RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516411.1

RNU6-977P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 977, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-977P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-977P-201ENST00000516411 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
RNU6-977P-201ENST00000516411 NKAPLQ5M9Q1 402 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-977P-201ENST00000516411 TYW1BQ6NUM6 668 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-977P-201ENST00000516411 KCNV2Q8TDN2 545 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-977P-201ENST00000516411 TSKSQ9UJT2 592 aa2.36□□□□□ -2.03
RNU6-977P-201ENST00000516411 CDC14CA4D256 554 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-977P-201ENST00000516411 ELNP15502 786 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-977P-201ENST00000516411 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-977P-201ENST00000516411 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-977P-201ENST00000516411 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-977P-201ENST00000516411 CERKQ8TCT0 537 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-977P-201ENST00000516411 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
RNU6-977P-201ENST00000516411 GATA4P43694 442 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-977P-201ENST00000516411 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-977P-201ENST00000516411 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-977P-201ENST00000516411 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 OSBPP22059 807 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 SLF2Q8IX21 1173 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 MKL2Q9ULH7 1088 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 SMYD5Q6GMV2 418 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 LILRA6Q6PI73 481 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 TTC13Q8NBP0 860 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 DDX12PQ92771 950 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 BCRP11274 1271 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 NBR1Q14596 966 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 OGFOD2Q6N063 350 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 VWA5B2Q8N398 1253 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 WASF2Q9Y6W5 498 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 GRXCR2A6NFK2 248 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 SEMA3EO15041 775 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 PRSS12P56730 875 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 PTGDRQ13258 359 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 SV2AQ7L0J3 742 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 GPR37O15354 613 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 MAP3K7O43318 606 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 SLC24A1O60721 1099 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 KRTAP5-9P26371 169 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 TRIM32Q13049 653 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 HIC1Q14526 733 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 CDCA7LQ96GN5 454 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 SUV39H2Q9H5I1 410 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 TPSG1Q9NRR2 321 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 PNMA3Q9UL41 463 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 NBPF26B4DH59 902 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 FCHSD2O94868 740 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 SLC4A3P48751 1232 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 C6orf118Q5T5N4 469 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 CDHR5Q9HBB8 845 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 FAM198AQ9UFP1 575 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-977P-201ENST00000516411 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 NR1I2O75469 434 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 IGHA2P01877 340 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 PTSQ03393 145 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 RIC3Q7Z5B4 369 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 TATDN2Q93075 761 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 EYA1Q99502 592 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 C3orf80F5H4A9 247 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 GNPATO15228 680 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 OATP04181 439 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 PADI6Q6TGC4 694 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 RRAGCQ9HB90 399 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 PCMTD2Q9NV79 361 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 DNMT3LQ9UJW3 386 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 ADGRG1Q9Y653 693 aa2.26□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 NUTM2FA1L443 756 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 GPIHBP1Q8IV16 184 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 CCDC155Q8N6L0 562 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 PXYLP1Q8TE99 480 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 SPSB2Q99619 263 aa2.25□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZMYND10O75800 440 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 DNAJB2P25686 324 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 MAP2K5Q13163 448 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 GAS6Q14393 721 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 NUDT18Q6ZVK8 323 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 TMEM134Q9H6X4 195 aa2.24□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 IRF6O14896 467 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 SUV39H1O43463 412 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 FECHP22830 423 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 ITGA6P23229 1130 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 BARGINQ6ZT62 677 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 BCANQ96GW7 911 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 IGF1RP08069 1367 aa2.23□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 RCCD1A6NED2 376 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 POU5F2Q8N7G0 328 aa2.22□□□□□ -2.05
RNU6-977P-201ENST00000516411 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.4 ms