RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 RGS3P49796 1198 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-213ENST00000496055 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-213ENST00000496055 POGKQ9P215 609 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-213ENST00000496055 HFM1A2PYH4 1435 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-213ENST00000496055 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-213ENST00000496055 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-213ENST00000496055 RGS22Q8NE09 1264 aa6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-213ENST00000496055 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-213ENST00000496055 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RABGGTB-213ENST00000496055 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-213ENST00000496055 GCC2Q8IWJ2 1684 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-213ENST00000496055 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-213ENST00000496055 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-213ENST00000496055 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-213ENST00000496055 STK26Q9P289 416 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC144AA2RUR9 1427 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-213ENST00000496055 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-213ENST00000496055 SETD5Q9C0A6 1442 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-213ENST00000496055 ANAPC15P60006 121 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-213ENST00000496055 PTCH1Q13635 1447 aa6.05□□□□□ -1.44
RABGGTB-213ENST00000496055 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-213ENST00000496055 RGL3Q3MIN7 710 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-213ENST00000496055 UNC13BO14795 1591 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-213ENST00000496055 NEFMP07197 916 aa6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-213ENST00000496055 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
RABGGTB-213ENST00000496055 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-213ENST00000496055 ZBTB7CA1YPR0 619 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-213ENST00000496055 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-213ENST00000496055 SETQ01105 290 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-213ENST00000496055 GPRASP1Q5JY77 1395 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-213ENST00000496055 PNPLA6Q8IY17 1366 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-213ENST00000496055 IQGAP3Q86VI3 1631 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-213ENST00000496055 CLGNO14967 610 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-213ENST00000496055 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
RABGGTB-213ENST00000496055 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 SOX12O15370 315 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 GPATCH11Q8N954 259 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 MST1RQ04912 1400 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 STRCP1A6NGW2 1772 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 BAG6P46379 1132 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 C1orf167Q5SNV9 1468 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 METP08581 1390 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 ALKQ9UM73 1620 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 FOXO3O43524 673 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC27Q2M243 656 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 KRT28Q7Z3Y7 464 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 USP35Q9P2H5 1018 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 PHF8Q9UPP1 1060 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 ARHGEF10O15013 1369 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 ORAI2Q96SN7 254 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 NUTM2FA1L443 756 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 MMP14P50281 582 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 UNC5CLQ8IV45 518 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP6□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 SIRT1Q96EB6 747 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 HDAC5Q9UQL6 1122 aa6□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM51Q9NW97 253 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 MPHOSPH9Q99550 1183 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 PTPRUQ92729 1446 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 SHPRHQ149N8 1683 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 MAFGO15525 162 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 PHF14O94880 888 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 E9PCH4 1651 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 KDM4AO75164 1064 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 EVA1CP58658 441 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 NBR1Q14596 966 aa5.99□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 ABCC11Q96J66 1382 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 NAIPQ13075 1403 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 LRP6O75581 1613 aa5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 ROBO2Q9HCK4 1378 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 VGLL3A8MV65 326 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 NBPF8Q3BBV2 869 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 NBPF14Q5TI25 921 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 KRT27Q7Z3Y8 459 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC4A2P04920 1241 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 C1orf115Q9H7X2 142 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 PRDM11Q9NQV5 511 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 KIF1BO60333 1816 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 FKBP8Q14318 412 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
RABGGTB-213ENST00000496055 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms