RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543190.5

LTBR-211, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LTBR, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-211ENST00000543190 LMOD2Q6P5Q4 547 aa27.11■■□□□ 1.93
LTBR-211ENST00000543190 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
LTBR-211ENST00000543190 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
LTBR-211ENST00000543190 PLEKHG3A1L390 1219 aa27.08■■□□□ 1.93
LTBR-211ENST00000543190 CCDC61Q9Y6R9 512 aa27.08■■□□□ 1.93
LTBR-211ENST00000543190 SEPT12Q8IYM1 358 aa27.07■■□□□ 1.92
LTBR-211ENST00000543190 CDK19Q9BWU1 502 aa27.07■■□□□ 1.92
LTBR-211ENST00000543190 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
LTBR-211ENST00000543190 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa27.04■■□□□ 1.92
LTBR-211ENST00000543190 NBPF1Q3BBV0 1214 aa27.03■■□□□ 1.92
LTBR-211ENST00000543190 BTG4Q9NY30 223 aa27.03■■□□□ 1.92
LTBR-211ENST00000543190 QRICH2Q9H0J4 1663 aa27.01■■□□□ 1.91
LTBR-211ENST00000543190 ACEP12821 1306 aa27■■□□□ 1.91
LTBR-211ENST00000543190 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa27■■□□□ 1.91
LTBR-211ENST00000543190 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa27■■□□□ 1.91
LTBR-211ENST00000543190 NBPF8Q3BBV2 869 aa27■■□□□ 1.91
LTBR-211ENST00000543190 KRT27Q7Z3Y8 459 aa27■■□□□ 1.91
LTBR-211ENST00000543190 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27■■□□□ 1.91
LTBR-211ENST00000543190 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
LTBR-211ENST00000543190 ZRANB1Q9UGI0 708 aa26.99■■□□□ 1.91
LTBR-211ENST00000543190 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
LTBR-211ENST00000543190 NRKQ7Z2Y5 1582 aa26.97■■□□□ 1.91
LTBR-211ENST00000543190 PRDM11Q9NQV5 511 aa26.96■■□□□ 1.91
LTBR-211ENST00000543190 CPDO75976 1380 aa26.96■■□□□ 1.91
LTBR-211ENST00000543190 USP19O94966 1318 aa26.95■■□□□ 1.91
LTBR-211ENST00000543190 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
LTBR-211ENST00000543190 KIAA0232Q92628 1395 aa26.95■■□□□ 1.9
LTBR-211ENST00000543190 LMO7Q8WWI1 1683 aa26.95■■□□□ 1.9
LTBR-211ENST00000543190 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.94■■□□□ 1.9
LTBR-211ENST00000543190 RGPD1P0DJD0 1748 aa26.93■■□□□ 1.9
LTBR-211ENST00000543190 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.91■■□□□ 1.9
LTBR-211ENST00000543190 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
LTBR-211ENST00000543190 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.9■■□□□ 1.9
LTBR-211ENST00000543190 PLEKHG5O94827 1062 aa26.9■■□□□ 1.9
LTBR-211ENST00000543190 DISP2A7MBM2 1401 aa26.89■■□□□ 1.89
LTBR-211ENST00000543190 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
LTBR-211ENST00000543190 SSH2Q76I76 1423 aa26.87■■□□□ 1.89
LTBR-211ENST00000543190 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa26.86■■□□□ 1.89
LTBR-211ENST00000543190 USP6P35125 1406 aa26.86■■□□□ 1.89
LTBR-211ENST00000543190 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
LTBR-211ENST00000543190 ABTB2Q8N961 1025 aa26.86■■□□□ 1.89
LTBR-211ENST00000543190 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
LTBR-211ENST00000543190 BARGINQ6ZT62 677 aa26.85■■□□□ 1.89
LTBR-211ENST00000543190 NLRP13Q86W25 1043 aa26.85■■□□□ 1.89
LTBR-211ENST00000543190 SLIT3O75094 1523 aa26.84■■□□□ 1.89
LTBR-211ENST00000543190 DEFB132Q7Z7B7 95 aa26.83■■□□□ 1.89
LTBR-211ENST00000543190 AKAP12Q02952 1782 aa26.83■■□□□ 1.89
LTBR-211ENST00000543190 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.83■■□□□ 1.88
LTBR-211ENST00000543190 CABP2Q9NPB3 220 aa26.82■■□□□ 1.88
LTBR-211ENST00000543190 EVC2Q86UK5 1308 aa26.82■■□□□ 1.88
LTBR-211ENST00000543190 BAG6P46379 1132 aa26.81■■□□□ 1.88
LTBR-211ENST00000543190 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
LTBR-211ENST00000543190 GCP02774 474 aa26.8■■□□□ 1.88
LTBR-211ENST00000543190 CHRNA2Q15822 529 aa26.8■■□□□ 1.88
LTBR-211ENST00000543190 LRP5O75197 1615 aa26.79■■□□□ 1.88
LTBR-211ENST00000543190 PIK3C2AO00443 1686 aa26.79■■□□□ 1.88
LTBR-211ENST00000543190 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
LTBR-211ENST00000543190 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.79■■□□□ 1.88
LTBR-211ENST00000543190 A0A0G2JS52 829 aa26.78■■□□□ 1.88
LTBR-211ENST00000543190 MYT1Q01538 1121 aa26.78■■□□□ 1.88
LTBR-211ENST00000543190 NUTM2GQ5VZR2 741 aa26.78■■□□□ 1.88
LTBR-211ENST00000543190 CABP1Q9NZU7 370 aa26.78■■□□□ 1.88
LTBR-211ENST00000543190 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
LTBR-211ENST00000543190 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
LTBR-211ENST00000543190 COL18A1P39060 1754 aa26.78■■□□□ 1.88
LTBR-211ENST00000543190 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
LTBR-211ENST00000543190 AATKQ6ZMQ8 1374 aa26.76■■□□□ 1.87
LTBR-211ENST00000543190 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
LTBR-211ENST00000543190 FAM196AQ6ZSG2 479 aa26.75■■□□□ 1.87
LTBR-211ENST00000543190 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
LTBR-211ENST00000543190 STRN4Q9NRL3 753 aa26.73■■□□□ 1.87
LTBR-211ENST00000543190 USP54Q70EL1 1684 aa26.73■■□□□ 1.87
LTBR-211ENST00000543190 PARD3Q8TEW0 1356 aa26.72■■□□□ 1.87
LTBR-211ENST00000543190 TCP11L2Q8N4U5 519 aa26.72■■□□□ 1.87
LTBR-211ENST00000543190 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.71■■□□□ 1.87
LTBR-211ENST00000543190 EVA1CP58658 441 aa26.71■■□□□ 1.87
LTBR-211ENST00000543190 CRB1P82279 1406 aa26.71■■□□□ 1.87
LTBR-211ENST00000543190 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
LTBR-211ENST00000543190 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
LTBR-211ENST00000543190 ABCC6O95255 1503 aa26.7■■□□□ 1.86
LTBR-211ENST00000543190 TTC21AQ8NDW8 1320 aa26.69■■□□□ 1.86
LTBR-211ENST00000543190 NLRP6P59044 892 aa26.69■■□□□ 1.86
LTBR-211ENST00000543190 WNK3Q9BYP7 1800 aa26.67■■□□□ 1.86
LTBR-211ENST00000543190 RREB1Q92766 1687 aa26.67■■□□□ 1.86
LTBR-211ENST00000543190 PEAK1Q9H792 1746 aa26.67■■□□□ 1.86
LTBR-211ENST00000543190 NEUROD1Q13562 356 aa26.66■■□□□ 1.86
LTBR-211ENST00000543190 FAM182BQ5T319 152 aa26.66■■□□□ 1.86
LTBR-211ENST00000543190 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa26.65■■□□□ 1.86
LTBR-211ENST00000543190 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
LTBR-211ENST00000543190 CAMKK2Q96RR4 588 aa26.65■■□□□ 1.86
LTBR-211ENST00000543190 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
LTBR-211ENST00000543190 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.64■■□□□ 1.86
LTBR-211ENST00000543190 SBF2Q86WG5 1849 aa26.64■■□□□ 1.85
LTBR-211ENST00000543190 PDE3BQ13370 1112 aa26.63■■□□□ 1.85
LTBR-211ENST00000543190 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.63■■□□□ 1.85
LTBR-211ENST00000543190 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
LTBR-211ENST00000543190 NFAT5O94916 1531 aa26.63■■□□□ 1.85
LTBR-211ENST00000543190 RGPD5Q99666 1765 aa26.63■■□□□ 1.85
LTBR-211ENST00000543190 ARHGEF25Q86VW2 580 aa26.62■■□□□ 1.85
LTBR-211ENST00000543190 USP35Q9P2H5 1018 aa26.62■■□□□ 1.85
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