RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533775.5

TSSC2-206, Transcript of tumor suppressing subtransferable candidate 2 pseudogene, human

TSL 5

Gene TSSC2, Length 1,210 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSSC2-206	ENST00000533775	BTG4	Q9NY30	223 aa		28.11	■■■□□ 2.09
TSSC2-206	ENST00000533775	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	28.08	■■■□□ 2.09
TSSC2-206	ENST00000533775	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		28.07	■■■□□ 2.08
TSSC2-206	ENST00000533775	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		28.07	■■■□□ 2.08
TSSC2-206	ENST00000533775	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		28.07	■■■□□ 2.08
TSSC2-206	ENST00000533775	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	28.06	■■■□□ 2.08
TSSC2-206	ENST00000533775	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		28.06	■■■□□ 2.08
TSSC2-206	ENST00000533775	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		28.06	■■■□□ 2.08
TSSC2-206	ENST00000533775	ACE	P12821	1306 aa		28.06	■■■□□ 2.08
TSSC2-206	ENST00000533775	CCDC125	Q86Z20	511 aa		28.05	■■■□□ 2.08
TSSC2-206	ENST00000533775	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	28.04	■■■□□ 2.08
TSSC2-206	ENST00000533775	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		28.04	■■■□□ 2.08
TSSC2-206	ENST00000533775	EP400	Q96L91	3159 aa		28.04	■■■□□ 2.08
TSSC2-206	ENST00000533775	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	28.03	■■■□□ 2.08
TSSC2-206	ENST00000533775	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		28.03	■■■□□ 2.08
TSSC2-206	ENST00000533775	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	28.02	■■■□□ 2.08
TSSC2-206	ENST00000533775	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		28.02	■■■□□ 2.08
TSSC2-206	ENST00000533775	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.08
TSSC2-206	ENST00000533775	CHRNA2	Q15822	529 aa		28.01	■■■□□ 2.07
TSSC2-206	ENST00000533775	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		28.01	■■■□□ 2.07
TSSC2-206	ENST00000533775	KIAA0232	Q92628	1395 aa		28	■■■□□ 2.07
TSSC2-206	ENST00000533775		A0A0G2JS52	829 aa		28	■■■□□ 2.07
TSSC2-206	ENST00000533775	MYT1	Q01538	1121 aa		28	■■■□□ 2.07
TSSC2-206	ENST00000533775	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		28	■■■□□ 2.07
TSSC2-206	ENST00000533775	CABP2	Q9NPB3	220 aa		28	■■■□□ 2.07
TSSC2-206	ENST00000533775	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
TSSC2-206	ENST00000533775	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
TSSC2-206	ENST00000533775	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
TSSC2-206	ENST00000533775	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TSSC2-206	ENST00000533775	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TSSC2-206	ENST00000533775	NEUROD1	Q13562	356 aa		27.97	■■■□□ 2.07
TSSC2-206	ENST00000533775	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		27.96	■■■□□ 2.07
TSSC2-206	ENST00000533775	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		27.95	■■■□□ 2.07
TSSC2-206	ENST00000533775	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		27.95	■■■□□ 2.06
TSSC2-206	ENST00000533775	FAM182B	Q5T319	152 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TSSC2-206	ENST00000533775	ABTB2	Q8N961	1025 aa		27.93	■■■□□ 2.06
TSSC2-206	ENST00000533775	STRN4	Q9NRL3	753 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TSSC2-206	ENST00000533775	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		27.92	■■■□□ 2.06
TSSC2-206	ENST00000533775	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		27.9	■■■□□ 2.06
TSSC2-206	ENST00000533775	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TSSC2-206	ENST00000533775	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
TSSC2-206	ENST00000533775	CABP1	Q9NZU7	370 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TSSC2-206	ENST00000533775	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		27.89	■■■□□ 2.05
TSSC2-206	ENST00000533775	USP19	O94966	1318 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TSSC2-206	ENST00000533775	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TSSC2-206	ENST00000533775	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
TSSC2-206	ENST00000533775	NLRP13	Q86W25	1043 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TSSC2-206	ENST00000533775	USP35	Q9P2H5	1018 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TSSC2-206	ENST00000533775	USP6	P35125	1406 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TSSC2-206	ENST00000533775	SSH2	Q76I76	1423 aa		27.83	■■■□□ 2.05
TSSC2-206	ENST00000533775	GC	P02774	474 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TSSC2-206	ENST00000533775	CPD	O75976	1380 aa		27.82	■■■□□ 2.04
TSSC2-206	ENST00000533775	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TSSC2-206	ENST00000533775	EVA1C	P58658	441 aa		27.81	■■■□□ 2.04
TSSC2-206	ENST00000533775	LARP1	Q6PKG0	1096 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
TSSC2-206	ENST00000533775	EVC2	Q86UK5	1308 aa		27.8	■■■□□ 2.04
TSSC2-206	ENST00000533775	BAG6	P46379	1132 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TSSC2-206	ENST00000533775	NLRP6	P59044	892 aa		27.77	■■■□□ 2.04
TSSC2-206	ENST00000533775	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
TSSC2-206	ENST00000533775	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
TSSC2-206	ENST00000533775	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		27.75	■■■□□ 2.03
TSSC2-206	ENST00000533775	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TSSC2-206	ENST00000533775	PIK3C2A	O00443	1686 aa		27.74	■■■□□ 2.03
TSSC2-206	ENST00000533775	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		27.73	■■■□□ 2.03
TSSC2-206	ENST00000533775	SLIT3	O75094	1523 aa		27.72	■■■□□ 2.03
TSSC2-206	ENST00000533775	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
TSSC2-206	ENST00000533775	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
TSSC2-206	ENST00000533775	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		27.71	■■■□□ 2.03
TSSC2-206	ENST00000533775	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
TSSC2-206	ENST00000533775	TRIM37	O94972	964 aa		27.7	■■■□□ 2.02
TSSC2-206	ENST00000533775	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		27.69	■■■□□ 2.02
TSSC2-206	ENST00000533775	AKAP12	Q02952	1782 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TSSC2-206	ENST00000533775	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		27.68	■■■□□ 2.02
TSSC2-206	ENST00000533775	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		27.67	■■■□□ 2.02
TSSC2-206	ENST00000533775	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		27.66	■■■□□ 2.02
TSSC2-206	ENST00000533775	PDE3B	Q13370	1112 aa		27.66	■■■□□ 2.02
TSSC2-206	ENST00000533775	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
TSSC2-206	ENST00000533775	DISP2	A7MBM2	1401 aa		27.66	■■■□□ 2.02
TSSC2-206	ENST00000533775	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
TSSC2-206	ENST00000533775	COL18A1	P39060	1754 aa		27.65	■■■□□ 2.02
TSSC2-206	ENST00000533775	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02
TSSC2-206	ENST00000533775	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		27.65	■■■□□ 2.02
TSSC2-206	ENST00000533775	SOX12	O15370	315 aa		27.64	■■■□□ 2.02
TSSC2-206	ENST00000533775	AXIN2	Q9Y2T1	843 aa		27.64	■■■□□ 2.02
TSSC2-206	ENST00000533775	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
TSSC2-206	ENST00000533775	CRB1	P82279	1406 aa		27.63	■■■□□ 2.01
TSSC2-206	ENST00000533775	TONSL	Q96HA7	1378 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TSSC2-206	ENST00000533775	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TSSC2-206	ENST00000533775	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		27.61	■■■□□ 2.01
TSSC2-206	ENST00000533775	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
TSSC2-206	ENST00000533775	APBA3	O96018	575 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TSSC2-206	ENST00000533775	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TSSC2-206	ENST00000533775	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		27.6	■■■□□ 2.01
TSSC2-206	ENST00000533775	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
TSSC2-206	ENST00000533775	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		27.58	■■■□□ 2.01
TSSC2-206	ENST00000533775	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		27.57	■■■□□ 2
TSSC2-206	ENST00000533775	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
TSSC2-206	ENST00000533775	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		27.57	■■■□□ 2
TSSC2-206	ENST00000533775	RGPD5	Q99666	1765 aa		27.57	■■■□□ 2
TSSC2-206	ENST00000533775	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	27.56	■■■□□ 2

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