RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP32.84■■■□□ 2.85
TRDMT1-211ENST00000495022 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa32.83■■■□□ 2.85
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP32.83■■■□□ 2.85
TRDMT1-211ENST00000495022 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP32.8■■■□□ 2.84
TRDMT1-211ENST00000495022 ZRANB1Q9UGI0 708 aa32.8■■■□□ 2.84
TRDMT1-211ENST00000495022 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP32.77■■■□□ 2.84
TRDMT1-211ENST00000495022 BTG4Q9NY30 223 aa32.77■■■□□ 2.84
TRDMT1-211ENST00000495022 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP32.75■■■□□ 2.83
TRDMT1-211ENST00000495022 CDK19Q9BWU1 502 aa32.75■■■□□ 2.83
TRDMT1-211ENST00000495022 KRT27Q7Z3Y8 459 aa32.74■■■□□ 2.83
TRDMT1-211ENST00000495022 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP32.73■■■□□ 2.83
TRDMT1-211ENST00000495022 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP32.69■■■□□ 2.82
TRDMT1-211ENST00000495022 PRDM11Q9NQV5 511 aa32.69■■■□□ 2.82
TRDMT1-211ENST00000495022 CCDC61Q9Y6R9 512 aa32.69■■■□□ 2.82
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP32.68■■■□□ 2.82
TRDMT1-211ENST00000495022 NBPF1Q3BBV0 1214 aa32.68■■■□□ 2.82
TRDMT1-211ENST00000495022 A0A0G2JS52 829 aa32.67■■■□□ 2.82
TRDMT1-211ENST00000495022 MYT1Q01538 1121 aa32.67■■■□□ 2.82
TRDMT1-211ENST00000495022 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa32.67■■■□□ 2.82
TRDMT1-211ENST00000495022 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa32.67■■■□□ 2.82
TRDMT1-211ENST00000495022 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa32.67■■■□□ 2.82
TRDMT1-211ENST00000495022 ACEP12821 1306 aa32.66■■■□□ 2.82
TRDMT1-211ENST00000495022 QRICH2Q9H0J4 1663 aa32.65■■■□□ 2.82
TRDMT1-211ENST00000495022 PLEKHG3A1L390 1219 aa32.65■■■□□ 2.82
TRDMT1-211ENST00000495022 NBPF8Q3BBV2 869 aa32.64■■■□□ 2.82
TRDMT1-211ENST00000495022 KIAA0232Q92628 1395 aa32.64■■■□□ 2.82
TRDMT1-211ENST00000495022 DEFB132Q7Z7B7 95 aa32.63■■■□□ 2.81
TRDMT1-211ENST00000495022 RGPD1P0DJD0 1748 aa32.62■■■□□ 2.81
TRDMT1-211ENST00000495022 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP32.6■■■□□ 2.81
TRDMT1-211ENST00000495022 NRKQ7Z2Y5 1582 aa32.6■■■□□ 2.81
TRDMT1-211ENST00000495022 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa32.56■■■□□ 2.8
TRDMT1-211ENST00000495022 NUTM2GQ5VZR2 741 aa32.56■■■□□ 2.8
TRDMT1-211ENST00000495022 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa32.55■■■□□ 2.8
TRDMT1-211ENST00000495022 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP32.55■■■□□ 2.8
TRDMT1-211ENST00000495022 CHRNA2Q15822 529 aa32.55■■■□□ 2.8
TRDMT1-211ENST00000495022 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa32.54■■■□□ 2.8
TRDMT1-211ENST00000495022 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP32.54■■■□□ 2.8
TRDMT1-211ENST00000495022 ABTB2Q8N961 1025 aa32.54■■■□□ 2.8
TRDMT1-211ENST00000495022 BAG6P46379 1132 aa32.53■■■□□ 2.8
TRDMT1-211ENST00000495022 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP32.53■■■□□ 2.8
TRDMT1-211ENST00000495022 LMO7Q8WWI1 1683 aa32.52■■■□□ 2.8
TRDMT1-211ENST00000495022 USP19O94966 1318 aa32.52■■■□□ 2.8
TRDMT1-211ENST00000495022 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP32.51■■■□□ 2.8
TRDMT1-211ENST00000495022 CPDO75976 1380 aa32.51■■■□□ 2.79
TRDMT1-211ENST00000495022 L3MBTL2Q969R5 705 aa32.51■■■□□ 2.79
TRDMT1-211ENST00000495022 CABP2Q9NPB3 220 aa32.49■■■□□ 2.79
TRDMT1-211ENST00000495022 STRN4Q9NRL3 753 aa32.49■■■□□ 2.79
TRDMT1-211ENST00000495022 SSH2Q76I76 1423 aa32.48■■■□□ 2.79
TRDMT1-211ENST00000495022 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa32.48■■■□□ 2.79
TRDMT1-211ENST00000495022 NLRP13Q86W25 1043 aa32.46■■■□□ 2.79
TRDMT1-211ENST00000495022 DISP2A7MBM2 1401 aa32.45■■■□□ 2.78
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM182BQ5T319 152 aa32.45■■■□□ 2.78
TRDMT1-211ENST00000495022 EVA1CP58658 441 aa32.44■■■□□ 2.78
TRDMT1-211ENST00000495022 LRP5O75197 1615 aa32.43■■■□□ 2.78
TRDMT1-211ENST00000495022 USP6P35125 1406 aa32.43■■■□□ 2.78
TRDMT1-211ENST00000495022 BARGINQ6ZT62 677 aa32.42■■■□□ 2.78
TRDMT1-211ENST00000495022 GCP02774 474 aa32.41■■■□□ 2.78
TRDMT1-211ENST00000495022 SIN3AQ96ST3 1273 aa32.4■■■□□ 2.78
TRDMT1-211ENST00000495022 CABP1Q9NZU7 370 aa32.4■■■□□ 2.78
TRDMT1-211ENST00000495022 EVC2Q86UK5 1308 aa32.4■■■□□ 2.78
TRDMT1-211ENST00000495022 AKAP12Q02952 1782 aa32.38■■■□□ 2.77
TRDMT1-211ENST00000495022 SLIT3O75094 1523 aa32.38■■■□□ 2.77
TRDMT1-211ENST00000495022 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP32.38■■■□□ 2.77
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM196AQ6ZSG2 479 aa32.38■■■□□ 2.77
TRDMT1-211ENST00000495022 USP35Q9P2H5 1018 aa32.38■■■□□ 2.77
TRDMT1-211ENST00000495022 PIK3C2AO00443 1686 aa32.38■■■□□ 2.77
TRDMT1-211ENST00000495022 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP32.37■■■□□ 2.77
TRDMT1-211ENST00000495022 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP32.37■■■□□ 2.77
TRDMT1-211ENST00000495022 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
TRDMT1-211ENST00000495022 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
TRDMT1-211ENST00000495022 TCP11L2Q8N4U5 519 aa32.35■■■□□ 2.77
TRDMT1-211ENST00000495022 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
TRDMT1-211ENST00000495022 NLRP6P59044 892 aa32.32■■■□□ 2.77
TRDMT1-211ENST00000495022 NEUROD1Q13562 356 aa32.32■■■□□ 2.77
TRDMT1-211ENST00000495022 COL18A1P39060 1754 aa32.31■■■□□ 2.76
TRDMT1-211ENST00000495022 PDE3BQ13370 1112 aa32.31■■■□□ 2.76
TRDMT1-211ENST00000495022 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP32.3■■■□□ 2.76
TRDMT1-211ENST00000495022 TRIM37O94972 964 aa32.3■■■□□ 2.76
TRDMT1-211ENST00000495022 AATKQ6ZMQ8 1374 aa32.3■■■□□ 2.76
TRDMT1-211ENST00000495022 CRB1P82279 1406 aa32.29■■■□□ 2.76
TRDMT1-211ENST00000495022 PARD3Q8TEW0 1356 aa32.28■■■□□ 2.76
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP32.27■■■□□ 2.76
TRDMT1-211ENST00000495022 RREB1Q92766 1687 aa32.26■■■□□ 2.76
TRDMT1-211ENST00000495022 WNK3Q9BYP7 1800 aa32.26■■■□□ 2.75
TRDMT1-211ENST00000495022 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
TRDMT1-211ENST00000495022 CAMKK2Q96RR4 588 aa32.25■■■□□ 2.75
TRDMT1-211ENST00000495022 RGPD5Q99666 1765 aa32.24■■■□□ 2.75
TRDMT1-211ENST00000495022 MON2Q7Z3U7 1717 aa32.23■■■□□ 2.75
TRDMT1-211ENST00000495022 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa32.23■■■□□ 2.75
TRDMT1-211ENST00000495022 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa32.22■■■□□ 2.75
TRDMT1-211ENST00000495022 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
TRDMT1-211ENST00000495022 ZBTB7CA1YPR0 619 aa32.21■■■□□ 2.75
TRDMT1-211ENST00000495022 APBA3O96018 575 aa32.21■■■□□ 2.75
TRDMT1-211ENST00000495022 SBF2Q86WG5 1849 aa32.21■■■□□ 2.75
TRDMT1-211ENST00000495022 LRRC37A3O60309 1634 aa32.21■■■□□ 2.75
TRDMT1-211ENST00000495022 NUP188Q5SRE5 1749 aa32.21■■■□□ 2.75
TRDMT1-211ENST00000495022 TTC21AQ8NDW8 1320 aa32.2■■■□□ 2.75
TRDMT1-211ENST00000495022 PEAK1Q9H792 1746 aa32.2■■■□□ 2.75
TRDMT1-211ENST00000495022 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
TRDMT1-211ENST00000495022 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
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