RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497115.5

ETV1-223, Transcript of ETS variant 1, human

TSL 4

Gene ETV1, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ETV1-223	ENST00000497115	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		10.86	□□□□□ -0.67
ETV1-223	ENST00000497115	POTEM	A6NI47	508 aa		10.85	□□□□□ -0.67
ETV1-223	ENST00000497115	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		10.85	□□□□□ -0.67
ETV1-223	ENST00000497115	TLL1	O43897	1013 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ETV1-223	ENST00000497115	FBXO45	P0C2W1	286 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ETV1-223	ENST00000497115	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
ETV1-223	ENST00000497115	CTH	P32929	405 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ETV1-223	ENST00000497115	KCNH2	Q12809	1159 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ETV1-223	ENST00000497115	SEMA3F	Q13275	785 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ETV1-223	ENST00000497115	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ETV1-223	ENST00000497115	IL21	Q9HBE4	155 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ETV1-223	ENST00000497115	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ETV1-223	ENST00000497115	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		10.84	□□□□□ -0.67
ETV1-223	ENST00000497115	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ETV1-223	ENST00000497115	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ETV1-223	ENST00000497115	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		10.83	□□□□□ -0.68
ETV1-223	ENST00000497115	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ETV1-223	ENST00000497115	NBPF14	Q5TI25	921 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ETV1-223	ENST00000497115	UCN2	Q96RP3	112 aa		10.82	□□□□□ -0.68
ETV1-223	ENST00000497115	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ETV1-223	ENST00000497115	ZNF592	Q92610	1267 aa		10.81	□□□□□ -0.68
ETV1-223	ENST00000497115	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
ETV1-223	ENST00000497115	POTEG	Q6S5H5	508 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ETV1-223	ENST00000497115	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		10.8	□□□□□ -0.68
ETV1-223	ENST00000497115	PTPN5	P54829	565 aa		10.79	□□□□□ -0.68
ETV1-223	ENST00000497115	PTK2	Q05397	1052 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ETV1-223	ENST00000497115	RETREG2	Q8NC44	543 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ETV1-223	ENST00000497115	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		10.78	□□□□□ -0.68
ETV1-223	ENST00000497115	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
ETV1-223	ENST00000497115	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		10.77	□□□□□ -0.69
ETV1-223	ENST00000497115	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.69
ETV1-223	ENST00000497115	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
ETV1-223	ENST00000497115	ZNF516	Q92618	1163 aa		10.76	□□□□□ -0.69
ETV1-223	ENST00000497115	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
ETV1-223	ENST00000497115	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
ETV1-223	ENST00000497115	ATP9B	O43861	1147 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ETV1-223	ENST00000497115	PDE4C	Q08493	712 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ETV1-223	ENST00000497115	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		10.75	□□□□□ -0.69
ETV1-223	ENST00000497115	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
ETV1-223	ENST00000497115	RFX1	P22670	979 aa		10.73	□□□□□ -0.69
ETV1-223	ENST00000497115	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
ETV1-223	ENST00000497115	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		10.73	□□□□□ -0.69
ETV1-223	ENST00000497115	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	10.72	□□□□□ -0.69
ETV1-223	ENST00000497115	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		10.72	□□□□□ -0.69
ETV1-223	ENST00000497115	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		10.72	□□□□□ -0.69
ETV1-223	ENST00000497115	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		10.72	□□□□□ -0.69
ETV1-223	ENST00000497115	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	10.71	□□□□□ -0.69
ETV1-223	ENST00000497115	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		10.71	□□□□□ -0.69
ETV1-223	ENST00000497115	UST	Q9Y2C2	406 aa		10.71	□□□□□ -0.69
ETV1-223	ENST00000497115	S1PR4	O95977	384 aa		10.7	□□□□□ -0.7
ETV1-223	ENST00000497115	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		10.7	□□□□□ -0.7
ETV1-223	ENST00000497115	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		10.69	□□□□□ -0.7
ETV1-223	ENST00000497115	ADAM32	Q8TC27	787 aa		10.69	□□□□□ -0.7
ETV1-223	ENST00000497115	ATG7	O95352	703 aa		10.68	□□□□□ -0.7
ETV1-223	ENST00000497115	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
ETV1-223	ENST00000497115	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		10.68	□□□□□ -0.7
ETV1-223	ENST00000497115	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		10.68	□□□□□ -0.7
ETV1-223	ENST00000497115	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		10.68	□□□□□ -0.7
ETV1-223	ENST00000497115	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		10.68	□□□□□ -0.7
ETV1-223	ENST00000497115	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
ETV1-223	ENST00000497115	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		10.68	□□□□□ -0.7
ETV1-223	ENST00000497115	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		10.67	□□□□□ -0.7
ETV1-223	ENST00000497115	PIK3CD	O00329	1044 aa		10.67	□□□□□ -0.7
ETV1-223	ENST00000497115	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		10.67	□□□□□ -0.7
ETV1-223	ENST00000497115	ZBTB33	Q86T24	672 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ETV1-223	ENST00000497115	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
ETV1-223	ENST00000497115	HCST	Q9UBK5	93 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ETV1-223	ENST00000497115	USP17L3	A6NCW0	530 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ETV1-223	ENST00000497115	USP17L4	A6NCW7	530 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ETV1-223	ENST00000497115	USP17L5	A8MUK1	530 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ETV1-223	ENST00000497115	SKI	P12755	728 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ETV1-223	ENST00000497115	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ETV1-223	ENST00000497115	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ETV1-223	ENST00000497115	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ETV1-223	ENST00000497115	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ETV1-223	ENST00000497115	ZNF511	Q8NB15	262 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ETV1-223	ENST00000497115	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ETV1-223	ENST00000497115	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ETV1-223	ENST00000497115	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
ETV1-223	ENST00000497115	KCNC4	Q03721	635 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ETV1-223	ENST00000497115	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
ETV1-223	ENST00000497115	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ETV1-223	ENST00000497115	RNF135	Q8IUD6	432 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ETV1-223	ENST00000497115	BAP1	Q92560	729 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ETV1-223	ENST00000497115	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ETV1-223	ENST00000497115	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ETV1-223	ENST00000497115	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ETV1-223	ENST00000497115	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
ETV1-223	ENST00000497115	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		10.62	□□□□□ -0.71
ETV1-223	ENST00000497115	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ETV1-223	ENST00000497115	ERFE	Q4G0M1	354 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ETV1-223	ENST00000497115	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ETV1-223	ENST00000497115	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		10.61	□□□□□ -0.71
ETV1-223	ENST00000497115	GGCX	P38435	758 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ETV1-223	ENST00000497115	LINC01559	Q495D7	138 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ETV1-223	ENST00000497115	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ETV1-223	ENST00000497115	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ETV1-223	ENST00000497115	FOXJ1	Q92949	421 aa		10.6	□□□□□ -0.71
ETV1-223	ENST00000497115	AGER	Q15109	404 aa		10.59	□□□□□ -0.71
ETV1-223	ENST00000497115	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		10.59	□□□□□ -0.71

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