RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519617.1

CCNC-208, Transcript of cyclin C, human

TSL 3

Gene CCNC, Length 246 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNC-208	ENST00000519617	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
CCNC-208	ENST00000519617	GMPR	P36959	345 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CCNC-208	ENST00000519617	LYPD8	Q6UX82	237 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CCNC-208	ENST00000519617	ZFP42	Q96MM3	310 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CCNC-208	ENST00000519617	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CCNC-208	ENST00000519617	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CCNC-208	ENST00000519617	NNT	Q13423	1086 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CCNC-208	ENST00000519617	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
CCNC-208	ENST00000519617	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CCNC-208	ENST00000519617	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
CCNC-208	ENST00000519617	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CCNC-208	ENST00000519617	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
CCNC-208	ENST00000519617	TIMP2	P16035	220 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CCNC-208	ENST00000519617	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CCNC-208	ENST00000519617	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
CCNC-208	ENST00000519617	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CCNC-208	ENST00000519617	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CCNC-208	ENST00000519617	CDK15	Q96Q40	435 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CCNC-208	ENST00000519617	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CCNC-208	ENST00000519617	ERBB4	Q15303	1308 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CCNC-208	ENST00000519617	SPTLC1	O15269	473 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CCNC-208	ENST00000519617	ADH1C	P00326	375 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CCNC-208	ENST00000519617	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CCNC-208	ENST00000519617	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
CCNC-208	ENST00000519617	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CCNC-208	ENST00000519617	CFAP99	D6REC4	459 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CCNC-208	ENST00000519617	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CCNC-208	ENST00000519617	CTH	P32929	405 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CCNC-208	ENST00000519617	VEGFB	P49765	207 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CCNC-208	ENST00000519617	SCARF1	Q14162	830 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CCNC-208	ENST00000519617	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
CCNC-208	ENST00000519617	HRC	P23327	699 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CCNC-208	ENST00000519617	FOXJ1	Q92949	421 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CCNC-208	ENST00000519617	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CCNC-208	ENST00000519617	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		5.07	□□□□□ -1.6
CCNC-208	ENST00000519617	TRIM66	O15016	1216 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCNC-208	ENST00000519617	VSIG8	P0DPA2	414 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCNC-208	ENST00000519617	GRM5	P41594	1212 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCNC-208	ENST00000519617	NR5A1	Q13285	461 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCNC-208	ENST00000519617	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCNC-208	ENST00000519617	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCNC-208	ENST00000519617	MAP10	Q9P2G4	905 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CCNC-208	ENST00000519617	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCNC-208	ENST00000519617	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CCNC-208	ENST00000519617	SOBP	A7XYQ1	873 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCNC-208	ENST00000519617	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CCNC-208	ENST00000519617	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CCNC-208	ENST00000519617	NR3C2	P08235	984 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCNC-208	ENST00000519617	ARID5B	Q14865	1188 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCNC-208	ENST00000519617	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCNC-208	ENST00000519617	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CCNC-208	ENST00000519617	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCNC-208	ENST00000519617	ITPKC	Q96DU7	683 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CCNC-208	ENST00000519617	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CCNC-208	ENST00000519617	AK7	Q96M32	723 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CCNC-208	ENST00000519617	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CCNC-208	ENST00000519617	MAN1A2	O60476	641 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CCNC-208	ENST00000519617	LILRB3	O75022	631 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CCNC-208	ENST00000519617	AGER	Q15109	404 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CCNC-208	ENST00000519617	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CCNC-208	ENST00000519617	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CCNC-208	ENST00000519617	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CCNC-208	ENST00000519617	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CCNC-208	ENST00000519617	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
CCNC-208	ENST00000519617	MEIOB	Q8N635	442 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CCNC-208	ENST00000519617	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CCNC-208	ENST00000519617	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
CCNC-208	ENST00000519617	PPFIA3	O75145	1194 aa		5	□□□□□ -1.61
CCNC-208	ENST00000519617	UPP2	O95045	317 aa		5	□□□□□ -1.61
CCNC-208	ENST00000519617	BMP2	P12643	396 aa		5	□□□□□ -1.61
CCNC-208	ENST00000519617	QPCT	Q16769	361 aa		5	□□□□□ -1.61
CCNC-208	ENST00000519617	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		5	□□□□□ -1.61
CCNC-208	ENST00000519617	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		5	□□□□□ -1.61
CCNC-208	ENST00000519617	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		5	□□□□□ -1.61
CCNC-208	ENST00000519617	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CCNC-208	ENST00000519617	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CCNC-208	ENST00000519617	NBPF14	Q5TI25	921 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCNC-208	ENST00000519617	NUTM2D	Q5VT03	806 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CCNC-208	ENST00000519617	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CCNC-208	ENST00000519617	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CCNC-208	ENST00000519617	FSHR	P23945	695 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNC-208	ENST00000519617	PDE4D	Q08499	809 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNC-208	ENST00000519617	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CCNC-208	ENST00000519617	VASH1	Q7L8A9	365 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CCNC-208	ENST00000519617	TSC1	Q92574	1164 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNC-208	ENST00000519617	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
CCNC-208	ENST00000519617	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CCNC-208	ENST00000519617	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CCNC-208	ENST00000519617	KCNMA1	Q12791	1236 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNC-208	ENST00000519617	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CCNC-208	ENST00000519617	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CCNC-208	ENST00000519617	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNC-208	ENST00000519617	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
CCNC-208	ENST00000519617	ERFE	Q4G0M1	354 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNC-208	ENST00000519617	TTLL8	A6PVC2	850 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNC-208	ENST00000519617	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCNC-208	ENST00000519617	GSK3A	P49840	483 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNC-208	ENST00000519617	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNC-208	ENST00000519617		Q6ZVU0	165 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNC-208	ENST00000519617	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62

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