RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534206.5

ACER3-214, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 5

Gene ACER3, Length 834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-214ENST00000534206 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa41.2■■■■■ 4.19
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ACER3-214ENST00000534206 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP41.19■■■■■ 4.18
ACER3-214ENST00000534206 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
ACER3-214ENST00000534206 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP41.17■■■■■ 4.18
ACER3-214ENST00000534206 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa41.16■■■■■ 4.18
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ACER3-214ENST00000534206 CCDC61Q9Y6R9 512 aa41.16■■■■■ 4.18
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ACER3-214ENST00000534206 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa41.04■■■■■ 4.16
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ACER3-214ENST00000534206 NEUROD1Q13562 356 aa40.91■■■■■ 4.14
ACER3-214ENST00000534206 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa40.91■■■■■ 4.14
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ACER3-214ENST00000534206 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa40.86■■■■■ 4.13
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ACER3-214ENST00000534206 LMO7Q8WWI1 1683 aa40.83■■■■■ 4.13
ACER3-214ENST00000534206 STRN4Q9NRL3 753 aa40.83■■■■■ 4.13
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ACER3-214ENST00000534206 COL18A1P39060 1754 aa40.61■■■■■ 4.09
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ACER3-214ENST00000534206 CRB1P82279 1406 aa40.52■■■■■ 4.08
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ACER3-214ENST00000534206 KCNH5Q8NCM2 988 aa40.41■■■■■ 4.06
ACER3-214ENST00000534206 WDR17Q8IZU2 1322 aa40.4■■■■■ 4.06
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