RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547541.1

TARBP2-208, Transcript of TARBP2, RISC loading complex RNA binding subunit, human

TSL 3

Gene TARBP2, Length 430 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARBP2-208	ENST00000547541	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		13.45	□□□□□ -0.26
TARBP2-208	ENST00000547541	NUTM2F	A1L443	756 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TARBP2-208	ENST00000547541	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
TARBP2-208	ENST00000547541	PDE3B	Q13370	1112 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TARBP2-208	ENST00000547541	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		13.44	□□□□□ -0.26
TARBP2-208	ENST00000547541	C14orf37	Q86TY3	774 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARBP2-208	ENST00000547541	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARBP2-208	ENST00000547541	NUDC	Q9Y266	331 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARBP2-208	ENST00000547541	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARBP2-208	ENST00000547541	STRC	Q7RTU9	1775 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TARBP2-208	ENST00000547541	DCC	P43146	1447 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARBP2-208	ENST00000547541	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TARBP2-208	ENST00000547541	NME9	Q86XW9	330 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARBP2-208	ENST00000547541	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARBP2-208	ENST00000547541	USP31	Q70CQ4	1352 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TARBP2-208	ENST00000547541	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TARBP2-208	ENST00000547541	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TARBP2-208	ENST00000547541	POLK	Q9UBT6	870 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TARBP2-208	ENST00000547541	TMEM94	Q12767	1356 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TARBP2-208	ENST00000547541	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TARBP2-208	ENST00000547541	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TARBP2-208	ENST00000547541	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TARBP2-208	ENST00000547541	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
TARBP2-208	ENST00000547541	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
TARBP2-208	ENST00000547541	ATF3	P18847	181 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TARBP2-208	ENST00000547541	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TARBP2-208	ENST00000547541	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TARBP2-208	ENST00000547541	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
TARBP2-208	ENST00000547541	RUNDC1	Q96C34	613 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TARBP2-208	ENST00000547541	PSME1	Q06323	249 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TARBP2-208	ENST00000547541	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TARBP2-208	ENST00000547541	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TARBP2-208	ENST00000547541	MSH6	P52701	1360 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TARBP2-208	ENST00000547541	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TARBP2-208	ENST00000547541	SHPRH	Q149N8	1683 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TARBP2-208	ENST00000547541	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TARBP2-208	ENST00000547541	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TARBP2-208	ENST00000547541	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TARBP2-208	ENST00000547541	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TARBP2-208	ENST00000547541	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TARBP2-208	ENST00000547541	FCHSD2	O94868	740 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TARBP2-208	ENST00000547541	USP54	Q70EL1	1684 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TARBP2-208	ENST00000547541	MST1R	Q04912	1400 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TARBP2-208	ENST00000547541	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
TARBP2-208	ENST00000547541	NLRP6	P59044	892 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TARBP2-208	ENST00000547541	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	13.33	□□□□□ -0.28
TARBP2-208	ENST00000547541	ABTB2	Q8N961	1025 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TARBP2-208	ENST00000547541	ORAI2	Q96SN7	254 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TARBP2-208	ENST00000547541	KIF1A	Q12756	1690 aa		13.33	□□□□□ -0.28
TARBP2-208	ENST00000547541	APAF1	O14727	1248 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TARBP2-208	ENST00000547541	CCDC27	Q2M243	656 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TARBP2-208	ENST00000547541	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		13.32	□□□□□ -0.28
TARBP2-208	ENST00000547541	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	13.32	□□□□□ -0.28
TARBP2-208	ENST00000547541	IL13	P35225	146 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TARBP2-208	ENST00000547541	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TARBP2-208	ENST00000547541	ZNF521	Q96K83	1311 aa		13.31	□□□□□ -0.28
TARBP2-208	ENST00000547541	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	13.3	□□□□□ -0.28
TARBP2-208	ENST00000547541	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
TARBP2-208	ENST00000547541	FOXO3	O43524	673 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TARBP2-208	ENST00000547541	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
TARBP2-208	ENST00000547541	GOLGA2	Q08379	1002 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TARBP2-208	ENST00000547541	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TARBP2-208	ENST00000547541	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TARBP2-208	ENST00000547541	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		13.3	□□□□□ -0.28
TARBP2-208	ENST00000547541	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
TARBP2-208	ENST00000547541	PIK3C2A	O00443	1686 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TARBP2-208	ENST00000547541	FBLN1	P23142	703 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TARBP2-208	ENST00000547541	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TARBP2-208	ENST00000547541	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
TARBP2-208	ENST00000547541	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TARBP2-208	ENST00000547541	SBNO1	A3KN83	1393 aa		13.29	□□□□□ -0.28
TARBP2-208	ENST00000547541	NEFM	P07197	916 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TARBP2-208	ENST00000547541	WDR63	Q8IWG1	891 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TARBP2-208	ENST00000547541	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TARBP2-208	ENST00000547541	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
TARBP2-208	ENST00000547541	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		13.28	□□□□□ -0.28
TARBP2-208	ENST00000547541	NEFL	P07196	543 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TARBP2-208	ENST00000547541	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
TARBP2-208	ENST00000547541	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TARBP2-208	ENST00000547541	FLT4	P35916	1363 aa		13.27	□□□□□ -0.29
TARBP2-208	ENST00000547541	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TARBP2-208	ENST00000547541	WWC1	Q8IX03	1113 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TARBP2-208	ENST00000547541	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TARBP2-208	ENST00000547541	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
TARBP2-208	ENST00000547541	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
TARBP2-208	ENST00000547541	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TARBP2-208	ENST00000547541	RTL1	A6NKG5	1358 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TARBP2-208	ENST00000547541		E9PSI1	815 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TARBP2-208	ENST00000547541	AMPH	P49418	695 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TARBP2-208	ENST00000547541	SLFN5	Q08AF3	891 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TARBP2-208	ENST00000547541	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TARBP2-208	ENST00000547541	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TARBP2-208	ENST00000547541	SLAIN2	Q9P270	581 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TARBP2-208	ENST00000547541	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TARBP2-208	ENST00000547541	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TARBP2-208	ENST00000547541	CERK	Q8TCT0	537 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TARBP2-208	ENST00000547541	USP19	O94966	1318 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TARBP2-208	ENST00000547541	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TARBP2-208	ENST00000547541	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TARBP2-208	ENST00000547541	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		13.23	□□□□□ -0.29

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.6 ms