RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP34.23■■■■□ 3.07
PITX3-202ENST00000539804 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
PITX3-202ENST00000539804 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP34.21■■■■□ 3.07
PITX3-202ENST00000539804 ALS2Q96Q42 1657 aa34.19■■■■□ 3.06
PITX3-202ENST00000539804 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP34.18■■■■□ 3.06
PITX3-202ENST00000539804 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
PITX3-202ENST00000539804 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
PITX3-202ENST00000539804 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
PITX3-202ENST00000539804 CABP1Q9NZU7 370 aa34.17■■■■□ 3.06
PITX3-202ENST00000539804 CABLES1Q8TDN4 633 aa34.12■■■■□ 3.05
PITX3-202ENST00000539804 ABTB2Q8N961 1025 aa34.11■■■■□ 3.05
PITX3-202ENST00000539804 UNC5CLQ8IV45 518 aa34.09■■■■□ 3.05
PITX3-202ENST00000539804 ABCA3Q99758 1704 aa34.09■■■■□ 3.05
PITX3-202ENST00000539804 NLRP13Q86W25 1043 aa34.08■■■■□ 3.05
PITX3-202ENST00000539804 SLIT2O94813 1529 aa34.08■■■■□ 3.05
PITX3-202ENST00000539804 ATRNO75882 1429 aa34.07■■■■□ 3.04
PITX3-202ENST00000539804 USP6P35125 1406 aa34.07■■■■□ 3.04
PITX3-202ENST00000539804 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa34.06■■■■□ 3.04
PITX3-202ENST00000539804 PLEKHG5O94827 1062 aa34.06■■■■□ 3.04
PITX3-202ENST00000539804 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
PITX3-202ENST00000539804 BCL9LQ86UU0 1499 aa34.06■■■■□ 3.04
PITX3-202ENST00000539804 USP47Q96K76 1375 aa34.04■■■■□ 3.04
PITX3-202ENST00000539804 NINLQ9Y2I6 1382 aa34.03■■■■□ 3.04
PITX3-202ENST00000539804 NWD2Q9ULI1 1742 aa34.03■■■■□ 3.04
PITX3-202ENST00000539804 CDCA8Q53HL2 280 aa34.02■■■■□ 3.04
PITX3-202ENST00000539804 TMF1P82094 1093 aa34■■■■□ 3.03
PITX3-202ENST00000539804 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
PITX3-202ENST00000539804 TTC21AQ8NDW8 1320 aa34■■■■□ 3.03
PITX3-202ENST00000539804 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP33.99■■■■□ 3.03
PITX3-202ENST00000539804 TESK2Q96S53 571 aa33.99■■■■□ 3.03
PITX3-202ENST00000539804 PRDM11Q9NQV5 511 aa33.99■■■■□ 3.03
PITX3-202ENST00000539804 TERF2IPQ9NYB0 399 aa33.99■■■■□ 3.03
PITX3-202ENST00000539804 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
PITX3-202ENST00000539804 FAM83GA6ND36 823 aa33.98■■■■□ 3.03
PITX3-202ENST00000539804 TMC1Q8TDI8 760 aa33.97■■■■□ 3.03
PITX3-202ENST00000539804 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
PITX3-202ENST00000539804 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP33.96■■■■□ 3.03
PITX3-202ENST00000539804 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa33.96■■■■□ 3.03
PITX3-202ENST00000539804 VPS72Q15906 364 aa33.96■■■■□ 3.03
PITX3-202ENST00000539804 USP19O94966 1318 aa33.96■■■■□ 3.03
PITX3-202ENST00000539804 NUTM2GQ5VZR2 741 aa33.95■■■■□ 3.03
PITX3-202ENST00000539804 PLCH1Q4KWH8 1693 aa33.95■■■■□ 3.03
PITX3-202ENST00000539804 AKAP12Q02952 1782 aa33.94■■■■□ 3.02
PITX3-202ENST00000539804 NLRP6P59044 892 aa33.94■■■■□ 3.02
PITX3-202ENST00000539804 SSH2Q76I76 1423 aa33.94■■■■□ 3.02
PITX3-202ENST00000539804 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP33.93■■■■□ 3.02
PITX3-202ENST00000539804 BTG4Q9NY30 223 aa33.92■■■■□ 3.02
PITX3-202ENST00000539804 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa33.92■■■■□ 3.02
PITX3-202ENST00000539804 RGS12O14924 1447 aa33.9■■■■□ 3.02
PITX3-202ENST00000539804 CPDO75976 1380 aa33.9■■■■□ 3.02
PITX3-202ENST00000539804 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
PITX3-202ENST00000539804 KIAA0232Q92628 1395 aa33.89■■■■□ 3.02
PITX3-202ENST00000539804 GCP02774 474 aa33.89■■■■□ 3.02
PITX3-202ENST00000539804 KCNH5Q8NCM2 988 aa33.89■■■■□ 3.02
PITX3-202ENST00000539804 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP33.86■■■■□ 3.01
PITX3-202ENST00000539804 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa33.85■■■■□ 3.01
PITX3-202ENST00000539804 NRKQ7Z2Y5 1582 aa33.85■■■■□ 3.01
PITX3-202ENST00000539804 MON2Q7Z3U7 1717 aa33.84■■■■□ 3.01
PITX3-202ENST00000539804 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP33.84■■■■□ 3.01
PITX3-202ENST00000539804 SLIT3O75094 1523 aa33.81■■■■□ 3
PITX3-202ENST00000539804 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP33.81■■■■□ 3
PITX3-202ENST00000539804 PIK3C2AO00443 1686 aa33.8■■■■□ 3
PITX3-202ENST00000539804 NRAPQ86VF7 1730 aa33.8■■■■□ 3
PITX3-202ENST00000539804 EVA1CP58658 441 aa33.8■■■■□ 3
PITX3-202ENST00000539804 CD163L1Q9NR16 1453 aa33.79■■■■□ 3
PITX3-202ENST00000539804 A0A1W2PP64 1363 aa33.77■■■■□ 3
PITX3-202ENST00000539804 USP31Q70CQ4 1352 aa33.77■■■■□ 3
PITX3-202ENST00000539804 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP33.77■■■■□ 3
PITX3-202ENST00000539804 CHRNA2Q15822 529 aa33.77■■■■□ 3
PITX3-202ENST00000539804 GLI3P10071 1580 aa33.77■■■■□ 3
PITX3-202ENST00000539804 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP33.76■■■□□ 2.99
PITX3-202ENST00000539804 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa33.75■■■□□ 2.99
PITX3-202ENST00000539804 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa33.74■■■□□ 2.99
PITX3-202ENST00000539804 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa33.74■■■□□ 2.99
PITX3-202ENST00000539804 AATKQ6ZMQ8 1374 aa33.73■■■□□ 2.99
PITX3-202ENST00000539804 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP33.71■■■□□ 2.99
PITX3-202ENST00000539804 STRN4Q9NRL3 753 aa33.71■■■□□ 2.99
PITX3-202ENST00000539804 SEPT12Q8IYM1 358 aa33.7■■■□□ 2.99
PITX3-202ENST00000539804 USP54Q70EL1 1684 aa33.68■■■□□ 2.98
PITX3-202ENST00000539804 A0A0G2JS52 829 aa33.68■■■□□ 2.98
PITX3-202ENST00000539804 MYT1Q01538 1121 aa33.68■■■□□ 2.98
PITX3-202ENST00000539804 LMO7Q8WWI1 1683 aa33.67■■■□□ 2.98
PITX3-202ENST00000539804 ZBTB7CA1YPR0 619 aa33.66■■■□□ 2.98
PITX3-202ENST00000539804 ABCC6O95255 1503 aa33.66■■■□□ 2.98
PITX3-202ENST00000539804 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa33.66■■■□□ 2.98
PITX3-202ENST00000539804 ARHGEF25Q86VW2 580 aa33.66■■■□□ 2.98
PITX3-202ENST00000539804 CCDC125Q86Z20 511 aa33.66■■■□□ 2.98
PITX3-202ENST00000539804 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP33.66■■■□□ 2.98
PITX3-202ENST00000539804 NME9Q86XW9 330 aa33.65■■■□□ 2.98
PITX3-202ENST00000539804 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa33.64■■■□□ 2.98
PITX3-202ENST00000539804 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP33.64■■■□□ 2.98
PITX3-202ENST00000539804 COG3Q96JB2 828 aa33.63■■■□□ 2.97
PITX3-202ENST00000539804 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP33.62■■■□□ 2.97
PITX3-202ENST00000539804 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP33.61■■■□□ 2.97
PITX3-202ENST00000539804 BARGINQ6ZT62 677 aa33.61■■■□□ 2.97
PITX3-202ENST00000539804 KRT27Q7Z3Y8 459 aa33.61■■■□□ 2.97
PITX3-202ENST00000539804 TCP11L2Q8N4U5 519 aa33.6■■■□□ 2.97
PITX3-202ENST00000539804 NFAT5O94916 1531 aa33.59■■■□□ 2.97
PITX3-202ENST00000539804 SOX12O15370 315 aa33.59■■■□□ 2.97
PITX3-202ENST00000539804 CRB1P82279 1406 aa33.58■■■□□ 2.97
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