WNK3Q9BYP7 1800 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 FYB1O15117 783 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-213ENST00000548746 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
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