RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495490.6

TIMM17B-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 17B, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TIMM17B, Length 939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17B-208ENST00000495490 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
TIMM17B-208ENST00000495490 POGKQ9P215 609 aa24.09■■□□□ 1.45
TIMM17B-208ENST00000495490 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.09■■□□□ 1.45
TIMM17B-208ENST00000495490 FAM182BQ5T319 152 aa24.08■■□□□ 1.45
TIMM17B-208ENST00000495490 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
TIMM17B-208ENST00000495490 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.07■■□□□ 1.44
TIMM17B-208ENST00000495490 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.06■■□□□ 1.44
TIMM17B-208ENST00000495490 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
TIMM17B-208ENST00000495490 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
TIMM17B-208ENST00000495490 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
TIMM17B-208ENST00000495490 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.02■■□□□ 1.44
TIMM17B-208ENST00000495490 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
TIMM17B-208ENST00000495490 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
TIMM17B-208ENST00000495490 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
TIMM17B-208ENST00000495490 PRDM11Q9NQV5 511 aa23.99■■□□□ 1.43
TIMM17B-208ENST00000495490 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa23.99■■□□□ 1.43
TIMM17B-208ENST00000495490 CAMKK2Q96RR4 588 aa23.98■■□□□ 1.43
TIMM17B-208ENST00000495490 ITSN1Q15811 1721 aa23.96■■□□□ 1.43
TIMM17B-208ENST00000495490 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
TIMM17B-208ENST00000495490 KIAA0232Q92628 1395 aa23.96■■□□□ 1.43
TIMM17B-208ENST00000495490 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
TIMM17B-208ENST00000495490 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
TIMM17B-208ENST00000495490 TRIM37O94972 964 aa23.94■■□□□ 1.42
TIMM17B-208ENST00000495490 FAM196AQ6ZSG2 479 aa23.94■■□□□ 1.42
TIMM17B-208ENST00000495490 ATP7BP35670 1465 aa23.94■■□□□ 1.42
TIMM17B-208ENST00000495490 RREB1Q92766 1687 aa23.93■■□□□ 1.42
TIMM17B-208ENST00000495490 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
TIMM17B-208ENST00000495490 PARD3Q8TEW0 1356 aa23.92■■□□□ 1.42
TIMM17B-208ENST00000495490 CHRNA2Q15822 529 aa23.92■■□□□ 1.42
TIMM17B-208ENST00000495490 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.9■■□□□ 1.42
TIMM17B-208ENST00000495490 STRN4Q9NRL3 753 aa23.89■■□□□ 1.41
TIMM17B-208ENST00000495490 APBA3O96018 575 aa23.88■■□□□ 1.41
TIMM17B-208ENST00000495490 BARGINQ6ZT62 677 aa23.88■■□□□ 1.41
TIMM17B-208ENST00000495490 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
TIMM17B-208ENST00000495490 SSH2Q76I76 1423 aa23.87■■□□□ 1.41
TIMM17B-208ENST00000495490 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa23.87■■□□□ 1.41
TIMM17B-208ENST00000495490 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
TIMM17B-208ENST00000495490 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.87■■□□□ 1.41
TIMM17B-208ENST00000495490 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.86■■□□□ 1.41
TIMM17B-208ENST00000495490 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
TIMM17B-208ENST00000495490 STAC3Q96MF2 364 aa23.85■■□□□ 1.41
TIMM17B-208ENST00000495490 NRKQ7Z2Y5 1582 aa23.85■■□□□ 1.41
TIMM17B-208ENST00000495490 LMO7Q8WWI1 1683 aa23.85■■□□□ 1.41
TIMM17B-208ENST00000495490 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa23.85■■□□□ 1.41
TIMM17B-208ENST00000495490 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.84■■□□□ 1.41
TIMM17B-208ENST00000495490 USP35Q9P2H5 1018 aa23.84■■□□□ 1.41
TIMM17B-208ENST00000495490 NUTM2GQ5VZR2 741 aa23.83■■□□□ 1.41
TIMM17B-208ENST00000495490 PDE3BQ13370 1112 aa23.81■■□□□ 1.4
TIMM17B-208ENST00000495490 ACEP12821 1306 aa23.81■■□□□ 1.4
TIMM17B-208ENST00000495490 CPDO75976 1380 aa23.8■■□□□ 1.4
TIMM17B-208ENST00000495490 EVA1CP58658 441 aa23.8■■□□□ 1.4
TIMM17B-208ENST00000495490 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.8■■□□□ 1.4
TIMM17B-208ENST00000495490 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
TIMM17B-208ENST00000495490 CDK19Q9BWU1 502 aa23.8■■□□□ 1.4
TIMM17B-208ENST00000495490 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
TIMM17B-208ENST00000495490 TCP11L2Q8N4U5 519 aa23.79■■□□□ 1.4
TIMM17B-208ENST00000495490 USP19O94966 1318 aa23.79■■□□□ 1.4
TIMM17B-208ENST00000495490 PLEKHG3A1L390 1219 aa23.78■■□□□ 1.4
TIMM17B-208ENST00000495490 CCDC61Q9Y6R9 512 aa23.78■■□□□ 1.4
TIMM17B-208ENST00000495490 NBPF14Q5TI25 921 aa23.77■■□□□ 1.4
TIMM17B-208ENST00000495490 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
TIMM17B-208ENST00000495490 ABTB2Q8N961 1025 aa23.75■■□□□ 1.39
TIMM17B-208ENST00000495490 PEAK1Q9H792 1746 aa23.75■■□□□ 1.39
TIMM17B-208ENST00000495490 SBF2Q86WG5 1849 aa23.75■■□□□ 1.39
TIMM17B-208ENST00000495490 YY1P25490 414 aa23.74■■□□□ 1.39
TIMM17B-208ENST00000495490 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
TIMM17B-208ENST00000495490 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.73■■□□□ 1.39
TIMM17B-208ENST00000495490 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
TIMM17B-208ENST00000495490 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa23.73■■□□□ 1.39
TIMM17B-208ENST00000495490 SPON1Q9HCB6 807 aa23.71■■□□□ 1.39
TIMM17B-208ENST00000495490 KCNQ2O43526 872 aa23.7■■□□□ 1.38
TIMM17B-208ENST00000495490 GCP02774 474 aa23.7■■□□□ 1.38
TIMM17B-208ENST00000495490 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
TIMM17B-208ENST00000495490 NLRP13Q86W25 1043 aa23.68■■□□□ 1.38
TIMM17B-208ENST00000495490 CRB1P82279 1406 aa23.67■■□□□ 1.38
TIMM17B-208ENST00000495490 NINLQ9Y2I6 1382 aa23.67■■□□□ 1.38
TIMM17B-208ENST00000495490 LRRC37A3O60309 1634 aa23.67■■□□□ 1.38
TIMM17B-208ENST00000495490 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.67■■□□□ 1.38
TIMM17B-208ENST00000495490 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa23.67■■□□□ 1.38
TIMM17B-208ENST00000495490 OVOS2Q6IE36 1432 aa23.67■■□□□ 1.38
TIMM17B-208ENST00000495490 CASZ1Q86V15 1759 aa23.66■■□□□ 1.38
TIMM17B-208ENST00000495490 PLSCR1O15162 318 aa23.65■■□□□ 1.38
TIMM17B-208ENST00000495490 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
TIMM17B-208ENST00000495490 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa23.65■■□□□ 1.38
TIMM17B-208ENST00000495490 COL18A1P39060 1754 aa23.64■■□□□ 1.37
TIMM17B-208ENST00000495490 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
TIMM17B-208ENST00000495490 WNK3Q9BYP7 1800 aa23.63■■□□□ 1.37
TIMM17B-208ENST00000495490 AATKQ6ZMQ8 1374 aa23.63■■□□□ 1.37
TIMM17B-208ENST00000495490 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
TIMM17B-208ENST00000495490 SLIT3O75094 1523 aa23.62■■□□□ 1.37
TIMM17B-208ENST00000495490 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.61■■□□□ 1.37
TIMM17B-208ENST00000495490 PTF1AQ7RTS3 328 aa23.6■■□□□ 1.37
TIMM17B-208ENST00000495490 USP6P35125 1406 aa23.59■■□□□ 1.37
TIMM17B-208ENST00000495490 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
TIMM17B-208ENST00000495490 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
TIMM17B-208ENST00000495490 CABP2Q9NPB3 220 aa23.59■■□□□ 1.37
TIMM17B-208ENST00000495490 BCL9O00512 1426 aa23.59■■□□□ 1.37
TIMM17B-208ENST00000495490 DDB1Q16531 1140 aa23.58■■□□□ 1.37
TIMM17B-208ENST00000495490 AKAP12Q02952 1782 aa23.57■■□□□ 1.36
TIMM17B-208ENST00000495490 UTRNP46939 3433 aa23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms