RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502260.5

SH3BP2-205, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 727 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-205ENST00000502260 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa20.24■□□□□ 0.83
SH3BP2-205ENST00000502260 BAG6P46379 1132 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-205ENST00000502260 ABCA3Q99758 1704 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-205ENST00000502260 BRWD3Q6RI45 1802 aa20.23■□□□□ 0.83
SH3BP2-205ENST00000502260 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-205ENST00000502260 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SH3BP2-205ENST00000502260 HRCP23327 699 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-205ENST00000502260 PRDM11Q9NQV5 511 aa20.21■□□□□ 0.83
SH3BP2-205ENST00000502260 FAM182BQ5T319 152 aa20.2■□□□□ 0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 ALS2Q96Q42 1657 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 NRAPQ86VF7 1730 aa20.19■□□□□ 0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 CDK19Q9BWU1 502 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 ATP7BP35670 1465 aa20.18■□□□□ 0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 KIAA0232Q92628 1395 aa20.17■□□□□ 0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 CHRNA2Q15822 529 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa20.16■□□□□ 0.82
SH3BP2-205ENST00000502260 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 NUTM2GQ5VZR2 741 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 CCDC61Q9Y6R9 512 aa20.14■□□□□ 0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 ACEP12821 1306 aa20.13■□□□□ 0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 STRN4Q9NRL3 753 aa20.13■□□□□ 0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 PLEKHG3A1L390 1219 aa20.12■□□□□ 0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 DISP2A7MBM2 1401 aa20.11■□□□□ 0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa20.1■□□□□ 0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa20.09■□□□□ 0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 TRIM37O94972 964 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 BARGINQ6ZT62 677 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 CAMKK2Q96RR4 588 aa20.08■□□□□ 0.81
SH3BP2-205ENST00000502260 LRP5O75197 1615 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-205ENST00000502260 EVA1CP58658 441 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-205ENST00000502260 ABTB2Q8N961 1025 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-205ENST00000502260 USP35Q9P2H5 1018 aa20.07■□□□□ 0.8
SH3BP2-205ENST00000502260 SSH2Q76I76 1423 aa20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-205ENST00000502260 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
SH3BP2-205ENST00000502260 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
SH3BP2-205ENST00000502260 USP19O94966 1318 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP2-205ENST00000502260 CPDO75976 1380 aa20.04■□□□□ 0.8
SH3BP2-205ENST00000502260 APBA3O96018 575 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-205ENST00000502260 PDE3BQ13370 1112 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-205ENST00000502260 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.03■□□□□ 0.8
SH3BP2-205ENST00000502260 GCP02774 474 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-205ENST00000502260 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-205ENST00000502260 NLRP13Q86W25 1043 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-205ENST00000502260 CABP2Q9NPB3 220 aa20.02■□□□□ 0.8
SH3BP2-205ENST00000502260 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-205ENST00000502260 RGPD1P0DJD0 1748 aa20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-205ENST00000502260 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-205ENST00000502260 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
SH3BP2-205ENST00000502260 ITSN1Q15811 1721 aa20■□□□□ 0.79
SH3BP2-205ENST00000502260 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
SH3BP2-205ENST00000502260 PARD3Q8TEW0 1356 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-205ENST00000502260 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa19.99■□□□□ 0.79
SH3BP2-205ENST00000502260 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-205ENST00000502260 NRKQ7Z2Y5 1582 aa19.98■□□□□ 0.79
SH3BP2-205ENST00000502260 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
SH3BP2-205ENST00000502260 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
SH3BP2-205ENST00000502260 CABP1Q9NZU7 370 aa19.96■□□□□ 0.79
SH3BP2-205ENST00000502260 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP2-205ENST00000502260 LMO7Q8WWI1 1683 aa19.94■□□□□ 0.78
SH3BP2-205ENST00000502260 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
SH3BP2-205ENST00000502260 NLRP6P59044 892 aa19.93■□□□□ 0.78
SH3BP2-205ENST00000502260 ZBTB7CA1YPR0 619 aa19.92■□□□□ 0.78
SH3BP2-205ENST00000502260 NBPF14Q5TI25 921 aa19.92■□□□□ 0.78
SH3BP2-205ENST00000502260 USP6P35125 1406 aa19.92■□□□□ 0.78
SH3BP2-205ENST00000502260 L3MBTL2Q969R5 705 aa19.91■□□□□ 0.78
SH3BP2-205ENST00000502260 AATKQ6ZMQ8 1374 aa19.91■□□□□ 0.78
SH3BP2-205ENST00000502260 CRB1P82279 1406 aa19.91■□□□□ 0.78
SH3BP2-205ENST00000502260 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
SH3BP2-205ENST00000502260 EVC2Q86UK5 1308 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP2-205ENST00000502260 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP2-205ENST00000502260 AXIN2Q9Y2T1 843 aa19.87■□□□□ 0.77
SH3BP2-205ENST00000502260 DDB1Q16531 1140 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP2-205ENST00000502260 SLIT3O75094 1523 aa19.86■□□□□ 0.77
SH3BP2-205ENST00000502260 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP2-205ENST00000502260 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP2-205ENST00000502260 OVOS2Q6IE36 1432 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP2-205ENST00000502260 ARHGEF25Q86VW2 580 aa19.85■□□□□ 0.77
SH3BP2-205ENST00000502260 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
SH3BP2-205ENST00000502260 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP2-205ENST00000502260 PLSCR1O15162 318 aa19.84■□□□□ 0.77
SH3BP2-205ENST00000502260 WDR17Q8IZU2 1322 aa19.83■□□□□ 0.77
SH3BP2-205ENST00000502260 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
SH3BP2-205ENST00000502260 SIN3AQ96ST3 1273 aa19.83■□□□□ 0.77
SH3BP2-205ENST00000502260 RREB1Q92766 1687 aa19.82■□□□□ 0.76
SH3BP2-205ENST00000502260 PTF1AQ7RTS3 328 aa19.82■□□□□ 0.76
SH3BP2-205ENST00000502260 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
SH3BP2-205ENST00000502260 SPON1Q9HCB6 807 aa19.82■□□□□ 0.76
SH3BP2-205ENST00000502260 KCNQ2O43526 872 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP2-205ENST00000502260 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
SH3BP2-205ENST00000502260 KCNH5Q8NCM2 988 aa19.81■□□□□ 0.76
SH3BP2-205ENST00000502260 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms